More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6535 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6535  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 694 aa  1408    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.822423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0249  TonB-dependent receptor  41.94 
 
 		 688 aa  503  1e-141  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1088  TonB-dependent receptor  40.62 
 
 		 679 aa  484  1e-135  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7217  TonB-dependent receptor  35.64 
 
 		 707 aa  361  3e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 653 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 		 634 aa  149  1.0000000000000001e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  25.07 
 
 		 633 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1797  TonB-dependent receptor plug  26.88 
 
 		 647 aa  149  3e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  26.3 
 
 		 639 aa  146  1e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  26.17 
 
 		 635 aa  144  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  27.48 
 
 		 656 aa  137  5e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 		 613 aa  135  1.9999999999999998e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01534  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  25.04 
 
 		 647 aa  133  1.0000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1005  TonB-dependent receptor  23.76 
 
 		 699 aa  131  3e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.828736  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1559  TonB-dependent receptor plug  24.2 
 
 		 706 aa  131  4.0000000000000003e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000264695  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1928  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 		 676 aa  124  8e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00435524  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1486  TonB-dependent receptor, plug  24.56 
 
 		 677 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.243313  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1691  TonB-dependent receptor, plug  27.73 
 
 		 732 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524758  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0653  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 		 675 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4281  hypothetical protein  29.34 
 
 		 700 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  25.84 
 
 		 653 aa  118  3e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2276  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 751 aa  116  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0654  TonB-dependent receptor  25.83 
 
 		 638 aa  114  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.561107  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1552  TonB-dependent receptor HmuR  26.87 
 
 		 646 aa  113  1.0000000000000001e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  24.17 
 
 		 634 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  25.2 
 
 		 655 aa  113  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  26.89 
 
 		 652 aa  112  3e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37010  outer membrane receptor FepA  25.79 
 
 		 757 aa  111  4.0000000000000004e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0110447  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3962  TonB-dependent receptor  25.7 
 
 		 698 aa  111  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  26.18 
 
 		 680 aa  110  7.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6730  TonB-dependent receptor  24.45 
 
 		 733 aa  109  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.23656 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2748  putative outer membrane receptor  25.6 
 
 		 665 aa  108  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1541  putative outer membrane receptor  25.6 
 
 		 665 aa  108  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2666  putative outer membrane receptor  25.6 
 
 		 665 aa  108  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6723  TonB-dependent receptor  42.06 
 
 		 1128 aa  107  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0203  TonB-dependent receptor, plug  23.68 
 
 		 700 aa  107  6e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.583502  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  23.69 
 
 		 646 aa  107  9e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1004  TonB-dependent receptor  23.83 
 
 		 618 aa  106  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0684927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01120  iron-regulated outer membrane virulence protein  24.43 
 
 		 572 aa  107  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3294  TonB-dependent receptor, plug  24.92 
 
 		 676 aa  107  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2290  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 800 aa  105  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000569019 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2030  TonB-dependent receptor, plug  25.87 
 
 		 668 aa  105  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5052  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 		 726 aa  105  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0923716  normal  0.422268 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1115  TonB-dependent receptor  24.87 
 
 		 705 aa  104  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2818  TonB-dependent receptor, plug  24.86 
 
 		 691 aa  104  6e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5364  TonB-dependent receptor plug  30.51 
 
 		 729 aa  103  8e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  43.24 
 
 		 656 aa  102  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1925  TonB-dependent receptor  25.04 
 
 		 642 aa  101  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55144  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2789  TonB-dependent receptor  24.54 
 
 		 698 aa  101  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.973502 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0123  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  26.38 
 
 		 631 aa  99.4  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000105264  normal  0.11479 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2648  TonB-dependent receptor  25.08 
 
 		 602 aa  99  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2046  TonB-dependent receptor  22.84 
 
 		 713 aa  99.4  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183904 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3128  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  24.03 
 
 		 695 aa  98.6  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4161  TonB-dependent receptor  23.82 
 
 		 799 aa  98.2  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2092  TonB-dependent receptor  24.95 
 
 		 670 aa  98.6  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  43.41 
 
 		 663 aa  98.2  5e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  43.41 
 
 		 663 aa  98.2  5e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  43.41 
 
 		 663 aa  98.2  5e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  43.41 
 
 		 663 aa  98.2  5e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  43.41 
 
 		 659 aa  98.2  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  43.41 
 
 		 663 aa  98.2  5e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  43.41 
 
 		 641 aa  98.2  5e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  43.41 
 
 		 663 aa  97.8  6e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  26.26 
 
 		 638 aa  97.4  8e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1274  TonB-dependent receptor plug  22.43 
 
 		 861 aa  97.4  9e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  24.78 
 
 		 618 aa  97.1  9e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1561  TonB-dependent receptor plug  34.64 
 
 		 681 aa  96.7  1e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000105774  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  23.4 
 
 		 702 aa  97.1  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  26.6 
 
 		 1023 aa  97.1  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3092  TonB-dependent receptor, plug  25.24 
 
 		 726 aa  96.3  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  42.64 
 
 		 650 aa  95.9  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3409  TonB-dependent receptor  24.25 
 
 		 698 aa  96.3  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02166  TonB-dependent outer membrane Receptor  38.79 
 
 		 619 aa  95.9  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3276  TonB-dependent receptor  24.25 
 
 		 698 aa  96.3  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  42.64 
 
 		 650 aa  95.9  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  42.64 
 
 		 650 aa  95.9  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5373  TonB-dependent outer-membrane transporter  37.98 
 
 		 661 aa  95.9  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0456572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  42.64 
 
 		 650 aa  95.9  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2165  TonB-dependent vitamin B12 receptor  24.83 
 
 		 616 aa  95.9  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  42.64 
 
 		 650 aa  95.9  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0938  TonB-dependent receptor  24.25 
 
 		 698 aa  96.3  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00410623  normal  0.440689 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2426  TonB-dependent receptor, plug  25.13 
 
 		 652 aa  95.5  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000164352  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2342  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 611 aa  95.5  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.499314  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4368  TonB-dependent receptor  24.39 
 
 		 799 aa  95.1  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0521  TonB-dependent receptor  24.73 
 
 		 617 aa  94.7  5e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5676  TonB-dependent receptor plug  23.53 
 
 		 662 aa  94.7  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7219  TonB-dependent receptor  23.46 
 
 		 698 aa  94.7  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002470  TonB-dependent receptor  24.46 
 
 		 652 aa  94.4  6e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.337593  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1023  TonB-dependent receptor plug  28.74 
 
 		 769 aa  94.4  7e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.302797  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6129  TonB-dependent receptor plug  24.86 
 
 		 721 aa  94  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4233  TonB-dependent receptor  24.53 
 
 		 799 aa  94  8e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2667  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 627 aa  93.6  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0986558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3496  outer membrane receptor FepA  24.05 
 
 		 744 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1659  TonB-dependent receptor  23.67 
 
 		 714 aa  92.8  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000365717  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1186  TonB-dependent receptor  23.5 
 
 		 634 aa  92.4  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.874956  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4462  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  26.15 
 
 		 614 aa  92.8  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0180001  hitchhiker  0.0000000000824718 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1926  TonB-dependent receptor  24.64 
 
 		 627 aa  92.8  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.201933  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4372  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.92 
 
 		 614 aa  92  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0258695  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4413  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  29.67 
 
 		 614 aa  92.4  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000903793  hitchhiker  0.00898611 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4459  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.22 
 
 		 614 aa  92  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0519388  hitchhiker  0.0000109547 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>