More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1804 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1804  TonB-dependent receptor  100 
 
 
683 aa  1376    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0894155  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2591  hemin receptor precursor, TonB-dependent outer membrane uptake protein  44.67 
 
 
687 aa  514  1e-144  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.125278 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  25.83 
 
 
698 aa  174  6.999999999999999e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0650  hemin receptor precursor  25.99 
 
 
676 aa  141  3.9999999999999997e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.332086 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3889  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.14 
 
 
676 aa  140  4.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000356309  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3801  TonB-dependent hemin receptor HmuR  26.14 
 
 
676 aa  140  4.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0122148  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0645  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  26.73 
 
 
750 aa  135  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0446508  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0655  TonB-dependent receptor  24.61 
 
 
768 aa  133  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2169  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.81 
 
 
694 aa  132  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.108589 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2133  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 
760 aa  131  5.0000000000000004e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.207681  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1741  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.43 
 
 
661 aa  126  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000016514  normal  0.0458944 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0440  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor family protein  26.74 
 
 
764 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1781  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.59 
 
 
769 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0859  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  26.63 
 
 
676 aa  119  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32697  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2089  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor family protein  26.74 
 
 
767 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.329074  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1115  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor family protein  26.74 
 
 
767 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5315  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  26.62 
 
 
767 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0824  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor family protein  26.74 
 
 
767 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.359227  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1826  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.74 
 
 
718 aa  118  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0529347  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0347  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor family protein  26.59 
 
 
759 aa  118  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3802  outer membrane heme/hemoglobin receptor ChuA  26.98 
 
 
660 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.241464 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4857  outer membrane heme/hemoglobin receptor ChuA  26.98 
 
 
660 aa  115  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.803267 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1231  TonB-dependent receptor  25.38 
 
 
678 aa  114  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0221  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  25.66 
 
 
755 aa  114  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3338  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  26.62 
 
 
755 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.275973  decreased coverage  0.000566863 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4772  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  26.06 
 
 
769 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.784759  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1206  putative TonB-dependent receptor  25.11 
 
 
688 aa  113  1.0000000000000001e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2139  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.64 
 
 
766 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2625  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 
657 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.980205  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4838  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.51 
 
 
757 aa  113  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.982435 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5431  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  25.29 
 
 
755 aa  111  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.447482  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5431  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.29 
 
 
755 aa  111  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.469015  normal  0.608312 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0519  heme transport protein HutA  24.48 
 
 
698 aa  109  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02166  TonB-dependent outer membrane Receptor  26.96 
 
 
619 aa  109  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4510  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  23.76 
 
 
867 aa  109  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531112  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3668  TonB-dependent copper receptor  27.98 
 
 
686 aa  107  8e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.743452  normal  0.496513 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000158  TonB-dependent heme and hemoglobin receptor HutA  23.26 
 
 
693 aa  105  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00497898  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1266  TonB-dependent receptor  24.33 
 
 
679 aa  106  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0152296  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3613  TonB-dependent copper receptor  25.88 
 
 
710 aa  105  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4452  TonB-dependent copper receptor  25.88 
 
 
710 aa  105  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.876031  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3914  TonB-dependent copper receptor  25.88 
 
 
710 aa  105  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1111  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.45 
 
 
754 aa  103  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.192516 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4379  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  24.22 
 
 
861 aa  103  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  23.76 
 
 
653 aa  102  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4218  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.24 
 
 
862 aa  101  5e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3082  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.38 
 
 
730 aa  101  5e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.25355  normal  0.407735 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2309  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  26.41 
 
 
666 aa  100  9e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4561  TonB-dependent receptor  24.74 
 
 
824 aa  100  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0251417  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3808  TonB-dependent copper receptor  26.36 
 
 
687 aa  100  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.494445  normal  0.660377 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2751  TonB-dependent receptor plug  24 
 
 
722 aa  98.6  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.930878  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0028  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 
641 aa  99  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2845  putative TonB-dependent receptor  22.94 
 
 
715 aa  98.6  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.328029 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0176  TonB-dependent receptor  25.33 
 
 
763 aa  97.8  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1564  TonB-dependent receptor  22.71 
 
 
697 aa  97.4  8e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.298375  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3292  TonB-dependent copper receptor  26.04 
 
 
709 aa  97.4  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.49865 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0677  TonB-dependent receptor  24.86 
 
 
672 aa  97.1  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0620216  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1284  TonB-dependent outer membrane heme receptor  22.69 
 
 
857 aa  95.5  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1105  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor:TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  24.1 
 
 
859 aa  95.5  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0719  TonB-dependent receptor, putative  24.92 
 
 
747 aa  95.1  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3452  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 
699 aa  95.1  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  27.31 
 
 
635 aa  95.1  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  21.93 
 
 
618 aa  94.4  6e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1518  TonB-dependent receptor plug  23.58 
 
 
727 aa  94.4  7e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1005  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  24.6 
 
 
862 aa  93.6  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3638  TonB-dependent receptor, putative  23.55 
 
 
739 aa  93.6  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000240989 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  23.43 
 
 
613 aa  93.6  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  26.81 
 
 
653 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3206  TonB-dependent receptor plug  23.51 
 
 
617 aa  93.2  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00965358  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3560  TonB-dependent copper receptor  25.87 
 
 
695 aa  93.2  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2174  TonB-dependent copper receptor  25.28 
 
 
710 aa  92.8  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25751  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1043  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  24.76 
 
 
862 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261279  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2929  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.16 
 
 
755 aa  92  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.56728  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  23.63 
 
 
639 aa  91.7  5e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4669  TonB-dependent copper receptor  25.84 
 
 
713 aa  90.9  8e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0923349  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1314  TonB-dependent receptor  22.4 
 
 
735 aa  90.1  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  23.42 
 
 
656 aa  89.4  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0790  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 
614 aa  89  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.270148  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  27.37 
 
 
680 aa  89.4  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  23.62 
 
 
657 aa  88.6  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3427  TonB-dependent copper receptor  26.32 
 
 
698 aa  88.6  4e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.40271  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4281  hypothetical protein  26.83 
 
 
700 aa  88.6  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1005  TonB-dependent receptor  23.47 
 
 
699 aa  87.8  6e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.828736  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2132  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  24.81 
 
 
689 aa  87  9e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.100193  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0351  TonB-dependent copper receptor  25.08 
 
 
661 aa  87  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01120  iron-regulated outer membrane virulence protein  23.45 
 
 
572 aa  87  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  23.94 
 
 
649 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4075  TonB-dependent copper receptor  26.17 
 
 
725 aa  86.7  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1039  TonB-dependent copper receptor  26.38 
 
 
667 aa  85.5  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.377632 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  24.07 
 
 
648 aa  85.1  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  24.27 
 
 
652 aa  85.1  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  23.39 
 
 
646 aa  84.7  0.000000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  25.22 
 
 
1023 aa  84.7  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0638  TonB-dependent copper receptor  25.48 
 
 
753 aa  84.3  0.000000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0570  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system protein  25.29 
 
 
675 aa  84.3  0.000000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.168599  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1366  tonB-linked outer membrane receptor  23.08 
 
 
811 aa  84.3  0.000000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.351505  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0460  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.87 
 
 
731 aa  84.3  0.000000000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0595  TonB-dependent receptor  22.74 
 
 
713 aa  84  0.000000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3815  TonB-dependent receptor  22.97 
 
 
658 aa  84  0.000000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2840  TonB-dependent siderophore receptor  22.57 
 
 
849 aa  83.2  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000068938  normal  0.338102 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  24.51 
 
 
640 aa  83.6  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>