More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2550 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2550  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 775 aa  1582    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.182788  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1206  putative TonB-dependent receptor  32.69 
 
 		 688 aa  332  2e-89  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0645  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.71 
 
 		 750 aa  130  8.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0446508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1142  TonB-dependent receptor-related protein  25.73 
 
 		 650 aa  120  9.999999999999999e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.22175  normal  0.0805488 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0859  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  25.98 
 
 		 676 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32697  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1115  TonB-dependent receptor  25.4 
 
 		 649 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.95294  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  24.77 
 
 		 653 aa  108  5e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1262  TonB-dependent receptor  24.81 
 
 		 651 aa  103  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.612585  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0821  TonB-dependent copper receptor  23.87 
 
 		 749 aa  102  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2368  TonB-dependent copper receptor  23.87 
 
 		 749 aa  102  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.468955  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  25.14 
 
 		 759 aa  101  6e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4607  TonB-dependent copper receptor  23.33 
 
 		 724 aa  101  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0702651  normal  0.0726755 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2507  TonB-dependent copper receptor  23.72 
 
 		 745 aa  101  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3292  TonB-dependent copper receptor  23.98 
 
 		 709 aa  100  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.49865 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4510  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.75 
 
 		 867 aa  100  9e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531112  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0427  TonB-dependent copper receptor  23.69 
 
 		 745 aa  99.4  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1014  TonB-dependent receptor-related protein  23.94 
 
 		 647 aa  99.8  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0477  TonB-dependent copper receptor  23.69 
 
 		 745 aa  99.4  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.157724  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1806  TonB-dependent copper receptor  23.69 
 
 		 745 aa  99.4  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0638  TonB-dependent copper receptor  23.75 
 
 		 753 aa  98.6  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4119  TonB-dependent vitamin B12 receptor  23.82 
 
 		 616 aa  98.6  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1826  TonB-dependent receptor  24.04 
 
 		 621 aa  98.2  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.568285  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3808  TonB-dependent copper receptor  23.83 
 
 		 687 aa  97.8  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.494445  normal  0.660377 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2174  TonB-dependent copper receptor  23.11 
 
 		 710 aa  98.2  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2970  TonB-dependent receptor  23.1 
 
 		 718 aa  97.8  7e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.222916  normal  0.415846 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2547  TonB-dependent receptor plug  31.6 
 
 		 615 aa  97.8  8e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792273  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1266  TonB-dependent receptor  23.7 
 
 		 679 aa  97.4  8e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0152296  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47800  putative tonB-dependent receptor  25.32 
 
 		 616 aa  96.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173562  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4838  TonB-dependent copper receptor  24.48 
 
 		 688 aa  95.9  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.412488 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52120  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 		 668 aa  95.5  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.618776  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1231  TonB-dependent receptor  23.8 
 
 		 678 aa  95.9  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3189  TonB-dependent receptor, plug  24.78 
 
 		 623 aa  95.5  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1171  TonB-dependent receptor  24.48 
 
 		 697 aa  95.5  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1325  TonB-dependent copper receptor  23 
 
 		 719 aa  94.7  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4452  TonB-dependent copper receptor  22.85 
 
 		 710 aa  93.2  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.876031  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15070  outer membrane copper receptor OprC  22.79 
 
 		 723 aa  94  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127729 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3914  TonB-dependent copper receptor  22.85 
 
 		 710 aa  93.2  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4773  TonB-dependent receptor  32.34 
 
 		 624 aa  94  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.386912  normal  0.53176 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3613  TonB-dependent copper receptor  22.85 
 
 		 710 aa  93.2  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2813  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  28.45 
 
 		 752 aa  93.2  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409295  normal  0.033455 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2133  TonB-dependent receptor  21.39 
 
 		 760 aa  92.4  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.207681  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0239  TonB-dependent copper receptor  24.18 
 
 		 681 aa  92.4  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0377  TonB-dependent receptor  22.82 
 
 		 661 aa  92.4  3e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.337812  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3079  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  29.45 
 
 		 749 aa  92.4  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578184  normal  0.640721 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3953  TonB-dependent copper receptor OprC  24.18 
 
 		 681 aa  92.4  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4716  TonB-dependent copper receptor  24.18 
 
 		 688 aa  92.4  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.129936 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0162  TonB-dependent iron siderophore receptor  24.83 
 
 		 778 aa  92  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5070  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  22.89 
 
