More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3675 on replicon NC_010815
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0778  TonB-dependent receptor  77.6 
 
 		 742 aa  1196    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3675  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 737 aa  1510    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0831004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1237  TonB-dependent receptor  55.03 
 
 		 736 aa  798    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2077  TonB-dependent receptor  44.86 
 
 		 742 aa  619  1e-176  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0492  TonB-dependent receptor  45.79 
 
 		 762 aa  612  9.999999999999999e-175  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4029  TonB-dependent receptor  38.21 
 
 		 719 aa  414  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2341  TonB-dependent receptor  34.21 
 
 		 764 aa  369  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1245  TonB-dependent receptor  29.41 
 
 		 761 aa  241  4e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384236  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0909  TonB-dependent siderophore receptor  28.85 
 
 		 794 aa  196  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.794253 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1598  TonB-dependent receptor  28.53 
 
 		 778 aa  193  7e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0220938  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0477  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 778 aa  192  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.642633  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0146  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 778 aa  192  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.580852  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2999  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 778 aa  192  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2630  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 778 aa  192  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1000  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 778 aa  192  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2935  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 778 aa  189  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0458457  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4136  TonB-dependent receptor  27.28 
 
 		 772 aa  189  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.163344  normal  0.377911 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4248  TonB-dependent receptor  27.28 
 
 		 772 aa  189  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3037  TonB-dependent receptor  27.94 
 
 		 778 aa  188  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000978239  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0870  TonB-dependent receptor  28.46 
 
 		 784 aa  187  5e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4626  TonB-dependent receptor  28.37 
 
 		 804 aa  187  6e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22062  normal  0.899276 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4118  TonB-dependent receptor  29.13 
 
 		 788 aa  187  7e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00057818  normal  0.54154 
 
 
-
 
NC_003296  RS05316  putative ferrisiderophore receptor protein  27.48 
 
 		 779 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.469557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0532  hypothetical protein  28.32 
 
 		 790 aa  184  6e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.203812  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1010  TonB-dependent receptor  28.32 
 
 		 790 aa  184  6e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0114301  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0882  TonB-dependent receptor  28.32 
 
 		 784 aa  182  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.72079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0970  TonB-dependent receptor  28.32 
 
 		 786 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.108903  normal  0.157986 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2388  TonB-dependent receptor  28.36 
 
 		 788 aa  179  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  29.09 
 
 		 702 aa  163  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  28.06 
 
 		 646 aa  159  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  27.04 
 
 		 640 aa  156  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3409  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 		 698 aa  151  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3276  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 		 698 aa  151  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0938  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 		 698 aa  151  4e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00410623  normal  0.440689 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0256  ferric siderophore receptor  25.39 
 
 		 807 aa  151  5e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.027165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1806  TonB-dependent receptor  27.71 
 
 		 649 aa  148  3e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2171  TonB-dependent receptor  27.49 
 
 		 649 aa  148  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1826  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 		 661 aa  147  5e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0922924  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0635  TonB-dependent receptor  24.75 
 
 		 874 aa  143  9.999999999999999e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1861  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 		 653 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0473101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2380  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 		 782 aa  141  3.9999999999999997e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.397663  normal  0.960991 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1838  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 		 796 aa  141  6e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2412  TonB-dependent receptor  26.68 
 
 		 662 aa  140  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.115111  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0469  iron-regulated outer membrane virulence protein, TonB receptor CfrA  24.64 
 
 		 698 aa  139  1e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.442515  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4774  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 760 aa  139  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594782  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1691  TonB-dependent receptor, plug  27.16 
 
 		 732 aa  139  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524758  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0041  putative TonB-dependent siderophore receptor  26.24 
 
 		 821 aa  137  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.130227 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1261  ferric receptor CfrA  25.77 
 
 		 702 aa  137  7.000000000000001e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2531  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 		 680 aa  137  8e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2423  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 		 662 aa  137  8e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075703  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2204  TonB-dependent receptor  26.28 
 
 		 845 aa  134  6e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1935  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 662 aa  134  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00717608  normal  0.914131 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1659  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 714 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000365717  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2882  TonB-dependent receptor protein  24.68 
 
 		 780 aa  128  4.0000000000000003e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00344491  hitchhiker  0.00617905 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0806  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 743 aa  128  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5052  TonB-dependent receptor  25.36 
 
 		 726 aa  125  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0923716  normal  0.422268 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1716  outer membrane receptor FepA  25.89 
 
 		 746 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  23 
 
 		 653 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0676  TonB-dependent receptor  22.35 
 
 		 732 aa  112  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.218893  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2900  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  25.61 
 
 		 686 aa  112  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.12655 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1472  TonB-dependent receptor  24.15 
 
 		 683 aa  112  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.907424  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0461  TonB-dependent vitamin B12 receptor  25.74 
 
 		 613 aa  109  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00224002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3962  TonB-dependent receptor  39.41 
 
 		 698 aa  109  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  33.64 
 
 		 686 aa  108  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0718  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  24.11 
 
 		 724 aa  107  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1481  TonB-dependent receptor  24.86 
 
 		 674 aa  106  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0173398  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3738  TonB-dependent receptor  42.76 
 
 		 665 aa  105  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  0.0543439 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1870  outer membrane receptor FepA  24.58 
 
 		 744 aa  105  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1372  TonB-dependent receptor plug  23.67 
 
 		 701 aa  104  7e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000623394  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1493  putative TonB-dependent receptor  39.11 
 
 		 697 aa  103  9e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.404893  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0471  TonB-dependent receptor, putative, degenerate  38.55 
 
 		 704 aa  103  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3496  outer membrane receptor FepA  24.44 
 
 		 744 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2242  outer membrane receptor FepA  25.49 
 
 		 744 aa  102  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.620188 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4255  TonB-dependent receptor  27.94 
 
 		 720 aa  102  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  39.49 
 
 		 663 aa  99.8  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  39.49 
 
 		 663 aa  99.8  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  39.49 
 
 		 663 aa  99.8  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  39.49 
 
 		 663 aa  99.8  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  39.49 
 
 		 663 aa  99.8  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  39.49 
 
 		 659 aa  99.8  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  39.49 
 
 		 663 aa  99.8  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2046  TonB-dependent receptor  34.67 
 
 		 713 aa  99.4  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183904 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1803  ribosome-binding factor A  42.66 
 
 		 656 aa  99  3e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  38.31 
 
 		 653 aa  99  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3189  TonB-dependent receptor, plug  37.43 
 
 		 623 aa  99  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02166  TonB-dependent outer membrane Receptor  32.09 
 
 		 619 aa  98.6  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  43.06 
 
 		 633 aa  97.8  6e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  38.93 
 
 		 613 aa  97.8  7e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  22.57 
 
 		 787 aa  97.4  7e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1006  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  36.5 
 
 		 759 aa  97.1  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1977  sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein CysA 2 (Sulfate-transporting ATPase 2)  36.77 
 
 		 326 aa  96.7  1e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0485  outer membrane receptor FepA  25.43 
 
 		 746 aa  96.7  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  41.91 
 
 		 681 aa  95.9  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  36.63 
 
 		 666 aa  96.3  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  36.63 
 
 		 666 aa  96.3  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1043  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  36.5 
 
 		 862 aa  96.3  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1005  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  35.37 
 
 		 862 aa  96.3  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  23.12 
 
 		 618 aa  96.3  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  37.8 
 
 		 666 aa  96.3  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  35.22 
 
 		 656 aa  95.9  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>