More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0676 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0676  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 732 aa  1489    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.218893  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4255  TonB-dependent receptor  24.07 
 
 		 720 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4029  TonB-dependent receptor  24.42 
 
 		 719 aa  124  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1237  TonB-dependent receptor  23.88 
 
 		 736 aa  120  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3675  TonB-dependent receptor  22.35 
 
 		 737 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0831004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0778  TonB-dependent receptor  22.03 
 
 		 742 aa  106  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  23.03 
 
 		 641 aa  99.8  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  23.41 
 
 		 663 aa  99  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  23.41 
 
 		 663 aa  98.2  5e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  23.41 
 
 		 663 aa  98.2  5e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  23.41 
 
 		 663 aa  98.2  5e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0492  TonB-dependent receptor  30.19 
 
 		 762 aa  98.2  5e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  23.5 
 
 		 659 aa  97.8  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  23.41 
 
 		 663 aa  96.3  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  23.41 
 
 		 663 aa  96.3  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2341  TonB-dependent receptor  32.61 
 
 		 764 aa  94  8e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2433  TonB-dependent receptor  30.73 
 
 		 754 aa  93.2  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.747625 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3636  TonB-dependent receptor  29.05 
 
 		 804 aa  89.4  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000134979  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  21.78 
 
 		 663 aa  88.6  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2380  TonB-dependent receptor  23.98 
 
 		 782 aa  87  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.397663  normal  0.960991 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1561  TonB-dependent receptor plug  29.06 
 
 		 681 aa  85.5  0.000000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000105774  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1760  TonB-dependent heme receptor  32.97 
 
 		 664 aa  85.1  0.000000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5364  TonB-dependent receptor plug  22.92 
 
 		 729 aa  83.6  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  21.19 
 
 		 663 aa  84  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4030  TonB-dependent receptor:Lipocalin  30.18 
 
 		 713 aa  82.8  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2342  TonB-dependent receptor  29.83 
 
 		 611 aa  81.6  0.00000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.499314  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  32.69 
 
 		 1023 aa  80.5  0.00000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0772  TonB-dependent receptor plug  27.37 
 
 		 800 aa  80.9  0.00000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578903 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  36.84 
 
 		 650 aa  80.1  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  36.84 
 
 		 650 aa  79.7  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1506  TonB-dependent receptor  22.87 
 
 		 707 aa  79.7  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  36.84 
 
 		 650 aa  79.7  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  36.84 
 
 		 650 aa  79.7  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0729  TonB-dependent receptor, plug  25.57 
 
 		 656 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000181168  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  36.84 
 
 		 650 aa  79.7  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  32.05 
 
 		 686 aa  79  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  35.66 
 
 		 680 aa  79  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6535  TonB-dependent receptor  30.05 
 
 		 694 aa  79  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.822423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5373  TonB-dependent outer-membrane transporter  26.7 
 
 		 661 aa  78.6  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0456572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0824  TonB-dependent receptor, plug  24.88 
 
 		 659 aa  78.6  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  30.56 
 
 		 688 aa  78.2  0.0000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1691  TonB-dependent receptor, plug  34.04 
 
 		 732 aa  77.8  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524758  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00261  phosphatidylglycerophosphatase  31.49 
 
 		 617 aa  77.8  0.0000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2666  putative outer membrane receptor  22.79 
 
 		 665 aa  77  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  35.34 
 
 		 656 aa  77  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0635  TonB-dependent receptor, plug  31.25 
 
 		 706 aa  77  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2748  putative outer membrane receptor  22.79 
 
 		 665 aa  77  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1541  putative outer membrane receptor  22.79 
 
 		 665 aa  77  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2631  TonB-dependent receptor domain-containing protein  30.94 
 
 		 646 aa  77  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.221793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002156  outer membrane vitamin B12 receptor BtuB  27.07 
 
 		 611 aa  76.6  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000122091  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0582  TonB-dependent receptor plug  30.41 
 
