More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6080 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2219  TonB-dependent receptor  65.82 
 
 		 692 aa  924    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6079  putative TonB-dependent receptor  71.7 
 
 		 680 aa  999    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0972806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2621  TonB-dependent receptor, plug  67.77 
 
 		 695 aa  977    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6080  putative TonB-dependent receptor  100 
 
 		 690 aa  1399    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5290  TonB-dependent receptor plug  51.11 
 
 		 673 aa  600  1e-170  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0084  TonB-dependent receptor, plug  50 
 
 		 671 aa  594  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5676  TonB-dependent receptor plug  50.49 
 
 		 662 aa  593  1e-168  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3807  TonB-dependent receptor plug  48.44 
 
 		 655 aa  588  1e-166  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6077  TonB-dependent receptor plug  48.93 
 
 		 656 aa  568  1e-160  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.762724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1339  TonB-dependent receptor  33.56 
 
 		 714 aa  370  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.368228 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1925  TonB-dependent receptor  34.95 
 
 		 642 aa  336  1e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55144  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  33.7 
 
 		 646 aa  332  1e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  32.9 
 
 		 634 aa  330  4e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  33.39 
 
 		 638 aa  289  1e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0812  TonB-dependent receptor plug  30.14 
 
 		 659 aa  268  2e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.183722  normal  0.24775 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  29.86 
 
 		 634 aa  264  4e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  30 
 
 		 613 aa  258  3e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3189  TonB-dependent receptor, plug  31.12 
 
 		 623 aa  245  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1004  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 618 aa  230  7e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0684927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0488  TonB-dependent receptor  29.06 
 
 		 682 aa  224  4e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3097  TonB-dependent receptor, plug  29.71 
 
 		 671 aa  218  2.9999999999999998e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2735  TonB-dependent receptor  29.98 
 
 		 641 aa  216  9e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00964506  normal  0.0993289 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0628  Outer membrane cobalamin receptor protein-like  28.75 
 
 		 638 aa  212  2e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000288278  normal  0.81106 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1110  TonB-dependent receptor  28.1 
 
 		 625 aa  212  2e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000459108  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2063  TonB-dependent receptor  27.61 
 
 		 645 aa  210  6e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.785465  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3696  TonB-dependent receptor  29.04 
 
 		 620 aa  197  4.0000000000000005e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.405494  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3783  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  28.59 
 
 		 615 aa  192  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000781057  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1186  TonB-dependent receptor  28.48 
 
 		 634 aa  190  8e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.874956  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2514  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 		 632 aa  190  8e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0198  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  29.56 
 
 		 631 aa  190  1e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194454  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0790  TonB-dependent receptor  28.35 
 
 		 614 aa  188  4e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.270148  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0192  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  29.32 
 
 		 631 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.051851  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  29.53 
 
 		 628 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0132  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  27.73 
 
 		 631 aa  177  4e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00107286  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2648  TonB-dependent receptor  28.24 
 
 		 602 aa  177  7e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47800  putative tonB-dependent receptor  27.79 
 
 		 616 aa  176  9e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173562  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0525  B12 family TonB-dependent receptor  28 
 
 		 641 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  26.14 
 
 		 617 aa  173  7.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  27.08 
 
 		 1023 aa  173  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0250  TonB-dependent receptor plug  27.13 
 
 		 597 aa  172  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0122  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 624 aa  172  2e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1926  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 627 aa  170  9e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.201933  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5008  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 627 aa  169  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.877838 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2815  TonB-dependent receptor  28.81 
 
 		 619 aa  167  5.9999999999999996e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.186668  normal  0.478128 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4382  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 635 aa  165  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.429499  normal  0.246253 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1537  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 593 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00891985  normal  0.735799 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4119  TonB-dependent vitamin B12 receptor  27.14 
 
 		 616 aa  164  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1459  TonB-dependent receptor  23.92 
 
 		 647 aa  164  7e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.208108  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0654  TonB-dependent receptor  27.48 
 
 		 638 aa  163  9e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.561107  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002156  outer membrane vitamin B12 receptor BtuB  25.67 
 
