More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5364 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5364  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 729 aa  1491    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1274  TonB-dependent receptor plug  37.21 
 
 		 861 aa  427  1e-118  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1023  TonB-dependent receptor plug  37.12 
 
 		 769 aa  418  9.999999999999999e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.302797  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0448  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  36.91 
 
 		 271 aa  188  3e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0483  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  36.91 
 
 		 271 aa  188  3e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00522803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2744  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 701 aa  181  4.999999999999999e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1231  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 678 aa  167  5e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1142  TonB-dependent receptor-related protein  27.63 
 
 		 650 aa  163  1e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.22175  normal  0.0805488 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1266  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 		 679 aa  159  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0152296  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1064  TonB-dependent receptor  27.65 
 
 		 661 aa  157  6e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00188221  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1519  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 657 aa  157  9e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.148558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1115  TonB-dependent receptor  24.32 
 
 		 649 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.95294  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1262  TonB-dependent receptor  24.13 
 
 		 651 aa  148  4.0000000000000006e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.612585  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1014  TonB-dependent receptor-related protein  24.53 
 
 		 647 aa  140  1e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002156  outer membrane vitamin B12 receptor BtuB  25.71 
 
 		 611 aa  127  7e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000122091  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0028  TonB-dependent receptor  23.02 
 
 		 641 aa  126  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4029  TonB-dependent receptor  23.94 
 
 		 719 aa  121  4.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  37.82 
 
 		 646 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  25.75 
 
 		 709 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5752  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 		 746 aa  113  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0523831  hitchhiker  0.0000000000276247 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2342  TonB-dependent receptor  23.67 
 
 		 611 aa  108  4e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.499314  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  24.33 
 
 		 653 aa  105  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  23.83 
 
 		 635 aa  105  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  24.45 
 
 		 653 aa  105  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1925  TonB-dependent receptor  34.74 
 
 		 642 aa  103  8e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55144  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6535  TonB-dependent receptor  30.51 
 
 		 694 aa  103  8e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.822423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2030  TonB-dependent receptor, plug  24.87 
 
 		 668 aa  103  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1347  iron compound TonB-dependent receptor, putative  23.99 
 
 		 620 aa  102  4e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1826  TonB-dependent receptor  24.17 
 
 		 621 aa  101  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.568285  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0132  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  21.32 
 
 		 631 aa  100  7e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00107286  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  24.1 
 
 		 680 aa  100  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7217  TonB-dependent receptor  36.81 
 
 		 707 aa  100  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3206  TonB-dependent receptor plug  24.33 
 
 		 617 aa  99  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00965358  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  32.37 
 
 		 634 aa  99  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1306  putative iron compound TonB-dependent receptor  23.85 
 
 		 697 aa  97.8  6e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4030  TonB-dependent receptor:Lipocalin  38.85 
 
 		 713 aa  97.4  7e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3559  TonB-dependent receptor  31.54 
 
 		 665 aa  97.4  9e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00145171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5052  TonB-dependent receptor  23.95 
 
 		 726 aa  96.3  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0923716  normal  0.422268 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0824  TonB-dependent receptor, plug  34.18 
 
 		 659 aa  95.9  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2165  TonB-dependent vitamin B12 receptor  23.97 
 
 		 616 aa  96.3  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2242  outer membrane receptor FepA  32.34 
 
 		 744 aa  95.5  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.620188 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4372  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  22.59 
 
 		 614 aa  95.1  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0258695  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1321  TonB-dependent receptor  33.17 
 
 		 724 aa  95.1  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3576  TonB-dependent receptor  30.8 
 
 		 653 aa  94.4  6e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.313951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4536  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  22.45 
 
 		 614 aa  94.7  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.329693  hitchhiker  0.0000000267555 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4459  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  22.59 
 
 		 614 aa  94.7  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0519388  hitchhiker  0.0000109547 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3176  TonB-dependent siderophore receptor  34.34 
 
 		 653 aa  94.4  7e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4462  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  22.59 
 
