More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1014 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_1064  TonB-dependent receptor  52.56 
 
 
661 aa  678    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00188221  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1142  TonB-dependent receptor-related protein  60.98 
 
 
650 aa  818    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.22175  normal  0.0805488 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1014  TonB-dependent receptor-related protein  100 
 
 
647 aa  1331    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1262  TonB-dependent receptor  68.4 
 
 
651 aa  938    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.612585  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1519  TonB-dependent receptor  51.05 
 
 
657 aa  639    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.148558  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1115  TonB-dependent receptor  57.98 
 
 
649 aa  781    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.95294  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1266  TonB-dependent receptor  33.44 
 
 
679 aa  330  3e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0152296  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2744  TonB-dependent receptor  34.95 
 
 
701 aa  318  2e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1231  TonB-dependent receptor  31.78 
 
 
678 aa  273  5.000000000000001e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5752  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 
746 aa  209  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0523831  hitchhiker  0.0000000000276247 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0028  TonB-dependent receptor  28.81 
 
 
641 aa  201  3e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1321  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 
724 aa  176  9e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1023  TonB-dependent receptor plug  26.72 
 
 
769 aa  164  6e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.302797  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1274  TonB-dependent receptor plug  25.89 
 
 
861 aa  154  5e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  28.03 
 
 
639 aa  153  8e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  25.48 
 
 
646 aa  145  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  25.91 
 
 
634 aa  145  3e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5364  TonB-dependent receptor plug  24.53 
 
 
729 aa  140  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  26.31 
 
 
634 aa  139  2e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1826  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 
621 aa  138  4e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.568285  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4770  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.92 
 
 
623 aa  137  7.000000000000001e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000262019  normal  0.0314633 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3189  TonB-dependent receptor, plug  26.74 
 
 
623 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4341  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.76 
 
 
614 aa  135  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139999  normal  0.582372 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4536  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.76 
 
 
614 aa  135  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.329693  hitchhiker  0.0000000267555 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4372  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.76 
 
 
614 aa  134  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0258695  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1347  iron compound TonB-dependent receptor, putative  27.08 
 
 
620 aa  133  9e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4459  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.62 
 
 
614 aa  133  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0519388  hitchhiker  0.0000109547 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0521  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 
617 aa  132  3e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4462  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.47 
 
 
614 aa  131  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0180001  hitchhiker  0.0000000000824718 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0123  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.94 
 
 
631 aa  131  5.0000000000000004e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000105264  normal  0.11479 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4020  TonB-dependent vitamin B12 receptor  24.52 
 
 
614 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348064  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4413  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25 
 
 
614 aa  130  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000903793  hitchhiker  0.00898611 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4050  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.52 
 
 
614 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00780594  decreased coverage  0.000540594 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4200  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.52 
 
 
614 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000101627  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1306  putative iron compound TonB-dependent receptor  26.72 
 
 
697 aa  130  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4507  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.37 
 
 
614 aa  128  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000315572  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5430  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.07 
 
 
614 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0043717  normal  0.0207602 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2789  TonB-dependent receptor  26.83 
 
 
698 aa  128  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.973502 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2342  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 
611 aa  126  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.499314  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0654  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 
638 aa  124  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.561107  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  25.11 
 
 
613 aa  123  8e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0790  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 
614 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.270148  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3783  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.89 
 
 
615 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000781057  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  24.45 
 
 
656 aa  120  7e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  23.62 
 
 
659 aa  120  7e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  23.49 
 
 
663 aa  120  9e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  23.49 
 
 
663 aa  120  9e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0995  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 
629 aa  120  9e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.864049  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  23.49 
 
 
663 aa  120  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  23.49 
 
 
663 aa  120  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0812  TonB-dependent receptor plug  24.22 
 
 
659 aa  120  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.183722  normal  0.24775 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  23.49 
 
 
663 aa  120  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  23.49 
 
 
663 aa  120  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0192  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.77 
 
 
631 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.051851  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1925  TonB-dependent receptor  24.38 
 
 
642 aa  118  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55144  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  25.17 
 
 
633 aa  118  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03647  TonB-dependent receptor  24.34 
 
 
640 aa  118  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00288042  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3502  putative outer membrane cobalamin receptor, TonB dependent  25.87 
 
 
623 aa  117  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.86203  normal  0.929142 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1537  TonB-dependent receptor  25.32 
 
 
593 aa  117  6.9999999999999995e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00891985  normal  0.735799 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2686  TonB-dependent receptor plug  24.29 
 
 
650 aa  116  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.262602  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002156  outer membrane vitamin B12 receptor BtuB  23.94 
 
 
611 aa  116  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000122091  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  24.91 
 
 
650 aa  115  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0198  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  23.88 
 
 
631 aa  115  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194454  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2165  TonB-dependent vitamin B12 receptor  23.31 
 
 
616 aa  115  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2213  TonB-dependent receptor plug  26.08 
 
 
621 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.604823  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  23.85 
 
 
641 aa  114  5e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  24.56 
 
 
650 aa  113  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  24.27 
 
 
618 aa  113  9e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  23.75 
 
 
650 aa  113  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  24.73 
 
 
650 aa  113  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3075  outer membrane receptor FepA  24.73 
 
 
724 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.203578  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1110  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 
625 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000459108  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  24.56 
 
 
650 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 
709 aa  112  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1096  TonB-dependent receptor  23.57 
 
 
626 aa  112  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3730  TonB-dependent receptor  24.21 
 
 
637 aa  112  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0159073  normal  0.0113192 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2919  outer membrane receptor FepA  24.73 
 
 
724 aa  110  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.91274  normal  0.0854265 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2815  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 
619 aa  110  7.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.186668  normal  0.478128 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1206  putative TonB-dependent receptor  24.82 
 
 
688 aa  110  8.000000000000001e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1012  TonB-dependent receptor  23.42 
 
 
626 aa  110  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2889  outer membrane receptor FepA  24.93 
 
 
724 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1187  outer membrane receptor for transport of vitamin B  26.09 
 
 
821 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.096047  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2972  outer membrane receptor FepA  25.07 
 
 
724 aa  109  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0370731 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0834  vitamin B12 receptor BtuB, putative  26.48 
 
 
680 aa  108  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.162621  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4020  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  23.82 
 
 
615 aa  108  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000194494  normal  0.015002 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1028  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  26.05 
 
 
685 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1035  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  26.05 
 
 
685 aa  108  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127064  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1339  TonB-dependent receptor  23.66 
 
 
714 aa  108  4e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.368228 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0969  outer membrane receptor for transport of vitamin B  25.25 
 
 
645 aa  108  4e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.01117 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2953  outer membrane receptor FepA  24.79 
 
 
724 aa  108  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.246738  hitchhiker  0.000000000736095 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1926  TonB-dependent receptor  23.91 
 
 
627 aa  108  4e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.201933  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1639  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  26.17 
 
 
685 aa  108  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.18341  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1004  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 
618 aa  108  4e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0684927  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2327  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  26.17 
 
 
685 aa  108  4e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.52571  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2959  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  26.17 
 
 
685 aa  108  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  23.12 
 
 
635 aa  107  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1301  TonB-dependent receptor  23.81 
 
 
634 aa  107  7e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1162  tonB-dependent vitamin B12 receptor  24.11 
 
 
622 aa  107  8e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0685  vitamin B12 receptor BtuB, putative  26.17 
 
 
685 aa  107  8e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.174842  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0963  TonB-dependent receptor  25.66 
 
 
614 aa  107  8e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>