More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1206 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1206  putative TonB-dependent receptor  100 
 
 		 688 aa  1394    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2550  TonB-dependent receptor plug  32.69 
 
 		 775 aa  333  9e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.182788  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  25.25 
 
 		 698 aa  171  5e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0185  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  24.58 
 
 		 728 aa  131  4.0000000000000003e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848528 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1266  TonB-dependent receptor  23.39 
 
 		 679 aa  128  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0152296  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  24.83 
 
 		 653 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 635 aa  120  6e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1804  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 		 683 aa  115  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0894155  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1519  TonB-dependent receptor  25.25 
 
 		 657 aa  114  8.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.148558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1142  TonB-dependent receptor-related protein  24.05 
 
 		 650 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.22175  normal  0.0805488 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1014  TonB-dependent receptor-related protein  24.82 
 
 		 647 aa  110  7.000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4004  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.12 
 
 		 681 aa  110  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.371484 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000158  TonB-dependent heme and hemoglobin receptor HutA  23.78 
 
 		 693 aa  108  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00497898  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0519  heme transport protein HutA  24.2 
 
 		 698 aa  108  4e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1054  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.37 
 
 		 696 aa  107  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000147815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3338  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.49 
 
 		 696 aa  107  7e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000719833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0952  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.35 
 
 		 696 aa  107  7e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000391517  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1021  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.21 
 
 		 696 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000037848  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3669  heme transport protein  24.72 
 
 		 697 aa  105  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  25.45 
 
 		 663 aa  103  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  24.88 
 
 		 663 aa  103  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0966  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.31 
 
 		 696 aa  103  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.942987  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1115  TonB-dependent receptor  23.58 
 
 		 649 aa  102  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.95294  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  23.2 
 
 		 655 aa  100  9e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3235  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.06 
 
 		 695 aa  100  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000386167  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1284  TonB-dependent outer membrane heme receptor  23.22 
 
 		 857 aa  97.8  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00261  phosphatidylglycerophosphatase  24.15 
 
 		 617 aa  96.7  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  24.55 
 
 		 666 aa  96.3  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3327  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.43 
 
 		 688 aa  95.5  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0926253  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  22.78 
 
 		 702 aa  94.7  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  23.68 
 
 		 652 aa  94.7  5e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3730  TonB-dependent receptor  36.62 
 
 		 637 aa  94.7  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0159073  normal  0.0113192 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  24.39 
 
 		 666 aa  94.4  7e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  24.39 
 
 		 666 aa  94.4  7e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  24.39 
 
 		 666 aa  94  9e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2929  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  21.53 
 
 		 755 aa  93.2  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.56728  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1537  TonB-dependent receptor  31.49 
 
 		 593 aa  93.2  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00891985  normal  0.735799 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0509  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  29.88 
 
 		 614 aa  92.8  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.194967  normal  0.193806 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1262  TonB-dependent receptor  22.68 
 
 		 651 aa  91.7  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.612585  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1559  TonB-dependent receptor plug  39.61 
 
 		 706 aa  91.7  4e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000264695  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1023  TonB-dependent receptor plug  22.91 
 
 		 769 aa  91.3  6e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.302797  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  36.55 
 
 		 656 aa  91.3  6e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1064  TonB-dependent receptor  22.8 
 
 		 661 aa  90.9  7e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00188221  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1231  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 678 aa  90.9  8e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4773  TonB-dependent receptor  31.4 
 
 		 624 aa  89.7  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.386912  normal  0.53176 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  34.42 
 
 		 663 aa  89.4  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  34.42 
 
 		 663 aa  89.4  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  34.42 
 
 		 663 aa  89.4  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  34.42 
 
 		 663 aa  89.4  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  34.42 
 
 		 663 aa  89.4  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  34.42 
 
 		 659 aa  89.4  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  34.42 
 
 		 663 aa  89.4  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1096  TonB-dependent receptor  29.79 
 
