More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_3767 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0815  TonB-dependent receptor domain-containing protein  90.66 
 
 		 653 aa  1218    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3576  TonB-dependent receptor  95.71 
 
 		 653 aa  1244    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.313951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3176  TonB-dependent siderophore receptor  90.51 
 
 		 653 aa  1228    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3767  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 653 aa  1337    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3559  TonB-dependent receptor  69.05 
 
 		 665 aa  930    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00145171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0729  TonB-dependent receptor, plug  57.23 
 
 		 656 aa  764    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000181168  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3302  TonB-dependent siderophore receptor  90.51 
 
 		 653 aa  1201    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00384842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0651  TonB-dependent siderophore receptor  90.35 
 
 		 653 aa  1202    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.68611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0824  TonB-dependent receptor, plug  61.78 
 
 		 659 aa  803    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2631  TonB-dependent receptor domain-containing protein  56.53 
 
 		 646 aa  723    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.221793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0663  TonB-dependent receptor  92.8 
 
 		 652 aa  1228    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136044  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2990  TonB-dependent receptor  67.47 
 
 		 656 aa  899    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.235083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3644  TonB-dependent receptor  97.09 
 
 		 653 aa  1263    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.388894  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3472  TonB-dependent siderophore receptor  90.2 
 
 		 653 aa  1207    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0503687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4030  TonB-dependent receptor:Lipocalin  27.37 
 
 		 713 aa  208  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4390  TonB-dependent receptor  29.2 
 
 		 704 aa  189  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  28.65 
 
 		 688 aa  174  5e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4681  TonB-dependent receptor  27.72 
 
 		 704 aa  172  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0656736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2309  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  29.17 
 
 		 666 aa  163  8.000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2625  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 657 aa  159  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.980205  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2786  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 		 644 aa  145  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.934768  normal  0.0544871 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0635  TonB-dependent receptor, plug  24.37 
 
 		 706 aa  142  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2666  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 638 aa  139  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0651  tonB-dependent receptor  24.39 
 
 		 656 aa  115  3e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0646495  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0582  TonB-dependent receptor plug  24.96 
 
 		 664 aa  110  8.000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000848459  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  23.66 
 
 		 728 aa  105  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  37.7 
 
 		 618 aa  105  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 700 aa  105  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  24.92 
 
 		 825 aa  104  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  23.22 
 
 		 710 aa  103  8e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 700 aa  103  8e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  24.26 
 
 		 776 aa  103  8e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 700 aa  103  9e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  24.54 
 
 		 700 aa  103  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1767  TonB-dependent siderophore receptor  22.54 
 
 		 748 aa  103  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000312172  normal  0.573538 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1724  TonB-dependent siderophore receptor  22.54 
 
 		 748 aa  103  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000700289  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  24.44 
 
 		 700 aa  103  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5579  TonB-dependent siderophore receptor  26.6 
 
 		 812 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.761851 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  23.42 
 
 		 815 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  24.54 
 
 		 700 aa  102  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  24.54 
 
 		 700 aa  102  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  24.18 
 
 		 825 aa  101  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01528  TonB-dependent receptor  24.27 
 
 		 720 aa  100  7e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2795  TonB-dependent receptor  23.8 
 
 		 701 aa  100  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01408  predicted iron outer membrane transporter  24.4 
 
 		 700 aa  99.4  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1561  TonB-dependent receptor plug  29.94 
 
 		 681 aa  99.4  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000105774  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1968  TonB-dependent heme receptor  23.21 
 
 		 690 aa  99  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  23.83 
 
 		 770 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01419  hypothetical protein  24.4 
 
 		 700 aa  99.4  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  23.83 
 
 		 710 aa  99  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2926  TonB-dependent receptor  23.97 
 
 		 715 aa  98.2  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000198793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1729  TonB-dependent siderophore receptor  22.25 
 
 		 749 aa  98.2  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.775588  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2735  TonB-dependent receptor, plug  27.95 
 
 		 650 aa  97.8  6e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1964  TonB-dependent receptor, plug  30.13 
 
 		 618 aa  97.4  7e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1306  putative iron compound TonB-dependent receptor  24.74 
 