 		 611 aa  160  5e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000122091  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1368  TonB-dependent receptor  29.17 
 
 		 627 aa  160  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.249969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2342  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 611 aa  159  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.499314  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2667  TonB-dependent receptor  27.38 
 
 		 627 aa  159  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0986558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1012  TonB-dependent receptor  25.66 
 
 		 626 aa  159  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0571  TonB-dependent receptor plug  26.38 
 
 		 628 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.487741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1096  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 626 aa  157  7e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2209  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 624 aa  157  9e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0578  TonB-dependent receptor plug  27.29 
 
 		 627 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0834  vitamin B12 receptor BtuB, putative  26.56 
 
 		 680 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.162621  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0461  TonB-dependent vitamin B12 receptor  26.38 
 
 		 613 aa  152  3e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00224002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3757  TonB-dependent receptor plug  27.68 
 
 		 612 aa  152  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2402  putative TonB dependent vitamin B12 outer membrane receptor  26.68 
 
 		 611 aa  151  5e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2789  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 		 698 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.973502 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4773  TonB-dependent receptor  27.09 
 
 		 624 aa  147  4.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.386912  normal  0.53176 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3502  putative outer membrane cobalamin receptor, TonB dependent  27.57 
 
 		 623 aa  147  5e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.86203  normal  0.929142 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1382  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 655 aa  147  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00890122  normal  0.0713693 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0560  TonB-dependent receptor, plug  27.59 
 
 		 623 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2092  TonB-dependent receptor  39.66 
 
 		 670 aa  147  8.000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1065  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 		 611 aa  147  8.000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.362217 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2547  TonB-dependent receptor plug  25.44 
 
 		 615 aa  147  9e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792273  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0995  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 629 aa  144  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.864049  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  27.1 
 
 		 663 aa  144  7e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2400  outer membrane receptor protein  27.78 
 
 		 621 aa  144  8e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.901841 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  27.37 
 
 		 663 aa  143  9e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  26.68 
 
 		 666 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1028  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  28.45 
 
 		 685 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1187  outer membrane receptor for transport of vitamin B  28.45 
 
 		 821 aa  142  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.096047  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1035  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  28.45 
 
 		 685 aa  142  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127064  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07860  TonB-dependent vitamin B12 receptor  26.2 
 
 		 630 aa  141  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.239557  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  24.92 
 
 		 613 aa  141  3.9999999999999997e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2720  iron complex outermembrane recepter protein  26.2 
 
 		 631 aa  141  4.999999999999999e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.83965  normal  0.415567 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2165  TonB-dependent vitamin B12 receptor  24.72 
 
 		 616 aa  141  4.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3735  TonB-dependent receptor plug  25.79 
 
 		 628 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000331916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1639  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  28.28 
 
 		 685 aa  140  7e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.18341  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2327  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  28.28 
 
 		 685 aa  140  7e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.52571  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2959  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  28.28 
 
 		 685 aa  140  7e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0685  vitamin B12 receptor BtuB, putative  28.28 
 
 		 685 aa  139  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.174842  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1826  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 621 aa  139  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.568285  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0509  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  26.02 
 
 		 614 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.194967  normal  0.193806 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3730  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 637 aa  138  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0159073  normal  0.0113192 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  24.83 
 
 		 640 aa  136  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0963  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 		 614 aa  135  3e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0521  TonB-dependent receptor  27.9 
 
 		 617 aa  134  3.9999999999999996e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0721  Outer membrane cobalamin receptor protein-like  25.65 
 
 		 640 aa  134  5e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02166  TonB-dependent outer membrane Receptor  25.62 
 
 		 619 aa  134  6.999999999999999e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4483  TonB-dependent receptor  24.25 
 
 		 737 aa  133  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.00000231942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2213  TonB-dependent receptor plug  25.87 
 
 		 621 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.604823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  24.11 
 
 		 709 aa  132  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1502  TonB-dependent receptor  25.3 
 
 		 613 aa  130  6e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 		 648 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>