295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1412 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1412  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 399 aa  748    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158027  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4255  TonB-dependent receptor  58.25 
 
 		 720 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2433  TonB-dependent receptor  32.36 
 
 		 754 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.747625 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0772  TonB-dependent receptor plug  34.31 
 
 		 800 aa  162  9e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578903 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2885  TonB-dependent receptor  35.01 
 
 		 673 aa  147  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.159782 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5132  TonB-dependent receptor  33.52 
 
 		 682 aa  124  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1375  TonB-dependent receptor  34.08 
 
 		 681 aa  117  5e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1273  TonB-dependent receptor  31.96 
 
 		 665 aa  107  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.227492  normal  0.0101206 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2077  TonB-dependent receptor  27.95 
 
 		 742 aa  102  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1662  TonB-dependent receptor  32.9 
 
 		 686 aa  100  4e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.917445  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4029  TonB-dependent receptor  28.17 
 
 		 719 aa  99.8  8e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2341  TonB-dependent receptor  26.64 
 
 		 764 aa  89.7  7e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3675  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 737 aa  89.4  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0831004  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05316  putative ferrisiderophore receptor protein  30.3 
 
 		 779 aa  89  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.469557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0492  TonB-dependent receptor  26.06 
 
 		 762 aa  86.3  9e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0778  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 		 742 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3189  TonB-dependent receptor, plug  33.2 
 
 		 623 aa  85.9  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4136  TonB-dependent receptor  29.19 
 
 		 772 aa  84  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.163344  normal  0.377911 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4248  TonB-dependent receptor  29.19 
 
 		 772 aa  84  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2648  TonB-dependent receptor  36.28 
 
 		 602 aa  81.6  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1237  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 736 aa  80.5  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1004  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 618 aa  78.6  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0684927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3462  TonB-dependent receptor  38.52 
 
 		 668 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  23.65 
 
 		 634 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1186  TonB-dependent receptor  33.63 
 
 		 634 aa  73.6  0.000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.874956  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1838  TonB-dependent receptor  25.4 
 
 		 796 aa  73.2  0.000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0444  TonB-dependent receptor  28.5 
 
 		 667 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0676  TonB-dependent receptor  23.51 
 
 		 732 aa  72  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.218893  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2310  TonB-dependent receptor  27.82 
 
 		 815 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1260  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 581 aa  70.9  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0256  ferric siderophore receptor  26.12 
 
 		 807 aa  69.3  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.027165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  27.82 
 
 		 836 aa  68.9  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3048  TonB-dependent receptor  28.72 
 
 		 774 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.20503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3545  TonB-dependent receptor  36.48 
 
 		 666 aa  67.8  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3613  TonB-dependent receptor plug  36.07 
 
 		 664 aa  67.4  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659898  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  23.33 
 
 		 613 aa  67.4  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1968  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 		 828 aa  67.4  0.0000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1191  TonB-dependent receptor  29.9 
 
 		 744 aa  67  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.601925 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0687  TonB-dependent receptor  30.86 
 
 		 772 aa  65.5  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0865  TonB-dependent receptor  27.83 
 
 		 700 aa  65.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0848071  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1339  TonB-dependent receptor  24.12 
 
 		 714 aa  65.5  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.368228 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2204  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 845 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 688 aa  65.1  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2188  TonB-dependent receptor  32.6 
 
 		 680 aa  64.3  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2380  TonB-dependent receptor  23.45 
 
 		 782 aa  64.7  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.397663  normal  0.960991 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4774  TonB-dependent receptor  29.49 
 
 		 760 aa  64.3  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594782  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  28.33 
 
 		 688 aa  63.9  0.000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0870  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 		 784 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2153  TonB-dependent receptor  24.8 
 
 		 828 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.453581  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0882  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 		 784 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.72079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4225  TonB-dependent siderophore receptor  30 
 
 		 689 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0279  TonB-dependent receptor  22.87 
 
 		 730 aa  61.2  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.874959  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4483  TonB-dependent receptor  28.29 
 
 		 737 aa  60.8  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.00000231942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5501  TonB-dependent receptor  28.41 
 
