More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0870 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS05316  putative ferrisiderophore receptor protein  60.95 
 
 		 779 aa  903    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.469557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4136  TonB-dependent receptor  59.84 
 
 		 772 aa  921    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.163344  normal  0.377911 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0477  TonB-dependent receptor  78.89 
 
 		 778 aa  1193    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.642633  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1000  TonB-dependent receptor  78.89 
 
 		 778 aa  1193    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2388  TonB-dependent receptor  88.38 
 
 		 788 aa  1343    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3037  TonB-dependent receptor  78.89 
 
 		 778 aa  1193    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000978239  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2630  TonB-dependent receptor  78.89 
 
 		 778 aa  1193    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4118  TonB-dependent receptor  91.24 
 
 		 788 aa  1389    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00057818  normal  0.54154 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0146  TonB-dependent receptor  78.89 
 
 		 778 aa  1193    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.580852  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1598  TonB-dependent receptor  80.61 
 
 		 778 aa  1200    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0220938  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0909  TonB-dependent siderophore receptor  46.59 
 
 		 794 aa  646    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.794253 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4626  TonB-dependent receptor  49.09 
 
 		 804 aa  664    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22062  normal  0.899276 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2999  TonB-dependent receptor  78.89 
 
 		 778 aa  1191    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0532  hypothetical protein  91.14 
 
 		 790 aa  1384    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.203812  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0970  TonB-dependent receptor  91.22 
 
 		 786 aa  1385    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.108903  normal  0.157986 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0870  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 784 aa  1585    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0882  TonB-dependent receptor  98.85 
 
 		 784 aa  1567    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.72079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2935  TonB-dependent receptor  79.16 
 
 		 778 aa  1196    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0458457  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1010  TonB-dependent receptor  91.14 
 
 		 790 aa  1384    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0114301  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4248  TonB-dependent receptor  59.84 
 
 		 772 aa  921    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4774  TonB-dependent receptor  42.07 
 
 		 760 aa  542  1e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594782  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0041  putative TonB-dependent siderophore receptor  38.5 
 
 		 821 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.130227 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1245  TonB-dependent receptor  36.28 
 
 		 761 aa  443  1e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384236  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1838  TonB-dependent receptor  31.68 
 
 		 796 aa  379  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0635  TonB-dependent receptor  31.99 
 
 		 874 aa  361  2e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2882  TonB-dependent receptor protein  31.92 
 
 		 780 aa  353  8.999999999999999e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00344491  hitchhiker  0.00617905 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2380  TonB-dependent receptor  33.47 
 
 		 782 aa  352  1e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.397663  normal  0.960991 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1629  TonB-dependent receptor  32.5 
 
 		 718 aa  315  1.9999999999999998e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00166049  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0778  TonB-dependent receptor  28.27 
 
 		 742 aa  211  5e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3675  TonB-dependent receptor  28.65 
 
 		 737 aa  197  8.000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0831004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0492  TonB-dependent receptor  25.36 
 
 		 762 aa  192  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1237  TonB-dependent receptor  26.73 
 
 		 736 aa  188  3e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2077  TonB-dependent receptor  26.82 
 
 		 742 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4029  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 719 aa  175  2.9999999999999996e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2341  TonB-dependent receptor  24.8 
 
 		 764 aa  171  5e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 709 aa  89  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4379  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  24.32 
 
 		 861 aa  87  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1105  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor:TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  25.29 
 
 		 859 aa  82.4  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4510  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.16 
 
 		 867 aa  81.3  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  24.43 
 
 		 635 aa  81.3  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  25.31 
 
 		 656 aa  80.9  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1659  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 714 aa  79.3  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000365717  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  24.44 
 
 		 653 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0834  vitamin B12 receptor BtuB, putative  25.13 
 
 		 680 aa  78.6  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.162621  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0938  TonB-dependent receptor  24.71 
 
 		 698 aa  77.4  0.0000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00410623  normal  0.440689 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3276  TonB-dependent receptor  24.71 
 
 		 698 aa  77.4  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3409  TonB-dependent receptor  24.71 
 
