More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0635 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0635  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 874 aa  1813    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2882  TonB-dependent receptor protein  34.28 
 
 		 780 aa  452  1e-125  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00344491  hitchhiker  0.00617905 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4118  TonB-dependent receptor  32.44 
 
 		 788 aa  351  3e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00057818  normal  0.54154 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1598  TonB-dependent receptor  32.61 
 
 		 778 aa  349  1e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0220938  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4248  TonB-dependent receptor  32.07 
 
 		 772 aa  347  5e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4136  TonB-dependent receptor  32.07 
 
 		 772 aa  347  5e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.163344  normal  0.377911 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4626  TonB-dependent receptor  33.78 
 
 		 804 aa  347  6e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22062  normal  0.899276 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0532  hypothetical protein  31.76 
 
 		 790 aa  346  1e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.203812  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1010  TonB-dependent receptor  31.76 
 
 		 790 aa  346  1e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0114301  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0870  TonB-dependent receptor  32.66 
 
 		 784 aa  345  2e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0882  TonB-dependent receptor  32.93 
 
 		 784 aa  345  2e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.72079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0970  TonB-dependent receptor  31.63 
 
 		 786 aa  344  4e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.108903  normal  0.157986 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2935  TonB-dependent receptor  32.21 
 
 		 778 aa  342  2e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0458457  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2999  TonB-dependent receptor  32.08 
 
 		 778 aa  342  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05316  putative ferrisiderophore receptor protein  30.79 
 
 		 779 aa  341  4e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.469557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3037  TonB-dependent receptor  32.08 
 
 		 778 aa  340  5.9999999999999996e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000978239  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1000  TonB-dependent receptor  31.94 
 
 		 778 aa  339  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0477  TonB-dependent receptor  31.94 
 
 		 778 aa  339  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.642633  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0146  TonB-dependent receptor  31.94 
 
 		 778 aa  339  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.580852  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2630  TonB-dependent receptor  31.94 
 
 		 778 aa  339  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0909  TonB-dependent siderophore receptor  32.84 
 
 		 794 aa  331  3e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.794253 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2388  TonB-dependent receptor  31.17 
 
 		 788 aa  318  3e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1245  TonB-dependent receptor  29.23 
 
 		 761 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384236  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1838  TonB-dependent receptor  28.9 
 
 		 796 aa  292  2e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0041  putative TonB-dependent siderophore receptor  29.92 
 
 		 821 aa  288  4e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.130227 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2380  TonB-dependent receptor  29.89 
 
 		 782 aa  277  6e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.397663  normal  0.960991 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4774  TonB-dependent receptor  28.7 
 
 		 760 aa  263  8.999999999999999e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594782  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1629  TonB-dependent receptor  25.8 
 
 		 718 aa  234  6e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00166049  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0492  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 762 aa  175  2.9999999999999996e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1237  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 		 736 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0778  TonB-dependent receptor  25.31 
 
 		 742 aa  155  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3675  TonB-dependent receptor  24.75 
 
 		 737 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0831004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2341  TonB-dependent receptor  23.99 
 
 		 764 aa  140  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4029  TonB-dependent receptor  23.61 
 
 		 719 aa  109  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2077  TonB-dependent receptor  27.63 
 
 		 742 aa  97.4  9e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0256  ferric siderophore receptor  24.54 
 
 		 807 aa  68.9  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.027165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2372  TonB-dependent receptor, plug  29.25 
 
 		 642 aa  61.6  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.286336 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1964  TonB-dependent receptor, plug  23.78 
 
 		 618 aa  60.5  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  34.48 
 
 		 628 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0123  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  27.88 
 
 		 631 aa  60.1  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000105264  normal  0.11479 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  23.41 
 
 		 649 aa  60.5  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1253  TonB-dependent receptor, plug  31.85 
 
 		 702 aa  58.5  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.98016  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5373  TonB-dependent outer-membrane transporter  29.93 
 
 		 661 aa  58.2  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0456572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  34.19 
 
 		 817 aa  57.8  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  27.72 
 
 		 709 aa  57.4  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0192  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  26.37 
 
 		 631 aa  57.4  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.051851  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0142  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  32.84 
 
 		 630 aa  56.6  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000593825  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4596  TonB-dependent siderophore receptor  30.11 
 
 		 774 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4073  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  32.84 
 
 		 630 aa  56.6  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000943492  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2453  TonB-dependent siderophore receptor  30.97 
 
