More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1231 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1231  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 678 aa  1391    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1266  TonB-dependent receptor  50.43 
 
 		 679 aa  686    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0152296  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2744  TonB-dependent receptor  35.01 
 
 		 701 aa  334  4e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1115  TonB-dependent receptor  33.95 
 
 		 649 aa  310  5e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.95294  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1064  TonB-dependent receptor  34.05 
 
 		 661 aa  298  2e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00188221  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1262  TonB-dependent receptor  32.21 
 
 		 651 aa  289  1e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.612585  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1014  TonB-dependent receptor-related protein  31.93 
 
 		 647 aa  288  2.9999999999999996e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1519  TonB-dependent receptor  34.44 
 
 		 657 aa  284  4.0000000000000003e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.148558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1142  TonB-dependent receptor-related protein  32.22 
 
 		 650 aa  280  5e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.22175  normal  0.0805488 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0028  TonB-dependent receptor  30.28 
 
 		 641 aa  214  4.9999999999999996e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5752  TonB-dependent receptor  29.17 
 
 		 746 aa  207  6e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0523831  hitchhiker  0.0000000000276247 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1023  TonB-dependent receptor plug  27.2 
 
 		 769 aa  197  5.000000000000001e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.302797  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1321  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 724 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1274  TonB-dependent receptor plug  27.62 
 
 		 861 aa  179  1e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5364  TonB-dependent receptor plug  26.94 
 
 		 729 aa  175  2.9999999999999996e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  26.97 
 
 		 640 aa  155  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  26.02 
 
 		 656 aa  144  4e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  25.58 
 
 		 650 aa  144  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  25.58 
 
 		 650 aa  144  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  25.58 
 
 		 650 aa  143  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  25.44 
 
 		 650 aa  143  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  25.96 
 
 		 634 aa  143  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  25.58 
 
 		 650 aa  143  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 		 648 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  24.96 
 
 		 698 aa  140  1e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 657 aa  139  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  25.39 
 
 		 659 aa  137  5e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 649 aa  137  5e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 635 aa  137  9e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  25.34 
 
 		 653 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  25 
 
 		 663 aa  134  5e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  25 
 
 		 663 aa  134  5e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  25.21 
 
 		 663 aa  134  5e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  25.21 
 
 		 663 aa  133  9e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  25.21 
 
 		 663 aa  133  9e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  25.21 
 
 		 663 aa  133  9e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1806  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 		 649 aa  131  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  25.71 
 
 		 641 aa  130  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  25.33 
 
 		 656 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 681 aa  130  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 634 aa  129  2.0000000000000002e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1541  putative outer membrane receptor  25.3 
 
 		 665 aa  128  3e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2748  putative outer membrane receptor  25.3 
 
 		 665 aa  128  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0123  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  26.96 
 
 		 631 aa  128  3e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000105264  normal  0.11479 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2666  putative outer membrane receptor  25.3 
 
 		 665 aa  128  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3795  TonB-dependent receptor  25.8 
 
 		 740 aa  128  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837422  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2412  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 		 662 aa  127  5e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.115111  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2423  TonB-dependent receptor  27.61 
 
 		 662 aa  127  5e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075703  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2531  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 680 aa  127  7e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4281  hypothetical protein  28.85 
 
 		 700 aa  127  8.000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1347  iron compound TonB-dependent receptor, putative  27.63 
 
 		 620 aa  125  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  25.62 
 
 		 646 aa  125  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4341  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.52 
 
 		 614 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139999  normal  0.582372 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0570  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system protein  26.03 
 
 		 675 aa  125  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.168599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1306  putative iron compound TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 697 aa  125  4e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  24.9 
 
 		 653 aa  124  5e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1861  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 		 653 aa  124  5e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0473101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1691  TonB-dependent receptor, plug  25.44 
 
 		 732 aa  124  7e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524758  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2171  TonB-dependent receptor  27.8 
 
 		 649 aa  124  8e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1162  tonB-dependent vitamin B12 receptor  24.43 
 
 		 622 aa  123  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3738  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 665 aa  123  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  0.0543439 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1935  TonB-dependent receptor  26.65 
 
 		 662 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00717608  normal  0.914131 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  25.85 
 
 		 633 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  25.38 
 
 		 613 aa  122  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3815  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 658 aa  122  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1826  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 621 aa  122  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.568285  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3962  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 		 698 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4368  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 		 799 aa  121  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  25.43 
 
 		 665 aa  120  7e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2648  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 602 aa  120  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3189  TonB-dependent receptor, plug  25.5 
 
 		 623 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4233  TonB-dependent receptor  27.16 
 
 		 799 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3696  TonB-dependent receptor  26.28 
 
 		 620 aa  119  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.405494  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2751  TonB-dependent receptor plug  25 
 
 		 722 aa  118  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.930878  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1804  TonB-dependent receptor  25.44 
 
 		 683 aa  118  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0894155  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0812  TonB-dependent receptor plug  25.99 
 
 		 659 aa  118  3.9999999999999997e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.183722  normal  0.24775 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1518  TonB-dependent receptor plug  24.52 
 
 		 727 aa  117  5e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4161  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 799 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1096  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 		 626 aa  117  7.999999999999999e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2400  outer membrane receptor protein  25.68 
 
 		 621 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.901841 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0899  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  27.04 
 
 		 696 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  25.54 
 
 		 663 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1357  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  26.97 
 
 		 696 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0456407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2077  TonB-dependent receptor  25.8 
 
 		 742 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3430  outer membrane receptor FepA  25.16 
 
 		 759 aa  115  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101807 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0654  TonB-dependent receptor  26.28 
 
 		 638 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.561107  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4483  TonB-dependent receptor  23.69 
 
 		 737 aa  115  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.00000231942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3730  TonB-dependent receptor  24.96 
 
 		 637 aa  114  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0159073  normal  0.0113192 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1925  TonB-dependent receptor  23.73 
 
 		 642 aa  114  5e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55144  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1110  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 		 625 aa  114  5e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000459108  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1115  TonB-dependent receptor  25.7 
 
 		 705 aa  114  6e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1502  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 		 613 aa  114  7.000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02166  TonB-dependent outer membrane Receptor  25.18 
 
 		 619 aa  113  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1253  TonB-dependent receptor, plug  27.15 
 
 		 702 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.98016  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1012  TonB-dependent receptor  24.96 
 
 		 626 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2209  TonB-dependent receptor  24.46 
 
 		 624 aa  111  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0221  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  24.39 
 
 		 755 aa  111  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  25.56 
 
 		 655 aa  110  7.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0790  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 614 aa  110  8.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.270148  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  24.96 
 
 		 663 aa  110  9.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>