More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0176 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0176  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 763 aa  1540    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7106  TonB-dependent receptor  38.68 
 
 		 818 aa  496  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.385774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1314  TonB-dependent receptor  36.86 
 
 		 735 aa  432  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  32.27 
 
 		 759 aa  374  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1366  tonB-linked outer membrane receptor  32.56 
 
 		 811 aa  363  5.0000000000000005e-99  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.351505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4561  TonB-dependent receptor  31.98 
 
 		 824 aa  361  2e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0251417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1938  TonB-dependent receptor  29.71 
 
 		 801 aa  294  5e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.17436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3288  TonB-dependent receptor  29.59 
 
 		 730 aa  269  2e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4568  TonB-dependent receptor  28.17 
 
 		 776 aa  265  3e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1572  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 		 780 aa  259  1e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0693034  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0204  TonB-dependent receptor  30.39 
 
 		 678 aa  245  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3709  outer membrane receptor protein  28.13 
 
 		 776 aa  239  1e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0256653 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08651  hypothetical protein  27.19 
 
 		 799 aa  217  5.9999999999999996e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.950762  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0159  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 727 aa  185  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.630357  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0123  TonB-dependent receptor  25.32 
 
 		 719 aa  172  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.333478 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3383  TonB-dependent receptor, plug  25.06 
 
 		 758 aa  170  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2015  TonB-dependent receptor  25.34 
 
 		 732 aa  169  2e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1847  outer membrane hemin receptor  27.62 
 
 		 681 aa  168  2.9999999999999998e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1776  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 		 681 aa  163  1e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.506157  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1489  TonB-dependent receptor  26.29 
 
 		 689 aa  161  3e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000345981  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04789  TonB-dependent outer membrane Receptor  26.13 
 
 		 600 aa  161  5e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0342163  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0745  TonB-dependent receptor, plug  24.81 
 
 		 758 aa  159  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1446  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 680 aa  157  7e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.757282 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1083  TonB-dependent receptor  26.4 
 
 		 681 aa  157  9e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.654229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2604  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 		 706 aa  157  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000145461  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4738  hypothetical protein  26.06 
 
 		 687 aa  156  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122905  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3948  TonB-dependent receptor  25.23 
 
 		 730 aa  155  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32851 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54180  hypothetical protein  25.77 
 
 		 687 aa  154  5e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4359  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 		 682 aa  154  7e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503749 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4275  TonB-dependent receptor  26.26 
 
 		 685 aa  152  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1434  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 		 681 aa  151  4e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0287  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 		 681 aa  151  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.566628  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2644  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 		 698 aa  151  5e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.700465  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2505  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 		 698 aa  151  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.351153  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0251  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 		 698 aa  150  6e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.818078  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1631  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 		 751 aa  150  6e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.374553  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0939  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 		 751 aa  150  8e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0527  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 725 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1524  TonB-dependent receptor  24.03 
 
 		 692 aa  149  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.41177 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3871  TonB-dependent receptor  24.51 
 
 		 693 aa  148  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.284542 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0134  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 		 694 aa  145  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5866  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 		 694 aa  144  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.754568 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4331  TonB-dependent receptor  24.5 
 
 		 677 aa  144  6e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.467615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4185  TonB-dependent receptor  25.14 
 
 		 724 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.423461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2807  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 		 713 aa  142  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3927  TonB-dependent receptor  24.19 
 
 		 742 aa  140  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.889304  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4488  TonB-dependent receptor  23.22 
 
 		 835 aa  139  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4439  TonB-dependent receptor  24.19 
 
 		 677 aa  139  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 698 aa  138  3.0000000000000003e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1683  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 727 aa  138  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3717  TonB-dependent receptor  24.54 
 
 		 702 aa  136  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429203  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3051  TonB-dependent receptor  24.8 
 
 		 702 aa  136  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.385439 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2932  putative iron complex outermembrane recepter protein  23.85 
 
