More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2077 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2077  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 742 aa  1510    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3675  TonB-dependent receptor  44.86 
 
 		 737 aa  624  1e-177  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0831004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0778  TonB-dependent receptor  44.64 
 
 		 742 aa  621  1e-176  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0492  TonB-dependent receptor  45.49 
 
 		 762 aa  605  1.0000000000000001e-171  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1237  TonB-dependent receptor  40.37 
 
 		 736 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4029  TonB-dependent receptor  34.83 
 
 		 719 aa  375  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2341  TonB-dependent receptor  32.13 
 
 		 764 aa  335  2e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1245  TonB-dependent receptor  26.4 
 
 		 761 aa  207  6e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384236  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4136  TonB-dependent receptor  27.32 
 
 		 772 aa  181  5.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.163344  normal  0.377911 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4248  TonB-dependent receptor  27.32 
 
 		 772 aa  181  5.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05316  putative ferrisiderophore receptor protein  26.51 
 
 		 779 aa  179  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.469557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0870  TonB-dependent receptor  26.82 
 
 		 784 aa  172  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0909  TonB-dependent siderophore receptor  26.14 
 
 		 794 aa  170  7e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.794253 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0882  TonB-dependent receptor  26.68 
 
 		 784 aa  169  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.72079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4118  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 788 aa  167  8e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00057818  normal  0.54154 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0532  hypothetical protein  26.41 
 
 		 790 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.203812  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1010  TonB-dependent receptor  26.41 
 
 		 790 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0114301  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0970  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 		 786 aa  163  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.108903  normal  0.157986 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4626  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 804 aa  160  6e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22062  normal  0.899276 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0477  TonB-dependent receptor  25.89 
 
 		 778 aa  159  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.642633  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2388  TonB-dependent receptor  26.68 
 
 		 788 aa  159  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0146  TonB-dependent receptor  25.89 
 
 		 778 aa  159  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.580852  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2630  TonB-dependent receptor  25.89 
 
 		 778 aa  159  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1000  TonB-dependent receptor  25.89 
 
 		 778 aa  159  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2999  TonB-dependent receptor  25.89 
 
 		 778 aa  158  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2935  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 		 778 aa  155  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0458457  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3037  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 		 778 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000978239  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1838  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 796 aa  150  6e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1598  TonB-dependent receptor  25.29 
 
 		 778 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0220938  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2882  TonB-dependent receptor protein  24.34 
 
 		 780 aa  144  4e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00344491  hitchhiker  0.00617905 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2380  TonB-dependent receptor  23.51 
 
 		 782 aa  144  8e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.397663  normal  0.960991 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4774  TonB-dependent receptor  24.53 
 
 		 760 aa  139  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594782  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0041  putative TonB-dependent siderophore receptor  25.8 
 
 		 821 aa  137  9e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.130227 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2092  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 670 aa  130  7.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1472  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 683 aa  124  6e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.907424  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5373  TonB-dependent outer-membrane transporter  23.62 
 
 		 661 aa  117  8.999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0456572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0488  TonB-dependent receptor  25.62 
 
 		 682 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4255  TonB-dependent receptor  27.46 
 
 		 720 aa  113  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1261  ferric receptor CfrA  22.51 
 
 		 702 aa  112  3e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 		 613 aa  107  6e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2666  putative outer membrane receptor  24.67 
 
 		 665 aa  106  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1541  putative outer membrane receptor  24.67 
 
 		 665 aa  106  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2748  putative outer membrane receptor  24.67 
 
 		 665 aa  107  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3189  TonB-dependent receptor, plug  35.14 
 
 		 623 aa  105  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  37.02 
 
 		 634 aa  105  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1412  TonB-dependent receptor  27.95 
 
 		 399 aa  103  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158027  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0469  iron-regulated outer membrane virulence protein, TonB receptor CfrA  22.28 
 
 		 698 aa  102  2e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.442515  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1803  ribosome-binding factor A  41.28 
 
 		 656 aa  102  4e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0635  TonB-dependent receptor  27.63 
 
