257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1662 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1662  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 686 aa  1354    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.917445  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5132  TonB-dependent receptor  56.81 
 
 		 682 aa  646    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2885  TonB-dependent receptor  40.82 
 
 		 673 aa  397  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.159782 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1375  TonB-dependent receptor  41.72 
 
 		 681 aa  323  7e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1273  TonB-dependent receptor  34.94 
 
 		 665 aa  270  1e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.227492  normal  0.0101206 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4255  TonB-dependent receptor  32.26 
 
 		 720 aa  176  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2433  TonB-dependent receptor  26.59 
 
 		 754 aa  169  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.747625 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0772  TonB-dependent receptor plug  29.26 
 
 		 800 aa  107  8e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578903 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4029  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 719 aa  102  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1412  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 399 aa  96.3  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158027  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1659  TonB-dependent receptor  22.89 
 
 		 714 aa  80.9  0.00000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000365717  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3128  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  22.09 
 
 		 695 aa  78.6  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  25.38 
 
 		 653 aa  78.2  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1237  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 		 736 aa  75.9  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1005  TonB-dependent receptor  20.46 
 
 		 699 aa  74.3  0.000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.828736  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  22.27 
 
 		 702 aa  74.3  0.000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3675  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 737 aa  73.9  0.000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0831004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1245  TonB-dependent receptor  26.59 
 
 		 761 aa  73.2  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384236  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  24.34 
 
 		 635 aa  72.4  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0676  TonB-dependent receptor  26.55 
 
 		 732 aa  72  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.218893  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  21.49 
 
 		 639 aa  70.9  0.00000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3409  TonB-dependent receptor  22.55 
 
 		 698 aa  69.3  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3276  TonB-dependent receptor  22.55 
 
 		 698 aa  69.3  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0938  TonB-dependent receptor  22.55 
 
 		 698 aa  69.3  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00410623  normal  0.440689 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  24.07 
 
 		 634 aa  69.3  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2077  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 742 aa  69.7  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4626  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 		 804 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22062  normal  0.899276 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  23.68 
 
 		 648 aa  68.2  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0909  TonB-dependent siderophore receptor  26.25 
 
 		 794 aa  67.4  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.794253 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0778  TonB-dependent receptor  23.93 
 
 		 742 aa  66.6  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5752  TonB-dependent receptor  32.72 
 
 		 746 aa  67  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0523831  hitchhiker  0.0000000000276247 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1357  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  22.19 
 
 		 696 aa  65.9  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0456407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0899  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  21.89 
 
 		 696 aa  65.1  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0882  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 784 aa  63.9  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.72079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02625  TonB-dependent receptor  31.32 
 
 		 836 aa  63.5  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.107636  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0870  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 784 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0084  TonB-dependent receptor, plug  23.84 
 
 		 671 aa  62.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0492  TonB-dependent receptor  24.54 
 
 		 762 aa  62.8  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_003296  RS05316  putative ferrisiderophore receptor protein  27.08 
 
 		 779 aa  62  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.469557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1278  TonB-dependent receptor  23.2 
 
 		 571 aa  61.6  0.00000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.354768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0645  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  30.41 
 
 		 750 aa  60.1  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0446508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4136  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 772 aa  60.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.163344  normal  0.377911 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2047  TonB-dependent siderophore receptor  25.89 
 
 		 716 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.977961 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2341  TonB-dependent receptor  23.94 
 
 		 764 aa  60.1  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2550  TonB-dependent receptor plug  24.74 
 
 		 775 aa  60.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.182788  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4248  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 772 aa  60.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01120  iron-regulated outer membrane virulence protein  28.42 
 
 		 572 aa  58.9  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0041  putative TonB-dependent siderophore receptor  23.75 
 
 		 821 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.130227 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2289  TonB-dependent receptor plug  24.41 
 
 		 719 aa  58.5  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.652188 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  20.96 
 
 		 613 aa  58.5  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4772  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  26.64 
 
