More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1115 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1519  TonB-dependent receptor  55.99 
 
 
657 aa  711    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.148558  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1064  TonB-dependent receptor  60.69 
 
 
661 aa  799    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00188221  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1142  TonB-dependent receptor-related protein  58.62 
 
 
650 aa  784    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.22175  normal  0.0805488 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1014  TonB-dependent receptor-related protein  57.98 
 
 
647 aa  781    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1262  TonB-dependent receptor  63.59 
 
 
651 aa  862    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.612585  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1115  TonB-dependent receptor  100 
 
 
649 aa  1327    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.95294  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1266  TonB-dependent receptor  36.19 
 
 
679 aa  363  7.0000000000000005e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0152296  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2744  TonB-dependent receptor  35.13 
 
 
701 aa  321  1.9999999999999998e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1231  TonB-dependent receptor  33.59 
 
 
678 aa  295  1e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5752  TonB-dependent receptor  33.87 
 
 
746 aa  223  7e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0523831  hitchhiker  0.0000000000276247 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0028  TonB-dependent receptor  28.85 
 
 
641 aa  211  3e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1274  TonB-dependent receptor plug  27.7 
 
 
861 aa  167  8e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 
634 aa  166  2.0000000000000002e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1321  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 
724 aa  163  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1023  TonB-dependent receptor plug  25.83 
 
 
769 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.302797  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  26.93 
 
 
639 aa  154  4e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1826  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 
621 aa  152  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.568285  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5364  TonB-dependent receptor plug  24.32 
 
 
729 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  25.88 
 
 
646 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  26.28 
 
 
634 aa  136  9.999999999999999e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 
681 aa  130  9.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1926  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 
627 aa  127  5e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.201933  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0123  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.23 
 
 
631 aa  125  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000105264  normal  0.11479 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  24.74 
 
 
698 aa  125  3e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3783  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  23.75 
 
 
615 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000781057  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3738  TonB-dependent receptor  24.89 
 
 
665 aa  122  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  0.0543439 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6080  putative TonB-dependent receptor  25.83 
 
 
690 aa  122  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341343  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1301  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 
634 aa  122  3e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0790  TonB-dependent receptor  25.94 
 
 
614 aa  120  6e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.270148  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  27.13 
 
 
628 aa  120  6e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  23.78 
 
 
656 aa  120  7.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  24.92 
 
 
633 aa  118  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1001  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 
628 aa  118  3.9999999999999997e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.11298  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1096  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 
626 aa  117  6e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2648  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 
602 aa  117  6e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  27.69 
 
 
638 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2621  TonB-dependent receptor, plug  24.49 
 
 
695 aa  116  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07860  TonB-dependent vitamin B12 receptor  26.99 
 
 
630 aa  116  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.239557  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4073  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.81 
 
 
630 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000943492  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2219  TonB-dependent receptor  24.73 
 
 
692 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5052  TonB-dependent receptor  24.13 
 
 
726 aa  116  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0923716  normal  0.422268 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3189  TonB-dependent receptor, plug  27.12 
 
 
623 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0142  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.81 
 
 
630 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000593825  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2815  TonB-dependent receptor  24.06 
 
 
619 aa  116  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.186668  normal  0.478128 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1561  TonB-dependent receptor plug  24.66 
 
 
681 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000105774  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4341  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  23.19 
 
 
614 aa  115  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139999  normal  0.582372 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4372  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  23.19 
 
 
614 aa  115  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0258695  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4536  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  23.19 
 
 
614 aa  115  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.329693  hitchhiker  0.0000000267555 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0654  TonB-dependent receptor  25.08 
 
 
638 aa  115  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.561107  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  28.21 
 
 
1023 aa  114  4.0000000000000004e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4462  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  23.19 
 
 
614 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0180001  hitchhiker  0.0000000000824718 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4459  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  23.19 
 
 
614 aa  114  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0519388  hitchhiker  0.0000109547 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  25.43 
 
 
659 aa  114  7.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2550  TonB-dependent receptor plug  25.4 
 
 
775 aa  113  9e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.182788  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  25.26 
 
 
663 aa  113  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  25.26 
 
 
663 aa  113  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3338  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25 
 
 
696 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000719833  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1012  TonB-dependent receptor  25.76 
 
 
626 aa  113  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  25.26 
 
 
663 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  25.26 
 
 
663 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0812  TonB-dependent receptor plug  25.52 
 
 
659 aa  112  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.183722  normal  0.24775 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4507  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.39 
 
 
614 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000315572  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  25.26 
 
 
663 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  25.26 
 
 
663 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4200  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.39 
 
 
614 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000101627  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  24.37 
 
 
613 aa  111  3e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2970  TonB-dependent receptor protein  25.97 
 
 
651 aa  112  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.140883  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  26.42 
 
 
641 aa  111  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.010442 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4020  TonB-dependent vitamin B12 receptor  24.17 
 
 
614 aa  111  5e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348064  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4050  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.17 
 
 
614 aa  111  5e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00780594  decreased coverage  0.000540594 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5430  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.03 
 
 
614 aa  111  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0043717  normal  0.0207602 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1537  TonB-dependent receptor  24.42 
 
 
593 aa  110  9.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00891985  normal  0.735799 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1004  TonB-dependent receptor  27.93 
 
 
618 aa  110  9.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0684927  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4413  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.17 
 
 
614 aa  109  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000903793  hitchhiker  0.00898611 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0571  TonB-dependent receptor plug  25.75 
 
 
628 aa  109  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.487741  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  25.68 
 
 
652 aa  109  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03647  TonB-dependent receptor  23.27 
 
 
640 aa  108  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00288042  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02166  TonB-dependent outer membrane Receptor  25.11 
 
 
619 aa  109  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  24.6 
 
 
650 aa  108  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2789  TonB-dependent receptor  24.73 
 
 
698 aa  108  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.973502 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2686  TonB-dependent receptor plug  24.88 
 
 
650 aa  108  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.262602  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0519  heme transport protein HutA  24.53 
 
 
698 aa  108  4e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47800  putative tonB-dependent receptor  26.94 
 
 
616 aa  107  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173562  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0952  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.21 
 
 
696 aa  107  6e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000391517  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0681  outer membrane receptor FepA  23.11 
 
 
751 aa  107  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.757968  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0638  outer membrane receptor FepA  22.97 
 
 
751 aa  106  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  24.43 
 
 
650 aa  106  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0250  TonB-dependent receptor plug  26.68 
 
 
597 aa  107  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  24.43 
 
 
650 aa  106  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  24.16 
 
 
650 aa  106  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0743  outer membrane receptor FepA  23.11 
 
 
751 aa  106  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.100086  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0697  outer membrane receptor FepA  22.97 
 
 
751 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4004  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.39 
 
 
681 aa  106  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.371484 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4020  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  23.17 
 
 
615 aa  105  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000194494  normal  0.015002 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  24.25 
 
 
650 aa  106  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1186  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 
634 aa  105  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.874956  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1021  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.21 
 
 
696 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000037848  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1054  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.21 
 
 
696 aa  106  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000147815  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0624  outer membrane receptor FepA  22.97 
 
 
751 aa  106  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0578  TonB-dependent receptor plug  26.96 
 
 
627 aa  105  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>