 		 626 aa  89  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1274  TonB-dependent receptor plug  23.19 
 
 		 861 aa  88.6  4e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02166  TonB-dependent outer membrane Receptor  37.09 
 
 		 619 aa  88.2  5e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  23.82 
 
 		 618 aa  87.8  5e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1691  TonB-dependent receptor, plug  23.02 
 
 		 732 aa  87.8  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524758  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4218  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  23.86 
 
 		 862 aa  87.8  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1012  TonB-dependent receptor  29.36 
 
 		 626 aa  87  9e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  35.85 
 
 		 1023 aa  87  9e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1110  TonB-dependent receptor domain-containing protein  21.04 
 
 		 716 aa  86.7  0.000000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0721  Outer membrane cobalamin receptor protein-like  25.54 
 
 		 640 aa  87  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1493  putative TonB-dependent receptor  32.34 
 
 		 697 aa  86.3  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.404893  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4030  TonB-dependent receptor:Lipocalin  22.89 
 
 		 713 aa  85.9  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  36 
 
 		 650 aa  86.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  36 
 
 		 650 aa  86.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5290  TonB-dependent receptor plug  21.73 
 
 		 673 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2845  putative TonB-dependent receptor  28.38 
 
 		 715 aa  86.3  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.328029 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  36 
 
 		 650 aa  86.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1797  TonB-dependent receptor plug  32.61 
 
 		 647 aa  85.9  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  36 
 
 		 650 aa  86.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  36 
 
 		 650 aa  86.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2982  TonB dependent receptor, putative  21.92 
 
 		 699 aa  85.5  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  37.21 
 
 		 641 aa  85.5  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2547  TonB-dependent receptor plug  29.53 
 
 		 615 aa  85.5  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792273  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5364  TonB-dependent receptor plug  23.86 
 
 		 729 aa  85.5  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01762  hypothetical protein  24.69 
 
 		 714 aa  85.5  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  33.14 
 
 		 656 aa  85.1  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0084  TonB-dependent receptor, plug  22.25 
 
 		 671 aa  85.1  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0859  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  29.28 
 
 		 676 aa  84.7  0.000000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32697  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0525  B12 family TonB-dependent receptor  24.65 
 
 		 641 aa  84.3  0.000000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  31.71 
 
 		 681 aa  84.3  0.000000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1502  TonB-dependent receptor  36.81 
 
 		 613 aa  83.6  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1977  sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein CysA 2 (Sulfate-transporting ATPase 2)  35.8 
 
 		 326 aa  83.2  0.00000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1518  TonB-dependent receptor plug  29.19 
 
 		 727 aa  82.4  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2751  TonB-dependent receptor plug  28.83 
 
 		 722 aa  82.8  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.930878  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06011  hypothetical protein  24.57 
 
 		 713 aa  82.4  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  32.45 
 
 		 617 aa  82.4  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4020  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  34.19 
 
 		 615 aa  82.4  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000194494  normal  0.015002 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1803  ribosome-binding factor A  35.37 
 
 		 656 aa  82  0.00000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0578  TonB-dependent receptor plug  36.23 
 
 		 627 aa  81.6  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0560  TonB-dependent receptor, plug  34.18 
 
 		 623 aa  81.3  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4281  hypothetical protein  34.12 
 
 		 700 aa  81.3  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  34.57 
 
 		 665 aa  80.5  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  31.71 
 
 		 653 aa  80.9  0.00000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4341  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  32.86 
 
 		 614 aa  80.9  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139999  normal  0.582372 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4462  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  32.86 
 
 		 614 aa  80.5  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0180001  hitchhiker  0.0000000000824718 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0122  TonB-dependent receptor  36.57 
 
 		 624 aa  80.5  0.00000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4536  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  32.86 
 
 		 614 aa  80.5  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.329693  hitchhiker  0.0000000267555 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4372  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  32.86 
 
 		 614 aa  80.5  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0258695  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>