 		 731 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3697  TonB-dependent receptor  27.91 
 
 		 731 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.850493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6079  putative TonB-dependent receptor  28.1 
 
 		 680 aa  58.9  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0972806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1278  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 571 aa  59.3  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.354768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2815  TonB-dependent receptor  30.08 
 
 		 619 aa  58.2  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.186668  normal  0.478128 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2735  TonB-dependent receptor  23.53 
 
 		 641 aa  57.8  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00964506  normal  0.0993289 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3572  TonB-dependent receptor plug  34.93 
 
 		 653 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.102808  normal  0.0129675 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1125  TonB-dependent receptor  29.6 
 
 		 709 aa  57.8  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1651  TonB-dependent receptor  23.58 
 
 		 648 aa  57.4  0.0000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613844 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3149  TonB-dependent receptor  26.17 
 
 		 776 aa  57  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0958639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0909  TonB-dependent siderophore receptor  24.81 
 
 		 794 aa  57  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.794253 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07860  TonB-dependent vitamin B12 receptor  30.48 
 
 		 630 aa  57  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.239557  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4372  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.36 
 
 		 614 aa  57  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0258695  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6723  TonB-dependent receptor  28.73 
 
 		 1128 aa  57  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4462  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.36 
 
 		 614 aa  57  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0180001  hitchhiker  0.0000000000824718 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4626  TonB-dependent receptor  24.4 
 
 		 804 aa  57  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22062  normal  0.899276 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4341  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.36 
 
 		 614 aa  56.6  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139999  normal  0.582372 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4118  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 788 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00057818  normal  0.54154 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4459  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.36 
 
 		 614 aa  56.6  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0519388  hitchhiker  0.0000109547 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1925  TonB-dependent receptor  24.45 
 
 		 642 aa  56.2  0.0000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55144  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4536  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.36 
 
 		 614 aa  56.2  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.329693  hitchhiker  0.0000000267555 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0790  TonB-dependent receptor  29.15 
 
 		 614 aa  56.2  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.270148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4382  TonB-dependent receptor  27.9 
 
 		 635 aa  56.2  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.429499  normal  0.246253 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  22.57 
 
 		 656 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0336  TonB-dependent receptor  34.25 
 
 		 649 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1110  TonB-dependent receptor  25.33 
 
 		 625 aa  56.2  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000459108  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0471  TonB-dependent receptor, putative, degenerate  21.65 
 
 		 704 aa  55.8  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1493  putative TonB-dependent receptor  20.78 
 
 		 697 aa  55.5  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.404893  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1044  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  29.62 
 
 		 726 aa  55.1  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3037  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 778 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000978239  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2704  TonB-dependent receptor  28.81 
 
 		 700 aa  55.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2935  TonB-dependent receptor  28.33 
 
 		 778 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0458457  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1261  ferric receptor CfrA  23.48 
 
 		 702 aa  55.1  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0896  TonB-dependent receptor  25.72 
 
 		 775 aa  55.1  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2999  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 778 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6321  TonB-dependent receptor plug  32.58 
 
 		 732 aa  54.7  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5008  TonB-dependent receptor  28.64 
 
 		 627 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.877838 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1598  TonB-dependent receptor  28.23 
 
 		 778 aa  54.7  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0220938  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1206  putative TonB-dependent receptor  23 
 
 		 688 aa  54.3  0.000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1368  TonB-dependent receptor  28.87 
 
 		 627 aa  54.7  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.249969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5341  TonB-dependent receptor  23.81 
 
 		 657 aa  54.3  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0185  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  23.9 
 
 		 728 aa  54.3  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848528 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4347  TonB-dependent receptor  27.72 
 
 		 795 aa  53.9  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5676  TonB-dependent receptor plug  22.36 
 
 		 662 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3112  TonB-dependent receptor  28.93 
 
 		 687 aa  53.9  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.589119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0231  TonB-dependent siderophore receptor  23.78 
 
 		 771 aa  53.9  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1648  ferric receptor CfrA  27.38 
 
 		 696 aa  53.9  0.000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1522  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>