More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4630 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0239  TonB-dependent copper receptor  58.08 
 
 		 681 aa  805    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1392  TonB-dependent copper receptor  50.54 
 
 		 691 aa  650    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2368  TonB-dependent copper receptor  60.25 
 
 		 749 aa  803    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.468955  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4838  TonB-dependent copper receptor  93.9 
 
 		 688 aa  1336    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.412488 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40090  outer membrane copper transport protein  63.95 
 
 		 726 aa  865    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3613  TonB-dependent copper receptor  58.92 
 
 		 710 aa  786    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0999  nosA protein, putative  58.05 
 
 		 676 aa  783    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0427  TonB-dependent copper receptor  58.86 
 
 		 745 aa  798    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2507  TonB-dependent copper receptor  59.16 
 
 		 745 aa  803    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0821  TonB-dependent copper receptor  60.25 
 
 		 749 aa  803    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0596  TonB-dependent copper receptor  77.26 
 
 		 710 aa  1108    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.834175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4630  TonB-dependent copper receptor  100 
 
 		 688 aa  1416    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102852 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2174  TonB-dependent copper receptor  58.4 
 
 		 710 aa  786    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0477  TonB-dependent copper receptor  58.86 
 
 		 745 aa  798    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.157724  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0638  TonB-dependent copper receptor  60.68 
 
 		 753 aa  814    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3205  TonB-dependent copper receptor  58.44 
 
 		 687 aa  788    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.742642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4075  TonB-dependent copper receptor  59.18 
 
 		 725 aa  754    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4669  TonB-dependent copper receptor  59.54 
 
 		 713 aa  798    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0923349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1325  TonB-dependent copper receptor  72.69 
 
 		 719 aa  1038    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4894  TonB-dependent copper receptor  93.75 
 
 		 688 aa  1334    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386711  normal  0.630866 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4607  TonB-dependent copper receptor  54.62 
 
 		 724 aa  736    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0702651  normal  0.0726755 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4452  TonB-dependent copper receptor  58.92 
 
 		 710 aa  786    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.876031  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2454  TonB-dependent copper receptor  60.47 
 
 		 684 aa  831    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.119589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3427  TonB-dependent copper receptor  59.26 
 
 		 698 aa  753    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.40271  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1806  TonB-dependent copper receptor  58.86 
 
 		 745 aa  798    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3953  TonB-dependent copper receptor OprC  57.93 
 
 		 681 aa  804    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3292  TonB-dependent copper receptor  59.23 
 
 		 709 aa  793    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.49865 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0941  TonB-dependent copper receptor  57.9 
 
 		 676 aa  780    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.591251  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15070  outer membrane copper receptor OprC  72.54 
 
 		 723 aa  1034    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127729 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4716  TonB-dependent copper receptor  94.19 
 
 		 688 aa  1343    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.129936 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2981  TonB-dependent copper receptor  56.75 
 
 		 669 aa  778    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.724806  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3914  TonB-dependent copper receptor  58.92 
 
 		 710 aa  786    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3712  TonB-dependent copper receptor OprC  58.42 
 
 		 686 aa  806    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3808  TonB-dependent copper receptor  59.23 
 
 		 687 aa  792    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.494445  normal  0.660377 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3668  TonB-dependent copper receptor  44.49 
 
 		 686 aa  551  1e-155  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.743452  normal  0.496513 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0452  TonB-dependent copper receptor  40.35 
 
 		 662 aa  462  9.999999999999999e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0351  TonB-dependent copper receptor  41.7 
 
 		 661 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4157  TonB-dependent copper receptor  41.82 
 
 		 667 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0630  TonB-dependent receptor  39.53 
 
 		 668 aa  439  1e-121  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0470  TonB-dependent copper receptor  39.12 
 
 		 663 aa  432  1e-120  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0622  TonB-dependent copper receptor  41.06 
 
 		 668 aa  429  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3408  TonB-dependent copper receptor  40.72 
 
 		 668 aa  429  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.233269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1039  TonB-dependent copper receptor  38.31 
 
 		 667 aa  431  1e-119  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.377632 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3560  TonB-dependent copper receptor  33.84 
 
 		 695 aa  319  1e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0677  TonB-dependent receptor  33.58 
 
 		 672 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0620216  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2086  nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  30.98 
 
 		 665 aa  270  8e-71  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.0000285057  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1564  TonB-dependent receptor  28.92 
 
 		 697 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.298375  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3452  TonB-dependent receptor  29.17 
 