 		 614 aa  94.4  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0180001  hitchhiker  0.0000000000824718 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0988  TonB-dependent receptor plug  37.85 
 
 		 806 aa  94.4  7e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.124203 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0815  TonB-dependent receptor domain-containing protein  33.84 
 
 		 653 aa  94  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4341  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  22.45 
 
 		 614 aa  93.6  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139999  normal  0.582372 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0249  TonB-dependent receptor  34.43 
 
 		 688 aa  92.8  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1797  TonB-dependent receptor plug  36.08 
 
 		 647 aa  92.8  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3783  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  30.56 
 
 		 615 aa  92.4  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000781057  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1716  outer membrane receptor FepA  31.91 
 
 		 746 aa  92  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  34.76 
 
 		 656 aa  92  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0509  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  26.77 
 
 		 614 aa  92  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.194967  normal  0.193806 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2550  TonB-dependent receptor plug  24.42 
 
 		 775 aa  91.7  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.182788  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3496  outer membrane receptor FepA  32.03 
 
 		 744 aa  91.7  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2092  TonB-dependent receptor  31.12 
 
 		 670 aa  90.9  7e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3767  TonB-dependent receptor  32.83 
 
 		 653 aa  90.9  7e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  30.45 
 
 		 638 aa  90.9  8e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3644  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 653 aa  90.9  8e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.388894  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1493  putative TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 697 aa  90.1  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.404893  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000158  TonB-dependent heme and hemoglobin receptor HutA  25.97 
 
 		 693 aa  90.1  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00497898  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0663  TonB-dependent receptor  32.83 
 
 		 652 aa  90.1  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136044  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0122  TonB-dependent receptor  32.93 
 
 		 624 aa  89.4  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0729  TonB-dependent receptor, plug  30.27 
 
 		 656 aa  89.7  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000181168  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4770  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  31.03 
 
 		 623 aa  89  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000262019  normal  0.0314633 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0123  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  30.43 
 
 		 631 aa  89  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000105264  normal  0.11479 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  34.81 
 
 		 641 aa  88.6  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0812  TonB-dependent receptor plug  36.02 
 
 		 659 aa  89  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.183722  normal  0.24775 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  34.81 
 
 		 663 aa  88.6  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  34.81 
 
 		 663 aa  88.6  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  34.81 
 
 		 663 aa  88.6  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1870  outer membrane receptor FepA  33.68 
 
 		 744 aa  88.6  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  34.81 
 
 		 659 aa  88.6  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1012  TonB-dependent receptor  32.29 
 
 		 626 aa  88.6  4e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  34.81 
 
 		 663 aa  88.6  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  34.81 
 
 		 663 aa  88.6  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  35.67 
 
 		 634 aa  88.2  4e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1096  TonB-dependent receptor  32.29 
 
 		 626 aa  88.6  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  34.81 
 
 		 663 aa  88.6  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2209  TonB-dependent receptor  31.28 
 
 		 624 aa  87.8  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00261  phosphatidylglycerophosphatase  29.48 
 
 		 617 aa  87.8  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  34.81 
 
 		 650 aa  87.8  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  34.81 
 
 		 650 aa  87.8  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  34.81 
 
 		 650 aa  87.8  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  34.81 
 
 		 650 aa  87.8  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3738  TonB-dependent receptor  30.95 
 
 		 665 aa  87.8  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  0.0543439 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  34.81 
 
 		 650 aa  87.8  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  27.34 
 
 		 617 aa  87.4  9e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  22.61 
 
 		 618 aa  87  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  34.71 
 
 		 613 aa  87  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2648  TonB-dependent receptor  23.55 
 
 		 602 aa  86.7  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3494  TonB-dependent receptor  23.77 
 
 		 715 aa  86.7  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4020  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  30.67 
 
 		 615 aa  86.7  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000194494  normal  0.015002 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1088  TonB-dependent receptor  30.36 
 
 		 679 aa  86.7  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2667  TonB-dependent receptor  32.45 
 
 		 627 aa  86.7  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0986558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1357  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  35.15 
 
 		 696 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0456407  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>