More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1559 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1005  TonB-dependent receptor  54.01 
 
 		 699 aa  746    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.828736  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1559  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 706 aa  1442    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000264695  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1561  TonB-dependent receptor plug  32.95 
 
 		 681 aa  317  5e-85  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000105774  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2276  TonB-dependent receptor  31.23 
 
 		 751 aa  269  2e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1928  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 		 676 aa  215  1.9999999999999998e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00435524  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  27.95 
 
 		 634 aa  210  6e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  27.23 
 
 		 639 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  25.49 
 
 		 633 aa  188  4e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  26.75 
 
 		 613 aa  153  8.999999999999999e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  25.43 
 
 		 640 aa  150  6e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 		 681 aa  145  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002470  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 652 aa  142  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.337593  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3128  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  25.1 
 
 		 695 aa  137  5e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6535  TonB-dependent receptor  24.2 
 
 		 694 aa  131  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.822423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3738  TonB-dependent receptor  23.79 
 
 		 665 aa  127  7e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  0.0543439 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2919  outer membrane receptor FepA  23.58 
 
 		 724 aa  124  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.91274  normal  0.0854265 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2889  outer membrane receptor FepA  23.45 
 
 		 724 aa  123  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1088  TonB-dependent receptor  22.04 
 
 		 679 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2953  outer membrane receptor FepA  23.32 
 
 		 724 aa  121  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.246738  hitchhiker  0.000000000736095 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2972  outer membrane receptor FepA  23.32 
 
 		 724 aa  121  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0370731 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1006  TonB-dependent receptor  25.55 
 
 		 426 aa  114  9e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.711145  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0198  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  23.6 
 
 		 631 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194454  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1631  TonB-dependent receptor, plug  23.93 
 
 		 739 aa  112  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.371565 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  42.54 
 
 		 656 aa  111  5e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1925  TonB-dependent receptor  23.77 
 
 		 642 aa  111  5e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55144  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0192  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  23.74 
 
 		 631 aa  111  5e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.051851  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1977  sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein CysA 2 (Sulfate-transporting ATPase 2)  42.07 
 
 		 326 aa  111  5e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  39.61 
 
 		 663 aa  110  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  39.61 
 
 		 663 aa  110  7.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  39.61 
 
 		 663 aa  110  7.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  39.61 
 
 		 663 aa  110  7.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  42.54 
 
 		 641 aa  110  7.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  39.61 
 
 		 659 aa  110  7.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  39.61 
 
 		 663 aa  110  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  38.75 
 
 		 657 aa  110  7.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  39.61 
 
 		 663 aa  110  7.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37010  outer membrane receptor FepA  24.4 
 
 		 757 aa  110  7.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0110447  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  38.75 
 
 		 648 aa  110  8.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  40 
 
 		 650 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2840  TonB-dependent siderophore receptor  25.36 
 
 		 849 aa  109  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000068938  normal  0.338102 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  40 
 
 		 650 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  40 
 
 		 650 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  40 
 
 		 650 aa  109  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  21.54 
 
 		 618 aa  109  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  40 
 
 		 650 aa  109  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2400  outer membrane receptor protein  23.88 
 
 		 621 aa  108  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.901841 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7217  TonB-dependent receptor  24.08 
 
 		 707 aa  107  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  22.98 
 
 		 634 aa  105  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3757  TonB-dependent receptor plug  36.36 
 
 		 612 aa  104  6e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4462  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  22.92 
 
 		 614 aa  103  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0180001  hitchhiker  0.0000000000824718 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0122  TonB-dependent receptor  30.96 
 
 		 624 aa  102  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47800  putative tonB-dependent receptor  23.2 
 
 		 616 aa  103  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2412  TonB-dependent receptor  36.88 
 
 		 662 aa  102  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.115111  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1806  TonB-dependent receptor  35.8 
 
 		 649 aa  102  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1803  ribosome-binding factor A  40.7 
 
 		 656 aa  102  3e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1096  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 626 aa  101  5e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2341  TonB-dependent receptor  23.45 
 
 		 764 aa  100  6e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  36.36 
 
 		 617 aa  101  6e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2686  TonB-dependent receptor plug  41.79 
 
 		 650 aa  100  8e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.262602  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1012  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 626 aa  100  8e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2171  TonB-dependent receptor  35.71 
 
 		 649 aa  100  8e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  34.46 
 
 		 649 aa  100  8e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1935  TonB-dependent receptor  36.25 
 
 		 662 aa  100  9e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00717608  normal  0.914131 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1826  TonB-dependent receptor  33.86 
 
 		 661 aa  100  9e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0922924  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2423  TonB-dependent receptor  36.25 
 
 		 662 aa  100  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075703  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4372  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  22.56 
 
 		 614 aa  99.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0258695  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1673  receptor, putative  22.74 
 
 		 639 aa  99.4  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.193509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  25.3 
 
 		 652 aa  99.8  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02166  TonB-dependent outer membrane Receptor  35.26 
 
 		 619 aa  99  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  25.2 
 
 		 698 aa  99  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2531  TonB-dependent receptor  35.67 
 
 		 680 aa  99.4  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00261  phosphatidylglycerophosphatase  33.33 
 
 		 617 aa  99  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1861  TonB-dependent receptor  28.48 
 
 		 653 aa  99  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0473101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4029  TonB-dependent receptor  24.41 
 
 		 719 aa  98.2  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0834  vitamin B12 receptor BtuB, putative  23.17 
 
 		 680 aa  98.2  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.162621  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1541  putative outer membrane receptor  27.92 
 
 		 665 aa  97.8  6e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4161  TonB-dependent receptor  35.08 
 
 		 799 aa  97.8  6e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2666  putative outer membrane receptor  27.92 
 
 		 665 aa  97.8  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2748  putative outer membrane receptor  27.92 
 
 		 665 aa  97.8  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4536  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  22.56 
 
 		 614 aa  97.4  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.329693  hitchhiker  0.0000000267555 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4459  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  22.56 
 
 		 614 aa  97.8  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0519388  hitchhiker  0.0000109547 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1639  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  23.34 
 
 		 685 aa  97.4  8e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.18341  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2959  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  23.34 
 
 		 685 aa  97.4  8e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  33.48 
 
 		 666 aa  97.4  8e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  33.48 
 
 		 666 aa  97.4  8e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  33.48 
 
 		 666 aa  97.4  8e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2327  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  23.34 
 
 		 685 aa  97.4  8e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.52571  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  33.48 
 
 		 666 aa  97.1  9e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4341  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  30.69 
 
 		 614 aa  96.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139999  normal  0.582372 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  27.41 
 
 		 653 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  39.84 
 
 		 628 aa  97.1  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  33.04 
 
 		 666 aa  96.7  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2667  TonB-dependent receptor  23.24 
 
 		 627 aa  96.3  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0986558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2648  TonB-dependent receptor  37.27 
 
 		 602 aa  96.3  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4368  TonB-dependent receptor  34.38 
 
 		 799 aa  95.9  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4233  TonB-dependent receptor  34.38 
 
 		 799 aa  95.1  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3089  TonB-dependent receptor  24.22 
 
 		 758 aa  95.1  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.329983  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1028  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  23.17 
 
 		 685 aa  95.1  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1035  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  23.17 
 
 		 685 aa  94.7  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127064  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4413  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  34.23 
 
 		 614 aa  94.7  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000903793  hitchhiker  0.00898611 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>