More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4118 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_2388  TonB-dependent receptor  89.09 
 
 
788 aa  1350    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05316  putative ferrisiderophore receptor protein  61.51 
 
 
779 aa  909    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.469557  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4248  TonB-dependent receptor  60.57 
 
 
772 aa  931    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0477  TonB-dependent receptor  80.36 
 
 
778 aa  1195    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.642633  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2935  TonB-dependent receptor  80.49 
 
 
778 aa  1197    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0458457  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3037  TonB-dependent receptor  80.36 
 
 
778 aa  1194    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000978239  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4118  TonB-dependent receptor  100 
 
 
788 aa  1597    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00057818  normal  0.54154 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4136  TonB-dependent receptor  60.57 
 
 
772 aa  931    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.163344  normal  0.377911 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2999  TonB-dependent receptor  80.36 
 
 
778 aa  1192    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4626  TonB-dependent receptor  48.26 
 
 
804 aa  650    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22062  normal  0.899276 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1598  TonB-dependent receptor  81.02 
 
 
778 aa  1201    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0220938  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0882  TonB-dependent receptor  90.48 
 
 
784 aa  1375    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.72079  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0909  TonB-dependent siderophore receptor  47.19 
 
 
794 aa  647    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.794253 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0532  hypothetical protein  93.42 
 
 
790 aa  1419    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.203812  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0970  TonB-dependent receptor  93.28 
 
 
786 aa  1414    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.108903  normal  0.157986 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0870  TonB-dependent receptor  90.61 
 
 
784 aa  1384    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2630  TonB-dependent receptor  80.36 
 
 
778 aa  1195    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0146  TonB-dependent receptor  80.36 
 
 
778 aa  1195    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.580852  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1010  TonB-dependent receptor  93.42 
 
 
790 aa  1419    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0114301  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1000  TonB-dependent receptor  80.36 
 
 
778 aa  1195    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4774  TonB-dependent receptor  41.99 
 
 
760 aa  543  1e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594782  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0041  putative TonB-dependent siderophore receptor  39.02 
 
 
821 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.130227 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1245  TonB-dependent receptor  35.58 
 
 
761 aa  439  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384236  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1838  TonB-dependent receptor  32.66 
 
 
796 aa  378  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0635  TonB-dependent receptor  32.44 
 
 
874 aa  357  2.9999999999999997e-97  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2882  TonB-dependent receptor protein  32.2 
 
 
780 aa  355  2e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00344491  hitchhiker  0.00617905 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2380  TonB-dependent receptor  34.67 
 
 
782 aa  353  8e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.397663  normal  0.960991 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1629  TonB-dependent receptor  31.55 
 
 
718 aa  304  4.0000000000000003e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00166049  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0778  TonB-dependent receptor  28.25 
 
 
742 aa  211  5e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3675  TonB-dependent receptor  29.05 
 
 
737 aa  197  5.000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0831004  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1237  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 
736 aa  187  8e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0492  TonB-dependent receptor  24.87 
 
 
762 aa  184  6e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4029  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 
719 aa  179  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2077  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 
742 aa  172  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2341  TonB-dependent receptor  26.58 
 
 
764 aa  140  6e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 
709 aa  92.8  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  27.95 
 
 
792 aa  83.6  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1659  TonB-dependent receptor  25.24 
 
 
714 aa  82  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000365717  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4379  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  23.17 
 
 
861 aa  80.9  0.00000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0834  vitamin B12 receptor BtuB, putative  24.8 
 
 
680 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.162621  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1826  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.59 
 
 
718 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0529347  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1115  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor family protein  24.59 
 
 
767 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0824  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor family protein  24.55 
 
 
767 aa  80.1  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.359227  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2089  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor family protein  24.59 
 
 
767 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.329074  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  23.76 
 
 
653 aa  78.6  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0440  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor family protein  24.45 
 
 
764 aa  78.2  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  24.51 
 
 
635 aa  78.6  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47800  putative tonB-dependent receptor  22.24 
 
 
616 aa  77.4  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173562  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0941  TonB-dependent receptor  23.9 
 
 
716 aa  77.4  0.0000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0347  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor family protein  24.31 
 
 
759 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1781  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.31 
 
 
769 aa  77.4  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1648  ferric receptor CfrA  22.49 
 
 
696 aa  76.6  0.000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1522  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0938  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 
698 aa  75.9  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00410623  normal  0.440689 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3276  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 
698 aa  75.9  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3409  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 
698 aa  75.9  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1105  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor:TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  24.65 
 
 
859 aa  75.9  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1485  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 
735 aa  75.9  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.22369 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0781  TonB-dependent receptor  24.06 
 
 
757 aa  75.5  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.877086  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1187  outer membrane receptor for transport of vitamin B  24.48 
 
 
821 aa  74.7  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.096047  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0685  vitamin B12 receptor BtuB, putative  24.48 
 
 
685 aa  73.9  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.174842  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2327  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  24.48 
 
 
685 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.52571  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4347  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 
642 aa  73.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1639  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  24.48 
 
 
685 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.18341  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2959  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  24.48 
 
 
685 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1028  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  24.63 
 
 
685 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  24.2 
 
 
656 aa  73.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5855  TonB-dependent receptor  25.88 
 
 
642 aa  73.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.699256  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3916  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 
642 aa  73.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4452  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 
642 aa  73.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1035  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  24.48 
 
 
685 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127064  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3807  TonB-dependent receptor plug  29.79 
 
 
655 aa  72  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5315  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  29.48 
 
 
767 aa  71.6  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3623  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.64 
 
 
669 aa  71.6  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3128  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  21.64 
 
 
695 aa  70.9  0.00000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5070  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.66 
 
 
762 aa  70.9  0.00000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.565094  normal  0.157746 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1171  TonB-dependent receptor  23.99 
 
 
697 aa  70.9  0.00000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3886  TonB-dependent receptor  25.3 
 
 
642 aa  70.9  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.322303 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  23.28 
 
 
663 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2433  TonB-dependent receptor  25.25 
 
 
754 aa  70.1  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.747625 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2667  TonB-dependent receptor  24.24 
 
 
627 aa  70.5  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0986558  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000158  TonB-dependent heme and hemoglobin receptor HutA  25.81 
 
 
693 aa  70.1  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00497898  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4838  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  29.08 
 
 
757 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.982435 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0995  TonB-dependent receptor  22.81 
 
 
629 aa  69.3  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.864049  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0221  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  29.25 
 
 
755 aa  69.3  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5431  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  29.08 
 
 
755 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.447482  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5431  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  29.08 
 
 
755 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.469015  normal  0.608312 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2789  TonB-dependent receptor  22.89 
 
 
698 aa  68.9  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.973502 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5971  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 
801 aa  68.2  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900301  normal  0.0108971 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4173  TonB-dependent receptor  24.6 
 
 
638 aa  68.6  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.422037  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5156  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 
777 aa  68.2  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1357  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  22.3 
 
 
696 aa  68.2  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0456407  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3531  TonB-dependent siderophore receptor  26.17 
 
 
740 aa  68.2  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.313722  decreased coverage  0.00643483 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0899  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  22.3 
 
 
696 aa  68.2  0.0000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  22.92 
 
 
663 aa  67.8  0.0000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3297  TonB-dependent siderophore receptor  26.42 
 
 
733 aa  67.8  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.14113 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  26.49 
 
 
706 aa  67.4  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  26.49 
 
 
706 aa  67.4  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4588  TonB-dependent siderophore receptor  25.93 
 
 
796 aa  67  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  24.79 
 
 
700 aa  67  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  26.49 
 
 
706 aa  67  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>