More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1314 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1314  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 735 aa  1493    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0176  TonB-dependent receptor  37.12 
 
 		 763 aa  431  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7106  TonB-dependent receptor  36.61 
 
 		 818 aa  430  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.385774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4561  TonB-dependent receptor  32.56 
 
 		 824 aa  339  9.999999999999999e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0251417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  29.91 
 
 		 759 aa  325  2e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1366  tonB-linked outer membrane receptor  29.73 
 
 		 811 aa  288  2e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.351505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3709  outer membrane receptor protein  28.84 
 
 		 776 aa  245  3e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0256653 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4568  TonB-dependent receptor  26.82 
 
 		 776 aa  221  3.9999999999999997e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1572  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 		 780 aa  218  4e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0693034  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1938  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 801 aa  217  5.9999999999999996e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.17436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3288  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 730 aa  208  3e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08651  hypothetical protein  26.99 
 
 		 799 aa  202  1.9999999999999998e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.950762  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0204  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 678 aa  200  9e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04789  TonB-dependent outer membrane Receptor  29.62 
 
 		 600 aa  176  1.9999999999999998e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0342163  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3383  TonB-dependent receptor, plug  25.32 
 
 		 758 aa  165  3e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3573  TonB-dependent receptor plug  24.71 
 
 		 758 aa  162  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1847  outer membrane hemin receptor  26.59 
 
 		 681 aa  159  3e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1776  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 		 681 aa  156  1e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.506157  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0745  TonB-dependent receptor, plug  24.46 
 
 		 758 aa  157  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3505  outer membrane insertion C-terminal signal  24.27 
 
 		 758 aa  151  4e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1083  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 681 aa  151  5e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.654229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3695  outer membrane insertion C-terminal signal  24.14 
 
 		 758 aa  150  6e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.122908 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4359  TonB-dependent receptor  25.15 
 
 		 682 aa  150  7e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503749 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1446  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 		 680 aa  150  9e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.757282 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1489  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 689 aa  145  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000345981  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54180  hypothetical protein  25.98 
 
 		 687 aa  145  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4275  TonB-dependent receptor  24.82 
 
 		 685 aa  145  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4738  hypothetical protein  25.75 
 
 		 687 aa  145  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122905  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4694  TonB-dependent receptor  24.82 
 
 		 685 aa  144  5e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1902  TonB-dependent receptor  24.42 
 
 		 751 aa  144  7e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.357712  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2510  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 		 689 aa  143  9.999999999999999e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0311712  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 698 aa  143  9.999999999999999e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4331  TonB-dependent receptor  24.96 
 
 		 677 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.467615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1180  TonB-dependent receptor  25.08 
 
 		 705 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00173216  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2604  TonB-dependent receptor  24.24 
 
 		 706 aa  141  4.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000145461  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3927  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 		 742 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.889304  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5866  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 		 694 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.754568 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1524  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 		 692 aa  139  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.41177 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0123  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 719 aa  138  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.333478 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3871  TonB-dependent receptor  24.32 
 
 		 693 aa  135  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.284542 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0295  TonB-dependent receptor  23.46 
 
 		 797 aa  134  9e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.141972  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4439  TonB-dependent receptor  24.61 
 
 		 677 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0159  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 727 aa  131  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.630357  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4426  TonB-dependent receptor plug  24.77 
 
 		 707 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.831114  normal  0.397066 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3051  TonB-dependent receptor  24.46 
 
 		 702 aa  131  5.0000000000000004e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.385439 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0527  TonB-dependent receptor  23.01 
 
 		 725 aa  127  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5735  TonB-dependent receptor plug  24.39 
 
 		 676 aa  127  8.000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0134  TonB-dependent receptor  24.45 
 
 		 694 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0861  TonB-dependent receptor plug  23.97 
 
 		 714 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113091 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3627  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 		 744 aa  120  7e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000139063  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2321  TonB-dependent receptor, putative  24.66 
 