 		 685 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2033  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 695 aa  135  3.9999999999999996e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000947033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1842  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 693 aa  134  9e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1902  TonB-dependent receptor  22.64 
 
 		 751 aa  133  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.357712  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1865  TonB-dependent receptor  23.91 
 
 		 705 aa  131  5.0000000000000004e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1180  TonB-dependent receptor  24.78 
 
 		 705 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00173216  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0295  TonB-dependent receptor  23.23 
 
 		 797 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.141972  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3951  TonB-dependent receptor plug  24.93 
 
 		 731 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.478156  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4319  TonB-dependent receptor plug  24.93 
 
 		 723 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.133256  normal  0.357062 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0861  TonB-dependent receptor plug  25.44 
 
 		 714 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113091 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0551  TonB-dependent receptor  23.55 
 
 		 733 aa  116  1.0000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.629102  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2631  TonB-dependent receptor  24.94 
 
 		 799 aa  116  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0452445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4426  TonB-dependent receptor plug  24.45 
 
 		 707 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.831114  normal  0.397066 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4869  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 		 784 aa  115  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.188313  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5735  TonB-dependent receptor plug  23.33 
 
 		 676 aa  114  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3257  TonB-dependent receptor, plug  25.07 
 
 		 782 aa  110  8.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.393029  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1189  TonB-dependent receptor  23.99 
 
 		 702 aa  107  6e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000388358  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1405  TonB-dependent receptor  25.49 
 
 		 783 aa  107  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.148044  normal  0.749639 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1368  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 		 627 aa  104  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.249969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4192  TonB-dependent receptor  25.66 
 
 		 784 aa  103  9e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0530533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1214  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 734 aa  103  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.772889  normal  0.0390037 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4694  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 685 aa  103  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3627  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 		 744 aa  102  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000139063  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1010  TonB-dependent receptor  23.54 
 
 		 695 aa  100  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  24.65 
 
 		 652 aa  99.4  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1804  TonB-dependent receptor  25.33 
 
 		 683 aa  98.6  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0894155  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2054  TonB-dependent receptor plug  23.63 
 
 		 714 aa  97.4  9e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3695  outer membrane insertion C-terminal signal  31.6 
 
 		 758 aa  97.4  9e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.122908 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3505  outer membrane insertion C-terminal signal  30.43 
 
 		 758 aa  96.3  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3573  TonB-dependent receptor plug  30 
 
 		 758 aa  95.9  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1894  TonB-dependent receptor  24.42 
 
 		 709 aa  95.5  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.123894 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 836 aa  95.5  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0540  TonB-dependent receptor  27.74 
 
 		 699 aa  95.1  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  31.05 
 
 		 776 aa  94.4  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  33.8 
 
 		 747 aa  94  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6944  TonB-dependent receptor  24.79 
 
 		 757 aa  93.6  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03676  TonB-dependent receptor  28.52 
 
 		 821 aa  92.4  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00269599  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1978  outer membrane protein  28.04 
 
 		 801 aa  92.4  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.103542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2340  TonB-dependent receptor  27.11 
 
 		 836 aa  92.4  3e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000058543  normal  0.137103 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2510  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 689 aa  90.5  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0311712  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3729  TonB-dependent receptor, putative  28.33 
 
 		 778 aa  90.5  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000373318  normal  0.721597 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2550  TonB-dependent receptor plug  22.03 
 
 		 775 aa  88.2  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.182788  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2153  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 828 aa  85.5  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.453581  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0754  TonB-dependent receptor  39.23 
 
 		 709 aa  84.3  0.000000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0708  TonB-dependent receptor, plug  22.43 
 
 		 744 aa  82.8  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1567  TonB-dependent receptor  31.3 
 
 		 780 aa  81.6  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0615105  normal  0.74927 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1368  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 962 aa  81.6  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  29.28 
 
 		 795 aa  81.3  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>