More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0719 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_0719  TonB-dependent receptor, putative  100 
 
 
747 aa  1553    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2929  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  74.93 
 
 
755 aa  1165    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.56728  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3638  TonB-dependent receptor, putative  61.79 
 
 
739 aa  942    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000240989 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001257  TonB-dependent heme receptor HutR  28.12 
 
 
712 aa  277  6e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.299412  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0074  heme receptor HutR  29.82 
 
 
713 aa  275  3e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0136209  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0185  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  28.9 
 
 
728 aa  229  1e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0848528 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000158  TonB-dependent heme and hemoglobin receptor HutA  27.44 
 
 
693 aa  224  3e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00497898  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4379  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  27.27 
 
 
861 aa  211  3e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1111  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  26.75 
 
 
754 aa  211  5e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.192516 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05789  hypothetical protein  27.37 
 
 
712 aa  211  5e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0645  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  26.8 
 
 
750 aa  209  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0446508  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03722  outer membrane hemin receptor signal peptide protein  26.42 
 
 
741 aa  207  4e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000281288  normal  0.0836882 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4838  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.92 
 
 
757 aa  207  5e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.982435 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0519  heme transport protein HutA  27.39 
 
 
698 aa  204  3e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5431  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  25.16 
 
 
755 aa  204  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.447482  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5431  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.16 
 
 
755 aa  204  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.469015  normal  0.608312 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0221  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  25.49 
 
 
755 aa  203  8e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4510  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  28.72 
 
 
867 aa  201  6e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531112  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4218  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  27.17 
 
 
862 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1105  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor:TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  26.98 
 
 
859 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1043  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  26.77 
 
 
862 aa  196  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261279  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5315  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.47 
 
 
767 aa  194  4e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0824  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor family protein  26.24 
 
 
767 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.359227  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4772  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.88 
 
 
769 aa  191  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.784759  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1781  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.24 
 
 
769 aa  191  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0347  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor family protein  26.24 
 
 
759 aa  191  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0440  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor family protein  26.15 
 
 
764 aa  190  7e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1826  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.15 
 
 
718 aa  189  1e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0529347  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2089  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor family protein  26.15 
 
 
767 aa  189  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.329074  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2139  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.29 
 
 
766 aa  189  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1115  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor family protein  26.15 
 
 
767 aa  189  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62350  putative haem/haemoglobin uptake outer membrane receptor PhuR precursor  26.75 
 
 
764 aa  189  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1005  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.93 
 
 
862 aa  189  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3338  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.14 
 
 
755 aa  188  4e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.275973  decreased coverage  0.000566863 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3082  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  26 
 
 
730 aa  187  8e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.25355  normal  0.407735 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1284  TonB-dependent outer membrane heme receptor  26.43 
 
 
857 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5426  outer membrane hemin receptor  26.48 
 
 
764 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1006  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  26.72 
 
 
759 aa  185  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0855  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  24.84 
 
 
714 aa  174  3.9999999999999995e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.842782 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05128  hypothetical protein  29.13 
 
 
458 aa  171  5e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3145  TonB-dependent receptor plug  25.18 
 
 
787 aa  171  6e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.394815 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0138  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  26.01 
 
 
810 aa  164  5.0000000000000005e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0694219  normal  0.222818 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1213  TonB-dependent receptor  24.84 
 
 
799 aa  151  4e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3079  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.07 
 
 
749 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578184  normal  0.640721 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2813  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  23.71 
 
 
752 aa  145  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409295  normal  0.033455 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0337  TonB-dependent receptor  24.35 
 
 
800 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.770898  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2296  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  24.84 
 
 
734 aa  141  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.234344 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5070  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.59 
 
 
762 aa  140  6e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.565094  normal  0.157746 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0329  TonB-dependent receptor  24.21 
 
 
800 aa  139  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3271  outer membrane heme receptor  23.34 
 
 
728 aa  135  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403034  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  24.69 
 
 
698 aa  127  5e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2831  TonB-dependent receptor  23.83 
 
 
808 aa  125  4e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372733  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0582  heme uptake protein  23.97 
 
 
788 aa  124  9e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000461965  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0460  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.09 
 
 
731 aa  114  8.000000000000001e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2666  putative outer membrane receptor  22.58 
 
 
665 aa  103  8e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1541  putative outer membrane receptor  22.58 
 
 
665 aa  103  8e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  23.31 
 
 
652 aa  103  9e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2748  putative outer membrane receptor  22.44 
 
 
665 aa  102  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4004  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.66 
 
 
681 aa  101  5e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.371484 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  22.37 
 
 
663 aa  101  6e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  22.98 
 
 
666 aa  100  9e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  23.28 
 
 
649 aa  100  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3327  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.96 
 
 
688 aa  99.4  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0926253  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3235  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.97 
 
 
695 aa  98.2  5e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000386167  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  22.81 
 
 
666 aa  96.7  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  22.81 
 
 
666 aa  96.7  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  22.81 
 
 
666 aa  96.7  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  22.69 
 
 
665 aa  95.9  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0672  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.06 
 
 
694 aa  96.3  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41127  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1803  ribosome-binding factor A  23.98 
 
 
656 aa  96.3  2e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1804  TonB-dependent receptor  24.92 
 
 
683 aa  95.1  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0894155  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  22.59 
 
 
666 aa  94.7  6e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  22.44 
 
 
663 aa  94.7  6e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  24.8 
 
 
680 aa  94.7  6e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1021  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.87 
 
 
696 aa  93.6  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000037848  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0952  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.72 
 
 
696 aa  93.2  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000391517  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1266  TonB-dependent receptor  24.82 
 
 
679 aa  93.2  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0152296  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3669  heme transport protein  25 
 
 
697 aa  92.4  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05130  hypothetical protein  27.24 
 
 
248 aa  92.4  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1054  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.41 
 
 
696 aa  91.7  5e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000147815  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0859  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  32.11 
 
 
676 aa  89.7  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32697  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3338  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.59 
 
 
696 aa  89.4  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000719833  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1017  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.66 
 
 
704 aa  88.6  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0112436  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  21.39 
 
 
634 aa  88.2  5e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0966  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.12 
 
 
696 aa  87.8  6e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.942987  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  22.21 
 
 
688 aa  87.8  6e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  29.91 
 
 
617 aa  87.8  7e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2169  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.73 
 
 
694 aa  87  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.108589 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  21.08 
 
 
639 aa  85.9  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0279  ferric aerobactin receptor precursor  23.11 
 
 
723 aa  86.3  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.652222  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1741  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.59 
 
 
661 aa  86.7  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000016514  normal  0.0458944 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2531  TonB-dependent receptor  23.91 
 
 
680 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1451  TonB-dependent receptor  23.68 
 
 
730 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.322984  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  28.02 
 
 
613 aa  85.5  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0582  TonB-dependent receptor plug  24.16 
 
 
664 aa  84.7  0.000000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000848459  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2412  TonB-dependent receptor  23.54 
 
 
662 aa  84.7  0.000000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.115111  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06114  hypothetical protein  24.37 
 
 
490 aa  83.6  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02166  TonB-dependent outer membrane Receptor  29.32 
 
 
619 aa  83.2  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2423  TonB-dependent receptor  23.65 
 
 
662 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075703  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2209  TonB-dependent receptor  32.37 
 
 
624 aa  82.4  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.400233 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>