 		 769 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.784759  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2547  TonB-dependent receptor plug  22.97 
 
 		 615 aa  58.2  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792273  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1006  TonB-dependent siderophore receptor  26.11 
 
 		 726 aa  58.2  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4118  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 788 aa  57.8  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00057818  normal  0.54154 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0532  hypothetical protein  25.7 
 
 		 790 aa  57.8  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.203812  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1010  TonB-dependent receptor  25.7 
 
 		 790 aa  57.8  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0114301  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0855  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.65 
 
 		 714 aa  57.4  0.0000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.842782 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3318  TonB-dependent siderophore receptor  26.95 
 
 		 710 aa  57  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0970  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 786 aa  57  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.108903  normal  0.157986 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2308  TonB-dependent siderophore receptor  29.05 
 
 		 693 aa  56.6  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00270239  normal  0.034674 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  25.11 
 
 		 640 aa  56.2  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4510  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  28.44 
 
 		 867 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1297  TonB-dependent siderophore receptor  29.17 
 
 		 721 aa  55.5  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3895  TonB-dependent siderophore receptor  25.07 
 
 		 753 aa  55.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495237  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1004  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 618 aa  55.5  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0684927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  22.42 
 
 		 653 aa  55.1  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0519  heme transport protein HutA  21.72 
 
 		 698 aa  55.1  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2526  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 620 aa  55.5  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.995023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3042  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 841 aa  54.7  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0940  TonB-dependent receptor  24.34 
 
 		 780 aa  54.7  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2388  TonB-dependent receptor  24.81 
 
 		 788 aa  54.7  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5807  ferric citrate outer membrane transporter  28.75 
 
 		 717 aa  54.3  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0535  hypothetical protein  28.57 
 
 		 730 aa  54.3  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0192  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.48 
 
 		 631 aa  54.3  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.051851  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1691  TonB-dependent receptor, plug  25.4 
 
 		 732 aa  53.9  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524758  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0198  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.48 
 
 		 631 aa  53.9  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194454  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1329  TonB-dependent siderophore receptor  27.71 
 
 		 701 aa  53.9  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.267924 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0558  TonB-dependent receptor plug  21.95 
 
 		 817 aa  53.5  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000727933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1589  TonB-dependent receptor  28.9 
 
 		 998 aa  53.1  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.36828  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2724  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 709 aa  53.5  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.424768 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05640  hypothetical protein  29.29 
 
 		 730 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3097  TonB-dependent receptor, plug  24.66 
 
 		 671 aa  53.5  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4866  TonB-dependent receptor  27.81 
 
 		 731 aa  53.1  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  23.65 
 
 		 836 aa  52.8  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1598  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 		 778 aa  53.1  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0220938  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0604  TonB-dependent outer membrane receptor  19.06 
 
 		 682 aa  53.1  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1186  TonB-dependent receptor  24.89 
 
 		 634 aa  52.8  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.874956  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1629  TonB-dependent receptor  22.99 
 
 		 718 aa  53.1  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00166049  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0123  TonB-dependent receptor plug  25.22 
 
 		 670 aa  52.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0182279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0866  TonB-dependent siderophore receptor  28.36 
 
 		 696 aa  53.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.86038  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1347  TonB-dependent siderophore receptor  28.36 
 
 		 696 aa  53.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122487  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1861  TonB-dependent receptor  25.62 
 
 		 653 aa  52.4  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0473101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  22.16 
 
 		 657 aa  52.4  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4368  TonB-dependent receptor  23.28 
 
 		 799 aa  52.4  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4774  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 		 760 aa  52  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594782  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4004  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  28.05 
 
 		 681 aa  51.6  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.371484 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3272  TonB-dependent siderophore receptor  25.2 
 
 		 750 aa  51.6  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.46801  normal  0.424622 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  24.6 
 
 		 732 aa  51.6  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0221  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  26.77 
 
 		 755 aa  51.2  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2153  TonB-dependent receptor  24.53 
 
 		 828 aa  51.2  0.00006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.453581  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>