 		 664 aa  75.9  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000848459  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0834  vitamin B12 receptor BtuB, putative  31.67 
 
 		 680 aa  75.9  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.162621  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  32.88 
 
 		 634 aa  74.7  0.000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7217  TonB-dependent receptor  27.86 
 
 		 707 aa  74.3  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0654  TonB-dependent receptor  31.31 
 
 		 638 aa  73.9  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.561107  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1493  putative TonB-dependent receptor  34.46 
 
 		 697 aa  73.6  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.404893  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1797  TonB-dependent receptor plug  29.41 
 
 		 647 aa  73.6  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0969  outer membrane receptor for transport of vitamin B  29.44 
 
 		 645 aa  73.2  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.01117 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  23.22 
 
 		 646 aa  72.8  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0249  TonB-dependent receptor  31.25 
 
 		 688 aa  73.2  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0471  TonB-dependent receptor, putative, degenerate  33.71 
 
 		 704 aa  72.8  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0651  tonB-dependent receptor  27.75 
 
 		 656 aa  72.8  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0646495  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1662  TonB-dependent receptor  26.55 
 
 		 686 aa  72.4  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.917445  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1028  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  30.81 
 
 		 685 aa  72  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2815  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 		 619 aa  72.4  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.186668  normal  0.478128 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1035  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  30.81 
 
 		 685 aa  72  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127064  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2990  TonB-dependent receptor  25.46 
 
 		 656 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.235083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0806  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 743 aa  71.6  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  29.51 
 
 		 618 aa  72  0.00000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  29.85 
 
 		 653 aa  72  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47800  putative tonB-dependent receptor  27.76 
 
 		 616 aa  71.6  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173562  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2209  TonB-dependent receptor  32.16 
 
 		 624 aa  72  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2648  TonB-dependent receptor  20.85 
 
 		 602 aa  72  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  29.85 
 
 		 635 aa  72  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2959  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  30.3 
 
 		 685 aa  71.6  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1187  outer membrane receptor for transport of vitamin B  30.81 
 
 		 821 aa  71.6  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.096047  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1639  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  30.3 
 
 		 685 aa  71.6  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.18341  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2276  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 		 751 aa  71.6  0.00000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0132  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  30 
 
 		 631 aa  71.6  0.00000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00107286  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3496  outer membrane receptor FepA  32.92 
 
 		 744 aa  71.6  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2077  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 		 742 aa  71.6  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2327  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  30.3 
 
 		 685 aa  71.6  0.00000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.52571  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2667  TonB-dependent receptor  31.82 
 
 		 627 aa  71.2  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0986558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0995  TonB-dependent receptor  29.85 
 
 		 629 aa  71.2  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.864049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2720  iron complex outermembrane recepter protein  28.45 
 
 		 631 aa  71.2  0.00000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.83965  normal  0.415567 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1502  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 613 aa  70.9  0.00000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2400  outer membrane receptor protein  29.5 
 
 		 621 aa  70.9  0.00000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.901841 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0198  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  26.56 
 
 		 631 aa  70.9  0.00000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194454  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0685  vitamin B12 receptor BtuB, putative  29.8 
 
 		 685 aa  70.9  0.00000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.174842  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  30.32 
 
 		 795 aa  70.9  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1023  TonB-dependent receptor plug  29.41 
 
 		 769 aa  70.5  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.302797  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3302  TonB-dependent siderophore receptor  28.57 
 
 		 653 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00384842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0651  TonB-dependent siderophore receptor  28.57 
 
 		 653 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.68611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4534  putative TonB-dependent receptor protein  23.62 
 
 		 797 aa  70.5  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.38874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3472  TonB-dependent siderophore receptor  28.57 
 
 		 653 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0503687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3176  TonB-dependent siderophore receptor  25.47 
 
 		 653 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0815  TonB-dependent receptor domain-containing protein  27.23 
 
 		 653 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0663  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 652 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136044  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1025  TonB-dependent receptor  22.35 
 
 		 791 aa  69.7  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3644  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 653 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.388894  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>