 		 697 aa  97.1  9e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  22.07 
 
 		 715 aa  97.1  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2565  TonB-dependent siderophore receptor  22.19 
 
 		 740 aa  96.7  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000192113  hitchhiker  0.000234826 
 
 
-
 
NC_004310  BR1347  iron compound TonB-dependent receptor, putative  24.74 
 
 		 620 aa  96.3  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001068  vibrioferrin receptor PvuA  23.78 
 
 		 712 aa  95.9  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3613  TonB-dependent siderophore receptor  29.58 
 
 		 789 aa  95.5  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.187378 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0576  TonB-dependent receptor plug  31.44 
 
 		 621 aa  94.7  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  22.25 
 
 		 694 aa  94  9e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3329  TonB-dependent siderophore receptor  21.27 
 
 		 720 aa  93.2  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1474  TonB-dependent siderophore receptor  24.89 
 
 		 715 aa  93.2  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.052337 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3206  TonB-dependent receptor plug  23.64 
 
 		 617 aa  93.2  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00965358  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0509  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  29.49 
 
 		 614 aa  92.4  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.194967  normal  0.193806 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0118  TonB-dependent receptor  23.76 
 
 		 633 aa  92.8  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02166  TonB-dependent outer membrane Receptor  32.93 
 
 		 619 aa  92.4  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3531  TonB-dependent receptor plug  24.91 
 
 		 678 aa  92.4  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0790413  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  21.79 
 
 		 724 aa  92.4  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0654  TonB-dependent receptor  24.56 
 
 		 638 aa  91.7  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.561107  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1080  TonB-dependent siderophore receptor  21.26 
 
 		 720 aa  91.7  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210628 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3465  TonB-dependent siderophore receptor  21.12 
 
 		 720 aa  91.3  5e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.47616  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5364  TonB-dependent receptor plug  32.83 
 
 		 729 aa  91.3  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3287  TonB-dependent siderophore receptor  21.44 
 
 		 720 aa  91.3  5e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1855  TonB-dependent receptor, putative  22.54 
 
 		 693 aa  90.9  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0314757  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  22.75 
 
 		 707 aa  90.9  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  24.38 
 
 		 850 aa  90.9  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1245  TonB-dependent receptor, plug  23.68 
 
 		 636 aa  90.5  8e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0339996 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0947  TonB-dependent siderophore receptor  22.09 
 
 		 683 aa  90.5  8e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0779656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2276  TonB-dependent receptor  41.48 
 
 		 751 aa  90.9  8e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2410  TonB-dependent receptor  22.87 
 
 		 683 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  23.8 
 
 		 689 aa  89.4  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  25.65 
 
 		 628 aa  89.7  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0049  TonB-dependent siderophore receptor  22.87 
 
 		 703 aa  89  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.627674  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1786  TonB-dependent heme receptor  22.04 
 
 		 718 aa  88.6  3e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  24.48 
 
 		 757 aa  88.6  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003321  ferrichrome-iron receptor  24.49 
 
 		 711 aa  88.2  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  21.64 
 
 		 723 aa  88.2  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  23.74 
 
 		 795 aa  87.8  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1156  TonB-dependent receptor  21.9 
 
 		 715 aa  87.4  7e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2881  TonB-dependent siderophore receptor  23.46 
 
 		 714 aa  87.4  7e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3776  TonB-dependent siderophore receptor  21.43 
 
 		 707 aa  87.4  7e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.658574  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0969  outer membrane receptor for transport of vitamin B  35.98 
 
 		 645 aa  87.4  8e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.01117 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0028  TonB-dependent receptor  29.19 
 
 		 641 aa  87.4  8e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  23.03 
 
 		 821 aa  87  9e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1280  TonB-dependent siderophore receptor  22.26 
 
 		 731 aa  87  9e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0800812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1537  TonB-dependent receptor  37.11 
 
 		 593 aa  87  9e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00891985  normal  0.735799 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0273  TonB-dependent receptor  32.98 
 
 		 602 aa  87  9e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0292443  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0461  TonB-dependent vitamin B12 receptor  35.5 
 
 		 613 aa  86.7  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00224002  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>