More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0570 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0570  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system protein  100 
 
 		 675 aa  1348    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.168599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2845  putative TonB-dependent receptor  30.01 
 
 		 715 aa  283  6.000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.328029 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2751  TonB-dependent receptor plug  29.81 
 
 		 722 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.930878  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1518  TonB-dependent receptor plug  28.66 
 
 		 727 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1231  TonB-dependent receptor  26.28 
 
 		 678 aa  124  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  24.75 
 
 		 698 aa  122  3e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1266  TonB-dependent receptor  24.36 
 
 		 679 aa  120  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0152296  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3738  TonB-dependent receptor  26.84 
 
 		 665 aa  112  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  0.0543439 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2744  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 701 aa  110  9.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1262  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 651 aa  109  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.612585  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  26.93 
 
 		 635 aa  107  7e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  27.72 
 
 		 653 aa  107  8e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5752  TonB-dependent receptor  25.88 
 
 		 746 aa  104  6e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0523831  hitchhiker  0.0000000000276247 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1115  TonB-dependent receptor  24.54 
 
 		 649 aa  102  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.95294  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2046  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 713 aa  102  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183904 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3189  TonB-dependent receptor, plug  25.8 
 
 		 623 aa  101  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05789  hypothetical protein  23.45 
 
 		 712 aa  99  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2547  TonB-dependent receptor plug  25.4 
 
 		 615 aa  98.6  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792273  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  28.4 
 
 		 680 aa  97.8  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  24.14 
 
 		 648 aa  96.7  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6077  TonB-dependent receptor plug  26.37 
 
 		 656 aa  96.7  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.762724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  24.67 
 
 		 613 aa  94.7  4e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1005  TonB-dependent receptor  23.04 
 
 		 699 aa  94.4  6e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.828736  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1673  receptor, putative  25.05 
 
 		 639 aa  94  7e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.193509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4004  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23 
 
 		 681 aa  92.8  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.371484 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0790  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  25.04 
 
 		 690 aa  92.8  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000110471  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  22.86 
 
 		 638 aa  91.7  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2550  TonB-dependent receptor plug  26.02 
 
 		 775 aa  91.3  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.182788  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1552  TonB-dependent receptor HmuR  25.24 
 
 		 646 aa  90.9  8e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0812  TonB-dependent receptor plug  26.17 
 
 		 659 aa  90.1  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.183722  normal  0.24775 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1804  TonB-dependent receptor  24.84 
 
 		 683 aa  90.5  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0894155  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0519  heme transport protein HutA  24.55 
 
 		 698 aa  89  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1688  TonB-dependent receptor  28.89 
 
 		 710 aa  89  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00738992  normal  0.0180451 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  24.44 
 
 		 657 aa  89.4  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1321  TonB-dependent receptor  23.94 
 
 		 724 aa  89.4  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1486  TonB-dependent receptor, plug  25.19 
 
 		 677 aa  89  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.243313  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1274  TonB-dependent receptor plug  24.87 
 
 		 861 aa  88.6  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  23.36 
 
 		 686 aa  88.2  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3807  TonB-dependent receptor plug  25.38 
 
 		 655 aa  88.2  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0582  TonB-dependent receptor plug  23.29 
 
 		 664 aa  87.4  8e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000848459  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0778  TonB-dependent receptor  23.71 
 
 		 742 aa  87.4  9e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1115  TonB-dependent receptor  24.82 
 
 		 705 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4579  outer membrane receptor FepA  24.61 
 
 		 742 aa  85.5  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2169  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.04 
 
 		 694 aa  84.7  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.108589 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1741  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  30.63 
 
 		 661 aa  84.7  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000016514  normal  0.0458944 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  25.31 
 
 		 646 aa  84.7  0.000000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  25.59 
 
 		 799 aa  84  0.000000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2735  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 		 641 aa  83.6  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00964506  normal  0.0993289 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  24.11 
 
 		 634 aa  84  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02035  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  22.98 
 
 		 705 aa  83.6  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3235  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.71 
 
 		 695 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000386167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2720  iron complex outermembrane recepter protein  24.4 
 
