More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1518 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1518  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 727 aa  1502    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2845  putative TonB-dependent receptor  49.18 
 
 		 715 aa  709    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.328029 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2751  TonB-dependent receptor plug  93.12 
 
 		 722 aa  1401    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.930878  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0570  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system protein  28.78 
 
 		 675 aa  235  3e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.168599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 653 aa  134  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3962  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 		 698 aa  130  6e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  25.76 
 
 		 635 aa  129  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 		 698 aa  120  7e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5752  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 		 746 aa  120  9e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0523831  hitchhiker  0.0000000000276247 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  26.42 
 
 		 680 aa  120  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0806  TonB-dependent receptor  26.55 
 
 		 743 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 681 aa  114  5e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1266  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 		 679 aa  114  7.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0152296  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1231  TonB-dependent receptor  24.13 
 
 		 678 aa  114  8.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2591  hemin receptor precursor, TonB-dependent outer membrane uptake protein  23.44 
 
 		 687 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.125278 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  25.21 
 
 		 650 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  25.08 
 
 		 650 aa  110  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  25.04 
 
 		 650 aa  110  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  25.04 
 
 		 650 aa  110  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  25.04 
 
 		 650 aa  110  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  24.52 
 
 		 656 aa  109  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  24.55 
 
 		 649 aa  108  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  26.06 
 
 		 663 aa  108  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  26.27 
 
 		 659 aa  108  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  25.55 
 
 		 641 aa  108  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  25.93 
 
 		 663 aa  107  6e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  25.93 
 
 		 663 aa  107  6e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  25.93 
 
 		 663 aa  107  6e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1659  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 714 aa  107  9e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000365717  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3738  TonB-dependent receptor  27.01 
 
 		 665 aa  107  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  0.0543439 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4379  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  23.96 
 
 		 861 aa  107  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1006  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  24.7 
 
 		 759 aa  106  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0899  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  25.54 
 
 		 696 aa  106  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1440  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.63 
 
 		 685 aa  105  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0111178  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1357  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  25.54 
 
 		 696 aa  105  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0456407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2686  TonB-dependent receptor plug  23.89 
 
 		 650 aa  103  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.262602  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2735  TonB-dependent receptor  33.2 
 
 		 641 aa  103  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00964506  normal  0.0993289 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  34.48 
 
 		 1023 aa  102  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4218  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  24.21 
 
 		 862 aa  102  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1493  putative TonB-dependent receptor  40.96 
 
 		 697 aa  101  5e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.404893  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0471  TonB-dependent receptor, putative, degenerate  43.7 
 
 		 704 aa  100  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  33.55 
 
 		 657 aa  100  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  32.9 
 
 		 648 aa  99.4  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1804  TonB-dependent receptor  23.76 
 
 		 683 aa  99.4  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0894155  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1023  TonB-dependent receptor plug  26.04 
 
 		 769 aa  99.4  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.302797  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  40.3 
 
 		 663 aa  98.2  5e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1284  TonB-dependent outer membrane heme receptor  24.66 
 
 		 857 aa  98.2  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  40.3 
 
 		 663 aa  98.2  5e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3294  TonB-dependent receptor, plug  43.61 
 
 		 676 aa  98.2  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0645  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  22.96 
 
 		 750 aa  97.1  9e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0446508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  36.67 
 
 		 655 aa  96.7  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47800  putative tonB-dependent receptor  32.2 
 
 		 616 aa  96.3  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1648  ferric receptor CfrA  44.2 
 
 		 696 aa  95.9  2e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1522  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1631  TonB-dependent receptor, plug  38.51 
 
 		 739 aa  95.9  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.371565 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  37.99 
 
 		 634 aa  95.5  3e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  34.98 
 
 		 640 aa  95.5  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0859  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  26.44 
 
 		 676 aa  95.1  4e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32697  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  38.89 
 
 		 653 aa  95.1  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4281  hypothetical protein  40.69 
 
 		 700 aa  95.1  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  30.8 
 
 		 759 aa  94.7  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  41.35 
 
 		 656 aa  94.4  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1826  TonB-dependent receptor  35.14 
 
 		 661 aa  94  8e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0922924  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0582  TonB-dependent receptor plug  24.42 
 
 		 664 aa  94  9e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000848459  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  32.73 
 
 		 634 aa  94  9e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2531  TonB-dependent receptor  36.6 
 
 		 680 aa  93.2  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1935  TonB-dependent receptor  36.6 
 
 		 662 aa  93.6  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00717608  normal  0.914131 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  39.22 
 
 		 652 aa  94  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2412  TonB-dependent receptor  36.6 
 
 		 662 aa  93.6  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.115111  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1741  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  29.03 
 
 		 661 aa  94  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000016514  normal  0.0458944 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0988  TonB-dependent receptor plug  37.95 
 
 		 806 aa  93.6  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.124203 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2423  TonB-dependent receptor  36.6 
 
 		 662 aa  93.6  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075703  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1925  TonB-dependent receptor  34.54 
 
 		 642 aa  93.2  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55144  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  36.42 
 
 		 646 aa  93.2  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  31.82 
 
 		 613 aa  93.2  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  38.24 
 
 		 665 aa  92.4  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1021  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  32.98 
 
 		 696 aa  92  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000037848  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3795  TonB-dependent receptor  36.11 
 
 		 740 aa  91.7  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837422  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1806  TonB-dependent receptor  34.08 
 
 		 649 aa  91.7  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0952  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  32.98 
 
 		 696 aa  92  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000391517  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3675  TonB-dependent receptor  40 
 
 		 737 aa  91.3  5e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0831004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0624  outer membrane receptor FepA  33.69 
 
 		 751 aa  91.3  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1861  TonB-dependent receptor  34.78 
 
 		 653 aa  91.3  6e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0473101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0697  outer membrane receptor FepA  33.69 
 
 		 751 aa  91.3  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3128  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  36.99 
 
 		 695 aa  91.3  7e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0847  ferric receptor CfrA  42.65 
 
 		 696 aa  90.9  9e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1111  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  32.42 
 
 		 754 aa  90.5  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.192516 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4004  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  31.34 
 
 		 681 aa  90.1  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.371484 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3889  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  31.98 
 
 		 676 aa  90.5  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000356309  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1261  ferric receptor CfrA  41.91 
 
 		 702 aa  90.5  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5052  TonB-dependent receptor  35.08 
 
 		 726 aa  90.1  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0923716  normal  0.422268 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4119  TonB-dependent vitamin B12 receptor  31.7 
 
 		 616 aa  90.5  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3327  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  31.58 
 
 		 688 aa  90.5  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0926253  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3801  TonB-dependent hemin receptor HmuR  31.98 
 
 		 676 aa  90.5  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0122148  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1803  ribosome-binding factor A  36.49 
 
 		 656 aa  90.5  1e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0638  outer membrane receptor FepA  33.16 
 
 		 751 aa  90.1  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2748  putative outer membrane receptor  34.88 
 
 		 665 aa  89.7  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4161  TonB-dependent receptor  38.35 
 
 		 799 aa  89.4  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1541  putative outer membrane receptor  34.88 
 
 		 665 aa  89.7  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0938  TonB-dependent receptor  36.24 
 
 		 698 aa  89.4  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00410623  normal  0.440689 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2171  TonB-dependent receptor  32.96 
 
 		 649 aa  89.4  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>