 		 762 aa  91.7  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.565094  normal  0.157746 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5364  TonB-dependent receptor plug  24.42 
 
 		 729 aa  91.3  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3712  TonB-dependent copper receptor OprC  24.03 
 
 		 686 aa  91.3  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2454  TonB-dependent copper receptor  23.99 
 
 		 684 aa  91.3  7e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.119589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  29.18 
 
 		 646 aa  91.3  7e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  35.23 
 
 		 698 aa  91.3  7e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  28.57 
 
 		 617 aa  91.3  7e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4630  TonB-dependent copper receptor  24.3 
 
 		 688 aa  90.9  8e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102852 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1012  TonB-dependent receptor  30.81 
 
 		 626 aa  90.9  9e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2354  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  24.41 
 
 		 778 aa  90.1  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.548378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1096  TonB-dependent receptor  30.81 
 
 		 626 aa  90.1  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1274  TonB-dependent receptor plug  23.45 
 
 		 861 aa  89.7  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0570  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system protein  25.16 
 
 		 675 aa  89.4  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.168599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2845  putative TonB-dependent receptor  33.5 
 
 		 715 aa  89.4  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.328029 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1083  TonB-dependent receptor  24.41 
 
 		 681 aa  89  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.654229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0176  TonB-dependent receptor  22.03 
 
 		 763 aa  88.6  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1446  TonB-dependent receptor  24.52 
 
 		 680 aa  89  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.757282 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  22.9 
 
 		 1023 aa  88.2  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3077  TonB-dependent siderophore receptor  39.85 
 
 		 753 aa  87.8  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3327  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.67 
 
 		 688 aa  87.4  8e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0926253  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0074  heme receptor HutR  22.32 
 
 		 713 aa  87  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0136209  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  24.09 
 
 		 650 aa  86.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  23.92 
 
 		 650 aa  85.9  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4894  TonB-dependent copper receptor  24.03 
 
 		 688 aa  86.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386711  normal  0.630866 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1983  TonB-dependent receptor  22.93 
 
 		 727 aa  86.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.454223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  23.92 
 
 		 650 aa  85.9  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  23.92 
 
 		 650 aa  86.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2876  TonB-dependent siderophore receptor  38.85 
 
 		 751 aa  85.9  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0461  TonB-dependent vitamin B12 receptor  27.56 
 
 		 613 aa  85.9  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00224002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2970  TonB-dependent receptor protein  22.1 
 
 		 651 aa  85.5  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.140883  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4359  TonB-dependent receptor  24.21 
 
 		 682 aa  85.9  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503749 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  24.23 
 
 		 656 aa  85.1  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6080  putative TonB-dependent receptor  32.32 
 
 		 690 aa  85.5  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 702 aa  85.1  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  23.75 
 
 		 650 aa  84.7  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00261  phosphatidylglycerophosphatase  29.27 
 
 		 617 aa  84.7  0.000000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3220  TonB-dependent receptor  24.56 
 
 		 654 aa  84.3  0.000000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1115  TonB-dependent receptor  23.24 
 
 		 705 aa  84.3  0.000000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4275  TonB-dependent receptor  24.01 
 
 		 685 aa  84.3  0.000000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2293  TonB-dependent receptor  22.51 
 
 		 685 aa  84  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2591  hemin receptor precursor, TonB-dependent outer membrane uptake protein  21.41 
 
 		 687 aa  84  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.125278 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4669  TonB-dependent copper receptor  22.8 
 
 		 713 aa  84  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0923349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  39.82 
 
 		 628 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  24.62 
 
 		 635 aa  83.2  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5008  TonB-dependent receptor  39.58 
 
 		 627 aa  83.2  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.877838 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3272  TonB-dependent siderophore receptor  24.3 
 
 		 750 aa  83.2  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.46801  normal  0.424622 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1973  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  23.32 
 
 		 783 aa  83.2  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02166  TonB-dependent outer membrane Receptor  44.64 
 
 		 619 aa  83.2  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1472  TonB-dependent receptor plug  26.52 
 
 		 704 aa  82.4  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0185  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25 
 
 		 728 aa  82.4  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848528 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1310  TonB-dependent receptor plug  26.52 
 
 		 704 aa  82.4  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.475424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0509  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  34.55 
 
 		 614 aa  81.6  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.194967  normal  0.193806 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0596  TonB-dependent copper receptor  22.94 
 
 		 710 aa  81.3  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.834175  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>