More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_4029 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_4029  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 719 aa  1466    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0778  TonB-dependent receptor  37.17 
 
 		 742 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3675  TonB-dependent receptor  38.21 
 
 		 737 aa  414  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0831004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1237  TonB-dependent receptor  33.92 
 
 		 736 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0492  TonB-dependent receptor  35.41 
 
 		 762 aa  388  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2077  TonB-dependent receptor  34.69 
 
 		 742 aa  371  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2341  TonB-dependent receptor  30.3 
 
 		 764 aa  306  7e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0909  TonB-dependent siderophore receptor  27.44 
 
 		 794 aa  193  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.794253 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4626  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 804 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22062  normal  0.899276 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1245  TonB-dependent receptor  25.94 
 
 		 761 aa  180  8e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384236  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4136  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 772 aa  177  5e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.163344  normal  0.377911 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4248  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 772 aa  177  5e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1598  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 		 778 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0220938  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0870  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 784 aa  173  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2388  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 788 aa  172  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1000  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 778 aa  171  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05316  putative ferrisiderophore receptor protein  27.01 
 
 		 779 aa  172  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.469557  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0477  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 778 aa  171  3e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.642633  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2630  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 778 aa  171  3e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0146  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 778 aa  171  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.580852  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2999  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 		 778 aa  171  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4118  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 		 788 aa  171  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00057818  normal  0.54154 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4774  TonB-dependent receptor  26.41 
 
 		 760 aa  171  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594782  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3037  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 778 aa  170  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000978239  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2935  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 778 aa  169  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0458457  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0532  hypothetical protein  26.23 
 
 		 790 aa  167  5e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.203812  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1010  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 		 790 aa  167  5e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0114301  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0970  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 786 aa  167  5e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.108903  normal  0.157986 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0882  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 		 784 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.72079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2380  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 782 aa  149  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.397663  normal  0.960991 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1838  TonB-dependent receptor  24.86 
 
 		 796 aa  142  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  26.82 
 
 		 639 aa  138  4e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0041  putative TonB-dependent siderophore receptor  28.54 
 
 		 821 aa  136  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.130227 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 		 702 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0676  TonB-dependent receptor  24.42 
 
 		 732 aa  124  4e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.218893  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5364  TonB-dependent receptor plug  23.94 
 
 		 729 aa  121  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2926  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 715 aa  121  3.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000198793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  24.57 
 
 		 665 aa  120  6e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4255  TonB-dependent receptor  28.27 
 
 		 720 aa  118  5e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0969  outer membrane receptor for transport of vitamin B  24.61 
 
 		 645 aa  114  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.01117 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1826  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 		 661 aa  114  7.000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0922924  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  24 
 
 		 652 aa  114  8.000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2412  TonB-dependent receptor  25.34 
 
 		 662 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.115111  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3189  TonB-dependent receptor, plug  25.51 
 
 		 623 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1839  outer membrane receptor FepA  22.7 
 
 		 703 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.228059  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1861  TonB-dependent receptor  25.21 
 
 		 653 aa  112  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0473101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  24.67 
 
 		 653 aa  111  4.0000000000000004e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0806  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 743 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  24.93 
 
 		 646 aa  111  5e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2531  TonB-dependent receptor  25.34 
 
 		 680 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  25.51 
 
 		 634 aa  110  9.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  24.73 
 
 		 709 aa  109  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2423  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 662 aa  110  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075703  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0635  TonB-dependent receptor  23.61 
 
 		 874 aa  109  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1450  outer membrane receptor FepA  21.52 
 
 		 740 aa  109  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  31.56 
 
 		 728 aa  108  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5052  TonB-dependent receptor  24.12 
 
 		 726 aa  108  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0923716  normal  0.422268 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3206  TonB-dependent receptor plug  23.86 
 
 		 617 aa  107  8e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00965358  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0772  TonB-dependent receptor plug  26.87 
 
 		 800 aa  106  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578903 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1935  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 		 662 aa  106  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00717608  normal  0.914131 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  23.32 
 
 		 655 aa  106  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3496  outer membrane receptor FepA  23.74 
 
 		 744 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1870  outer membrane receptor FepA  23.48 
 
 		 744 aa  105  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1806  TonB-dependent receptor  24.96 
 
 		 649 aa  105  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3128  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  23.71 
 
 		 695 aa  105  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2171  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 		 649 aa  104  7e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2242  outer membrane receptor FepA  23.08 
 
 		 744 aa  103  8e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.620188 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2686  TonB-dependent receptor plug  25.44 
 
 		 650 aa  103  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.262602  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  22.95 
 
 		 680 aa  102  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2433  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 754 aa  101  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.747625 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3409  TonB-dependent receptor  23.98 
 
 		 698 aa  101  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3276  TonB-dependent receptor  23.98 
 
 		 698 aa  101  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0938  TonB-dependent receptor  23.98 
 
 		 698 aa  101  6e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00410623  normal  0.440689 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2301  TonB-dependent receptor  23.33 
 
 		 706 aa  100  7e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3738  TonB-dependent receptor  24.04 
 
 		 665 aa  100  9e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  0.0543439 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  30.34 
 
 		 706 aa  100  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  24.79 
 
 		 648 aa  99.4  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  30.06 
 
 		 721 aa  99.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  30.06 
 
 		 706 aa  99  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  30.06 
 
 		 706 aa  98.6  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  30.06 
 
 		 706 aa  99  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1559  TonB-dependent receptor plug  24.41 
 
 		 706 aa  98.2  4e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000264695  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1005  TonB-dependent receptor  22.89 
 
 		 699 aa  97.8  5e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.828736  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02166  TonB-dependent outer membrane Receptor  36.42 
 
 		 619 aa  97.8  7e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  28.73 
 
 		 700 aa  97.4  8e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  28.73 
 
 		 700 aa  97.4  8e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  28.73 
 
 		 700 aa  97.4  8e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  28.73 
 
 		 700 aa  97.1  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  28.73 
 
 		 700 aa  96.7  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4579  outer membrane receptor FepA  23.85 
 
 		 742 aa  97.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1412  TonB-dependent receptor  27.89 
 
 		 399 aa  97.1  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158027  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  28.73 
 
 		 700 aa  96.3  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1659  TonB-dependent receptor  23.13 
 
 		 714 aa  95.5  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000365717  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1648  ferric receptor CfrA  22.16 
 
 		 696 aa  95.9  3e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1522  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3052  TonB-dependent receptor plug  23.36 
 
 		 753 aa  95.1  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  28.45 
 
 		 700 aa  94.7  5e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5752  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 746 aa  94.7  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0523831  hitchhiker  0.0000000000276247 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01408  predicted iron outer membrane transporter  28.45 
 
 		 700 aa  94.4  6e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01419  hypothetical protein  28.45 
 
 		 700 aa  94.4  6e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2882  TonB-dependent receptor protein  28.99 
 
 		 780 aa  93.2  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00344491  hitchhiker  0.00617905 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>