 		 720 aa  56.6  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.591762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  30.7 
 
 		 613 aa  55.8  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2073  TonB-dependent receptor  34 
 
 		 1000 aa  55.5  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168139  normal  0.78272 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4770  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  32.5 
 
 		 623 aa  55.5  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000262019  normal  0.0314633 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0132  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  31.2 
 
 		 631 aa  55.5  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00107286  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  30.6 
 
 		 698 aa  55.8  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0198  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  26.88 
 
 		 631 aa  55.1  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194454  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4613  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  31.17 
 
 		 774 aa  55.1  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2547  TonB-dependent receptor plug  36.04 
 
 		 615 aa  55.1  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792273  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  32.35 
 
 		 617 aa  55.1  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2926  TonB-dependent receptor  29.53 
 
 		 715 aa  55.1  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000198793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0609  TonB-dependent siderophore receptor  22.06 
 
 		 710 aa  54.7  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4967  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 698 aa  54.7  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.655024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3676  TonB-dependent receptor, plug  31.54 
 
 		 735 aa  54.7  0.000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3783  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  32.5 
 
 		 615 aa  54.7  0.000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000781057  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0022  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 697 aa  53.9  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000255766 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07860  TonB-dependent vitamin B12 receptor  26.97 
 
 		 630 aa  53.9  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.239557  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0722  TonB-dependent siderophore receptor  24.29 
 
 		 675 aa  53.9  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.534189 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2720  iron complex outermembrane recepter protein  25.53 
 
 		 631 aa  54.3  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.83965  normal  0.415567 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1358  TonB-dependent receptor, plug  31.71 
 
 		 626 aa  53.9  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00131062  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  28.87 
 
 		 634 aa  53.5  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47190  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  31.06 
 
 		 784 aa  53.1  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4462  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  32.46 
 
 		 614 aa  53.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0180001  hitchhiker  0.0000000000824718 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4341  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  32.46 
 
 		 614 aa  53.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139999  normal  0.582372 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4372  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  32.46 
 
 		 614 aa  53.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0258695  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4787  TonB-dependent siderophore receptor  24.64 
 
 		 696 aa  53.1  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4536  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  32.46 
 
 		 614 aa  53.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.329693  hitchhiker  0.0000000267555 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4459  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  32.46 
 
 		 614 aa  53.5  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0519388  hitchhiker  0.0000109547 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1204  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  27.2 
 
 		 784 aa  52.8  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.814963  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3231  TonB-dependent siderophore receptor  27.01 
 
 		 687 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.854124  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0867  FecA-like outer membrane receptor  27.74 
 
 		 809 aa  52  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.272294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1012  TonB-dependent receptor  32.73 
 
 		 626 aa  52.4  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0721  Outer membrane cobalamin receptor protein-like  30.43 
 
 		 640 aa  52.4  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3960  TonB-dependent receptor, plug  30.83 
 
 		 741 aa  52  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1992  TonB-dependent receptor, plug  30.43 
 
 		 671 aa  52.4  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.643758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1096  TonB-dependent receptor  32.73 
 
 		 626 aa  52.4  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0911  TonB-dependent siderophore receptor  27.74 
 
 		 809 aa  52  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11228 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0897  TonB-dependent siderophore receptor  27.74 
 
 		 809 aa  52  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448435  normal  0.28892 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2845  putative TonB-dependent receptor  22.56 
 
 		 715 aa  51.6  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.328029 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  24.73 
 
 		 653 aa  51.6  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0162  TonB-dependent iron siderophore receptor  31.15 
 
 		 778 aa  51.6  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3867  TonB-dependent receptor, plug  30.83 
 
 		 729 aa  51.6  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62350  putative haem/haemoglobin uptake outer membrane receptor PhuR precursor  33.33 
 
 		 764 aa  51.6  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5169  TonB-dependent siderophore receptor  29.6 
 
 		 723 aa  51.2  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1025  TonB-dependent receptor  21.93 
 
 		 791 aa  51.6  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5426  outer membrane hemin receptor  33.33 
 
 		 764 aa  51.6  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0676  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 732 aa  51.2  0.00008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.218893  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0185  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.89 
 
 		 728 aa  51.2  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848528 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4773  TonB-dependent receptor  31.53 
 
 		 624 aa  51.2  0.00009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.386912  normal  0.53176 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0923  TonB-dependent siderophore receptor  31.82 
 
 		 777 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  25.35 
 
 		 663 aa  50.8  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>