 		 709 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.493897  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1894  TonB-dependent receptor  27.44 
 
 		 709 aa  120  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.123894 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2932  putative iron complex outermembrane recepter protein  23.92 
 
 		 685 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2033  TonB-dependent receptor  28.53 
 
 		 695 aa  114  9e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000947033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1842  TonB-dependent receptor  28.53 
 
 		 693 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2631  TonB-dependent receptor  23.46 
 
 		 799 aa  110  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0452445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1683  TonB-dependent receptor  23.31 
 
 		 727 aa  110  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3948  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 730 aa  110  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32851 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1387  TonB-dependent receptor plug  32.9 
 
 		 1008 aa  107  9e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.840954  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0754  TonB-dependent receptor  28.4 
 
 		 709 aa  104  6e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2054  TonB-dependent receptor plug  22.79 
 
 		 714 aa  103  9e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1865  TonB-dependent receptor  23.38 
 
 		 705 aa  102  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1978  outer membrane protein  20.88 
 
 		 801 aa  100  9e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.103542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0540  TonB-dependent receptor  27.81 
 
 		 699 aa  100  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0251  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 698 aa  99.4  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.818078  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1434  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 681 aa  99.4  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0287  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 681 aa  99.4  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.566628  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4185  TonB-dependent receptor  26.08 
 
 		 724 aa  99.8  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.423461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0939  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 751 aa  98.6  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1631  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 751 aa  98.6  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.374553  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2644  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 698 aa  99  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.700465  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2505  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 698 aa  99  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.351153  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2378  TonB-dependent receptor  22.37 
 
 		 719 aa  98.2  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2102  TonB-dependent receptor plug  22.37 
 
 		 719 aa  98.6  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121164 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4192  TonB-dependent receptor  24.47 
 
 		 784 aa  97.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0530533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2133  TonB-dependent receptor  22.24 
 
 		 760 aa  96.7  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.207681  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4319  TonB-dependent receptor plug  25.94 
 
 		 723 aa  96.3  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.133256  normal  0.357062 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3951  TonB-dependent receptor plug  25.94 
 
 		 731 aa  96.3  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.478156  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3235  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.2 
 
 		 695 aa  94  8e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000386167  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4488  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 		 835 aa  93.2  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3717  TonB-dependent receptor  22.96 
 
 		 702 aa  93.2  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429203  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0928  TonB-dependent receptor, plug  31.18 
 
 		 750 aa  92.4  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.228004  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6321  TonB-dependent receptor plug  21.96 
 
 		 732 aa  93.2  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4004  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.16 
 
 		 681 aa  91.7  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.371484 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2015  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 732 aa  91.3  6e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1804  TonB-dependent receptor  22.55 
 
 		 683 aa  90.1  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0894155  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02495  hypothetical protein  28.9 
 
 		 777 aa  90.1  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  29.8 
 
 		 1021 aa  89.7  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  31.02 
 
 		 795 aa  89.4  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4475  TonB-dependent receptor  30.62 
 
 		 955 aa  89.4  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0766  TonB-dependent receptor  32.78 
 
 		 763 aa  89  3e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0590392  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1023  TonB-dependent receptor plug  25.08 
 
 		 769 aa  88.6  4e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.302797  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 747 aa  87  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3669  heme transport protein  24.23 
 
 		 697 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3052  TonB-dependent receptor plug  27.69 
 
 		 753 aa  86.3  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03676  TonB-dependent receptor  29.55 
 
 		 821 aa  85.1  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00269599  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3735  TonB-dependent receptor plug  25.1 
 
 		 628 aa  84.7  0.000000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000331916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1214  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 734 aa  84.3  0.000000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.772889  normal  0.0390037 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1054  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.21 
 
 		 696 aa  84.3  0.000000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000147815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0594  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 708 aa  84.3  0.000000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.601286  hitchhiker  0.00250598 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>