 		 699 aa  223  7e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0303  TonB-dependent receptor  29.61 
 
 		 681 aa  185  3e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1476  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 		 668 aa  164  6e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0512  TonB-dependent receptor  28.15 
 
 		 702 aa  160  6e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0165393  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0655  TonB-dependent receptor  27.26 
 
 		 768 aa  159  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2982  TonB dependent receptor, putative  26.46 
 
 		 699 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0484  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 702 aa  156  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.766292  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2133  TonB-dependent receptor  25.91 
 
 		 760 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.207681  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0517  TonB-dependent receptor  27.87 
 
 		 702 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.392314  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0377  TonB-dependent receptor  23.91 
 
 		 661 aa  147  6e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.337812  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2653  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 		 716 aa  124  5e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0619  TonB-dependent receptor  22.69 
 
 		 673 aa  116  2.0000000000000002e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.000000000412727  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0541  TonB-dependent receptor  23.32 
 
 		 718 aa  111  4.0000000000000004e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2221  TonB-dependent receptor  23.67 
 
 		 793 aa  110  6e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0217178  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3340  TonB-dependent receptor  24.69 
 
 		 685 aa  109  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0619  TonB-dependent receptor  25.23 
 
 		 767 aa  110  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1606  TonB-dependent receptor  21.35 
 
 		 696 aa  106  1e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000872297  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  24.79 
 
 		 698 aa  105  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0043  TonB-dependent receptor  23.36 
 
 		 684 aa  105  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2027  TonB-dependent receptor  23.89 
 
 		 769 aa  99  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0554382  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2848  TonB-dependent receptor  24.64 
 
 		 729 aa  97.4  8e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2193  TonB-dependent receptor  22.06 
 
 		 780 aa  96.7  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.968767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1053  TonB-dependent receptor  23.74 
 
 		 705 aa  96.7  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0425  TonB-dependent receptor domain-containing protein  22.67 
 
 		 625 aa  96.3  2e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00623502  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0440  TonB-dependent receptor, putative  22.02 
 
 		 775 aa  93.2  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03808  TonB-dependent receptor  24.79 
 
 		 705 aa  92.8  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2293  TonB-dependent receptor  23.73 
 
 		 685 aa  92  4e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2550  TonB-dependent receptor plug  24.33 
 
 		 775 aa  90.9  8e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.182788  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4088  TonB-dependent receptor  22.71 
 
 		 750 aa  89  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001257  TonB-dependent heme receptor HutR  26.77 
 
 		 712 aa  88.6  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.299412  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0965  TonB-dependent receptor  22.47 
 
 		 773 aa  87.8  6e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.195804  normal  0.489685 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0422  TonB-dependent receptor  23.66 
 
 		 744 aa  87.8  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.328306  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3750  TonB-dependent receptor  23.73 
 
 		 741 aa  87.4  8e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0763  TonB-dependent receptor  29.22 
 
 		 721 aa  85.9  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.72696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05130  hypothetical protein  26.85 
 
 		 248 aa  82  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0645  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  28.9 
 
 		 750 aa  81.3  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0446508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2202  TonB-dependent receptor  21.97 
 
 		 714 aa  80.9  0.00000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.113523  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0496  TonB-dependent receptor  22.22 
 
 		 713 aa  80.9  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4077  TonB-dependent receptor, putative  21.42 
 
 		 708 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1105  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor:TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  29.86 
 
 		 859 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1804  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 		 683 aa  77.8  0.0000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0894155  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0465  TonB-dependent receptor  22.57 
 
 		 758 aa  77.4  0.0000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4379  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  28.57 
 
 		 861 aa  75.1  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0484  TonB-dependent receptor  23.15 
 
 		 749 aa  74.7  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698636  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4218  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  29.34 
 
 		 862 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0621  hypothetical protein  50 
 
 		 185 aa  72  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.495613 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3630  TonB-dependent receptor  21.71 
 
 		 713 aa  71.6  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4299  TonB-dependent receptor  21.82 
 
 		 766 aa  71.2  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.570809  normal  0.101344 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  22.59 
 
 		 656 aa  70.5  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5426  outer membrane hemin receptor  30.94 
 
 		 764 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1005  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  27.8 
 
 		 862 aa  68.2  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4510  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  27.3 
 
 		 867 aa  67.4  0.0000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531112  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1284  TonB-dependent outer membrane heme receptor  26.7 
 
 		 857 aa  67.4  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>