More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1245 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1245  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 761 aa  1568    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384236  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4626  TonB-dependent receptor  37.95 
 
 		 804 aa  444  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22062  normal  0.899276 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0909  TonB-dependent siderophore receptor  37.21 
 
 		 794 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.794253 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0870  TonB-dependent receptor  36.91 
 
 		 784 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4136  TonB-dependent receptor  37.08 
 
 		 772 aa  436  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.163344  normal  0.377911 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2935  TonB-dependent receptor  36.24 
 
 		 778 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0458457  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2999  TonB-dependent receptor  36.03 
 
 		 778 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4248  TonB-dependent receptor  37.08 
 
 		 772 aa  436  1e-121  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0477  TonB-dependent receptor  36.24 
 
 		 778 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.642633  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1000  TonB-dependent receptor  36.24 
 
 		 778 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3037  TonB-dependent receptor  36.11 
 
 		 778 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000978239  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0146  TonB-dependent receptor  36.24 
 
 		 778 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.580852  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0882  TonB-dependent receptor  36.77 
 
 		 784 aa  434  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.72079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2630  TonB-dependent receptor  36.24 
 
 		 778 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4118  TonB-dependent receptor  36.77 
 
 		 788 aa  431  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00057818  normal  0.54154 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0970  TonB-dependent receptor  36.23 
 
 		 786 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.108903  normal  0.157986 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0532  hypothetical protein  36.09 
 
 		 790 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.203812  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1010  TonB-dependent receptor  36.09 
 
 		 790 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0114301  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05316  putative ferrisiderophore receptor protein  37.52 
 
 		 779 aa  423  1e-117  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.469557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1598  TonB-dependent receptor  36.45 
 
 		 778 aa  425  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0220938  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2388  TonB-dependent receptor  36.54 
 
 		 788 aa  409  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0041  putative TonB-dependent siderophore receptor  34.43 
 
 		 821 aa  392  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.130227 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4774  TonB-dependent receptor  32.24 
 
 		 760 aa  369  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594782  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2882  TonB-dependent receptor protein  30.66 
 
 		 780 aa  355  2e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00344491  hitchhiker  0.00617905 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1838  TonB-dependent receptor  32.49 
 
 		 796 aa  354  4e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0635  TonB-dependent receptor  29.23 
 
 		 874 aa  313  1e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2380  TonB-dependent receptor  29.6 
 
 		 782 aa  311  2.9999999999999997e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.397663  normal  0.960991 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1629  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 		 718 aa  279  2e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00166049  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3675  TonB-dependent receptor  29.77 
 
 		 737 aa  244  3.9999999999999997e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0831004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0778  TonB-dependent receptor  28.66 
 
 		 742 aa  237  5.0000000000000005e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1237  TonB-dependent receptor  28.37 
 
 		 736 aa  228  3e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0492  TonB-dependent receptor  26.41 
 
 		 762 aa  216  9.999999999999999e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2077  TonB-dependent receptor  26.68 
 
 		 742 aa  210  1e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2341  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 764 aa  205  3e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4029  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 		 719 aa  186  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  22.57 
 
 		 702 aa  100  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  22.59 
 
 		 649 aa  98.6  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 836 aa  95.1  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2153  TonB-dependent receptor  21.79 
 
 		 828 aa  89.7  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.453581  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 613 aa  89.4  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1968  TonB-dependent receptor  24.84 
 
 		 828 aa  87  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2310  TonB-dependent receptor  24.28 
 
 		 815 aa  85.5  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2204  TonB-dependent receptor  24.48 
 
 		 845 aa  82.8  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2473  putative TonB-dependent siderophore receptor  26.71 
 
 		 788 aa  81.3  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.805537 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0256  ferric siderophore receptor  25.5 
 
 		 807 aa  80.5  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.027165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5971  TonB-dependent receptor  23.56 
 
 		 801 aa  78.6  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900301  normal  0.0108971 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3128  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  26.35 
 
 		 695 aa  76.3  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3815  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 		 658 aa  74.3  0.000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1631  TonB-dependent receptor, plug  24.43 
 
 		 739 aa  74.3  0.000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.371565 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1662  TonB-dependent receptor  26.59 
 
 		 686 aa  72.8  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.917445  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1269  TonB-dependent receptor  22.6 
 
 		 710 aa  72.4  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  26.73 
 
 		 653 aa  72.4  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1716  outer membrane receptor FepA  22.71 
 
 		 746 aa  72  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4317  TonB-dependent siderophore receptor  24.19 
 
 		 760 aa  70.9  0.00000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00531839 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5156  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 777 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3243  TonB-dependent receptor  23.92 
 
 		 777 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00716389  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5125  TonB-dependent receptor  23.92 
 
 		 777 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0904  TonB-dependent siderophore receptor  23.17 
 
 		 768 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551593 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0899  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  26.07 
 
 		 696 aa  70.1  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1357  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  26.07 
 
 		 696 aa  70.1  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0456407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0896  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 775 aa  69.7  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 		 709 aa  68.9  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 635 aa  68.6  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0891  TonB-dependent siderophore receptor  23.2 
 
 		 763 aa  67.8  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.31218 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  23.58 
 
 		 663 aa  67.4  0.0000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0861  TonB-dependent siderophore receptor  23.2 
 
 		 780 aa  67  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  30.52 
 
 		 646 aa  66.2  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4281  hypothetical protein  31.19 
 
 		 700 aa  65.5  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  23.19 
 
 		 681 aa  65.5  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2037  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 821 aa  65.5  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38155  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  23.01 
 
 		 663 aa  65.5  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0806  TonB-dependent receptor  24 
 
 		 743 aa  65.9  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1722  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 767 aa  65.1  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5052  TonB-dependent receptor  23.64 
 
 		 726 aa  64.7  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0923716  normal  0.422268 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0993  TonB-dependent receptor  25.65 
 
 		 735 aa  64.7  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0663099  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1173  TonB-dependent siderophore receptor  25.67 
 
 		 741 aa  64.7  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  31.95 
 
 		 656 aa  64.3  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  23.05 
 
 		 666 aa  64.3  0.000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0798  TonB-dependent siderophore receptor  23.94 
 
 		 773 aa  63.9  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302135 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  24.62 
 
 		 655 aa  63.9  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  24.49 
 
 		 653 aa  63.5  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  25.27 
 
 		 663 aa  63.2  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  25.27 
 
 		 663 aa  63.2  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  25.27 
 
 		 663 aa  63.2  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3496  outer membrane receptor FepA  24.18 
 
 		 744 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  25.27 
 
 		 663 aa  63.2  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  23.05 
 
 		 666 aa  63.2  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  25.27 
 
 		 663 aa  63.2  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  22.47 
 
 		 666 aa  63.2  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  25.27 
 
 		 663 aa  63.2  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  22.15 
 
 		 747 aa  63.2  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  25.27 
 
 		 659 aa  63.2  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  23.05 
 
 		 666 aa  63.2  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  24.7 
 
 		 792 aa  62.8  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1445  TonB-dependent receptor, putative  23.44 
 
 		 593 aa  62.8  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  27.27 
 
 		 656 aa  62.4  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  27.27 
 
 		 641 aa  62.4  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1195  outer membrane receptor FepA  23.98 
 
 		 749 aa  62.4  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0821218  normal  0.246562 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1383  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 702 aa  62.4  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00790883  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1481  TonB-dependent receptor  21.28 
 
 		 674 aa  62.4  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0173398  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>