 		 631 aa  82.8  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.83965  normal  0.415567 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3815  TonB-dependent receptor  23.35 
 
 		 658 aa  82.8  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1142  TonB-dependent receptor-related protein  30.89 
 
 		 650 aa  83.2  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.22175  normal  0.0805488 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52230  outer membrane receptor FepA  24.06 
 
 		 742 aa  81.6  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.267722 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0781  TonB-dependent receptor  26.29 
 
 		 757 aa  81.6  0.00000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.877086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1648  ferric receptor CfrA  25.54 
 
 		 696 aa  81.3  0.00000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1522  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0469  iron-regulated outer membrane virulence protein, TonB receptor CfrA  23.94 
 
 		 698 aa  81.3  0.00000000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.442515  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0392  TonB-dependent receptor, plug  30.31 
 
 		 717 aa  80.9  0.00000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.829697  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5290  TonB-dependent receptor plug  26.64 
 
 		 673 aa  80.5  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5008  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 627 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.877838 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  35.03 
 
 		 655 aa  80.1  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1496  TonB-dependent receptor  29.59 
 
 		 716 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0966  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.18 
 
 		 696 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.942987  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0084  TonB-dependent receptor, plug  32.31 
 
 		 671 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5676  TonB-dependent receptor plug  30.42 
 
 		 662 aa  79.7  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47140  putative TonB-dependent receptor  23.99 
 
 		 732 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03647  TonB-dependent receptor  24.36 
 
 		 640 aa  79.7  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00288042  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3327  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.61 
 
 		 688 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0926253  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3669  heme transport protein  25.4 
 
 		 697 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5609  putative TonB-dependent receptor protein  24.37 
 
 		 727 aa  79  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232583  normal  0.195075 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01534  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  34.88 
 
 		 647 aa  79  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  24.95 
 
 		 778 aa  78.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3573  TonB-dependent receptor plug  32.35 
 
 		 758 aa  78.6  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1269  TonB-dependent receptor  22.69 
 
 		 710 aa  78.2  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0471  TonB-dependent receptor, putative, degenerate  27.89 
 
 		 704 aa  78.2  0.0000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  23.54 
 
 		 640 aa  78.2  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3206  TonB-dependent receptor plug  30.47 
 
 		 617 aa  78.2  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00965358  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1023  TonB-dependent receptor plug  24.46 
 
 		 769 aa  78.2  0.0000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.302797  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1191  TonB-dependent receptor  24.34 
 
 		 744 aa  77.8  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.601925 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3338  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.59 
 
 		 696 aa  77.4  0.0000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000719833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 		 649 aa  77.4  0.0000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1076  iron transporter  24.1 
 
 		 743 aa  77.4  0.0000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.337763 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3505  outer membrane insertion C-terminal signal  27.04 
 
 		 758 aa  77.4  0.0000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4068  putative TonB-dependent receptor  24.36 
 
 		 733 aa  77.4  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  33.95 
 
 		 665 aa  76.6  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3097  TonB-dependent receptor, plug  31.06 
 
 		 671 aa  76.6  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2400  outer membrane receptor protein  22.82 
 
 		 621 aa  76.6  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.901841 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3802  outer membrane heme/hemoglobin receptor ChuA  34.07 
 
 		 660 aa  77  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.241464 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3695  outer membrane insertion C-terminal signal  31.76 
 
 		 758 aa  77  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.122908 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  23.67 
 
 		 728 aa  77  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2859  TonB-dependent siderophore receptor  26.15 
 
 		 733 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.335633 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4218  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  33.33 
 
 		 862 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4857  outer membrane heme/hemoglobin receptor ChuA  34.07 
 
 		 660 aa  77  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.803267 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0745  TonB-dependent receptor, plug  30.65 
 
 		 758 aa  77  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1493  putative TonB-dependent receptor  26.84 
 
 		 697 aa  77  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.404893  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01120  iron-regulated outer membrane virulence protein  25.14 
 
 		 572 aa  76.3  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  35.54 
 
 		 653 aa  76.3  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1394  TonB-dependent receptor, plug  29.11 
 
 		 713 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0833322 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3082  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  22.75 
 
 		 730 aa  75.9  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.25355  normal  0.407735 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>