 		 698 aa  77.4  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  26.12 
 
 		 792 aa  77.4  0.0000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1485  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 735 aa  77.4  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.22369 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2789  TonB-dependent receptor  23.4 
 
 		 698 aa  77  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.973502 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4347  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 642 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0941  TonB-dependent receptor  23.41 
 
 		 716 aa  75.1  0.000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5855  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 642 aa  75.1  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.699256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3916  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 642 aa  75.1  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4452  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 642 aa  75.1  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47800  putative tonB-dependent receptor  21.93 
 
 		 616 aa  74.3  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2667  TonB-dependent receptor  24.39 
 
 		 627 aa  72.8  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0986558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3886  TonB-dependent receptor  25.88 
 
 		 642 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.322303 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1648  ferric receptor CfrA  22.71 
 
 		 696 aa  72.4  0.00000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1522  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1284  TonB-dependent outer membrane heme receptor  24.48 
 
 		 857 aa  72  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1005  TonB-dependent receptor  21.53 
 
 		 699 aa  72  0.00000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.828736  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0685  vitamin B12 receptor BtuB, putative  24.56 
 
 		 685 aa  71.6  0.00000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.174842  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1187  outer membrane receptor for transport of vitamin B  24.41 
 
 		 821 aa  71.6  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.096047  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1639  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  24.56 
 
 		 685 aa  71.2  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.18341  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2327  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  24.56 
 
 		 685 aa  71.2  0.00000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.52571  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2959  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  24.56 
 
 		 685 aa  71.2  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1826  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.31 
 
 		 718 aa  71.2  0.00000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0529347  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2996  TonB-dependent siderophore receptor  27.19 
 
 		 733 aa  71.2  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.18602  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4173  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 638 aa  70.9  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.422037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1035  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  24.56 
 
 		 685 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127064  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3297  TonB-dependent siderophore receptor  26.76 
 
 		 733 aa  70.9  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14113 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0995  TonB-dependent receptor  22.87 
 
 		 629 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.864049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2089  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor family protein  23.04 
 
 		 767 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.329074  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1028  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  24.56 
 
 		 685 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1115  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor family protein  23.04 
 
 		 767 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3128  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  22.61 
 
 		 695 aa  69.7  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0824  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor family protein  23.04 
 
 		 767 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.359227  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5156  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 777 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5070  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  26.53 
 
 		 762 aa  70.1  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.565094  normal  0.157746 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6317  TonB-dependent siderophore receptor  23.57 
 
 		 701 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585153  normal  0.21494 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2859  TonB-dependent siderophore receptor  27.19 
 
 		 733 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.335633 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0440  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor family protein  22.9 
 
 		 764 aa  68.6  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6494  TonB-dependent siderophore receptor  23.54 
 
 		 701 aa  68.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2209  TonB-dependent receptor  23.64 
 
 		 624 aa  68.9  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6729  TonB-dependent siderophore receptor  23.54 
 
 		 701 aa  68.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1481  TonB-dependent receptor  25.16 
 
 		 674 aa  68.2  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0173398  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2140  ferrichrome receptor precursor protein  29.51 
 
 		 740 aa  68.2  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.262117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1171  TonB-dependent receptor  23.62 
 
 		 697 aa  67.8  0.0000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0469  iron-regulated outer membrane virulence protein, TonB receptor CfrA  20.29 
 
 		 698 aa  67.8  0.0000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.442515  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5315  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  28.97 
 
 		 767 aa  67.8  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0899  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  22.97 
 
 		 696 aa  67.8  0.0000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5971  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 		 801 aa  67.8  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900301  normal  0.0108971 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1357  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  22.97 
 
 		 696 aa  67.8  0.0000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0456407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000158  TonB-dependent heme and hemoglobin receptor HutA  25.15 
 
 		 693 aa  67.4  0.0000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00497898  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3807  TonB-dependent receptor plug  30.06 
 
 		 655 aa  67  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0095  TonB-dependent siderophore receptor  23.84 
 
 		 823 aa  67.4  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3243  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 		 777 aa  67  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00716389  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5125  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 		 777 aa  67  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4838  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  28.97 
 
 		 757 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.982435 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 649 aa  66.6  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>