 		 874 aa  100  7e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0668  TonB-dependent receptor  23.47 
 
 		 757 aa  100  1e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.217902 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  38.06 
 
 		 646 aa  99.8  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1269  TonB-dependent receptor  31.35 
 
 		 710 aa  98.2  5e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0256  ferric siderophore receptor  26.17 
 
 		 807 aa  95.5  3e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.027165  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  37.42 
 
 		 638 aa  95.1  4e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1648  ferric receptor CfrA  23.22 
 
 		 696 aa  94.4  7e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1522  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0185  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  38.36 
 
 		 728 aa  94.4  7e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848528 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1005  TonB-dependent receptor  23.47 
 
 		 699 aa  93.6  1e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.828736  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1522  TonB-dependent receptor  24.15 
 
 		 701 aa  93.6  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0250  TonB-dependent receptor plug  39.74 
 
 		 597 aa  92.8  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2153  TonB-dependent receptor  28.81 
 
 		 828 aa  92.4  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.453581  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0938  TonB-dependent receptor  24.52 
 
 		 698 aa  91.7  4e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00410623  normal  0.440689 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3276  TonB-dependent receptor  24.52 
 
 		 698 aa  91.7  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3409  TonB-dependent receptor  24.52 
 
 		 698 aa  91.7  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  27.32 
 
 		 663 aa  91.3  6e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1925  TonB-dependent receptor  37.01 
 
 		 642 aa  90.9  7e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55144  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3738  TonB-dependent receptor  38.46 
 
 		 665 aa  91.3  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  0.0543439 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  37.35 
 
 		 634 aa  90.9  7e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  26.43 
 
 		 666 aa  90.9  8e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  29.35 
 
 		 1023 aa  90.5  9e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0132  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  33.7 
 
 		 631 aa  90.5  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00107286  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2952  putative lipoprotein  23.11 
 
 		 710 aa  90.1  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130559  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 836 aa  90.1  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2885  TonB-dependent receptor  25.66 
 
 		 673 aa  90.5  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.159782 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1506  TonB-dependent receptor  38.35 
 
 		 707 aa  89.7  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3783  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  32.95 
 
 		 615 aa  89.7  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000781057  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  32.72 
 
 		 633 aa  89.7  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0198  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  34.66 
 
 		 631 aa  89.4  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194454  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3790  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  36.36 
 
 		 716 aa  89.7  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.11789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  29.19 
 
 		 655 aa  89.7  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  26.3 
 
 		 663 aa  89  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  31.13 
 
 		 653 aa  88.6  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2046  TonB-dependent receptor  36.75 
 
 		 713 aa  88.6  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183904 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01534  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  32.85 
 
 		 647 aa  88.2  5e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  25.73 
 
 		 666 aa  87.4  9e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0192  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  33.52 
 
 		 631 aa  87  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.051851  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  25.73 
 
 		 666 aa  87  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  25.73 
 
 		 666 aa  87  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  26.69 
 
 		 666 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  27.57 
 
 		 686 aa  86.3  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0471  TonB-dependent receptor, putative, degenerate  31.43 
 
 		 704 aa  86.3  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0121  TonB-dependent receptor plug  23.97 
 
 		 760 aa  85.5  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4770  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  33.73 
 
 		 623 aa  85.5  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000262019  normal  0.0314633 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3097  TonB-dependent receptor, plug  37.5 
 
 		 671 aa  85.5  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1493  putative TonB-dependent receptor  32 
 
 		 697 aa  85.1  0.000000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.404893  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2941  TonB-dependent receptor  23.45 
 
 		 701 aa  85.1  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.80569  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1559  TonB-dependent receptor plug  24.43 
 
 		 706 aa  85.1  0.000000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000264695  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  32.93 
 
 		 663 aa  84.7  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2970  TonB-dependent receptor protein  33.53 
 
 		 651 aa  85.1  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.140883  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  32.93 
 
 		 663 aa  84.7  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  32.93 
 
 		 663 aa  84.7  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>