More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5866 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1446  TonB-dependent receptor  53.82 
 
 		 680 aa  729    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.757282 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0287  TonB-dependent receptor  76.8 
 
 		 681 aa  1044    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.566628  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4185  TonB-dependent receptor  89.22 
 
 		 724 aa  1213    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.423461  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0251  TonB-dependent receptor  77.2 
 
 		 698 aa  1030    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.818078  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0159  TonB-dependent receptor  52.6 
 
 		 727 aa  691    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.630357  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0939  TonB-dependent receptor  77.2 
 
 		 751 aa  1033    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1083  TonB-dependent receptor  54.68 
 
 		 681 aa  734    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.654229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5866  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 694 aa  1404    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.754568 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4359  TonB-dependent receptor  53.53 
 
 		 682 aa  725    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503749 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1524  TonB-dependent receptor  96.4 
 
 		 692 aa  1353    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.41177 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2644  TonB-dependent receptor  77.05 
 
 		 698 aa  1029    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.700465  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0527  TonB-dependent receptor  77.23 
 
 		 725 aa  1030    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0123  TonB-dependent receptor  52.78 
 
 		 719 aa  666    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.333478 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3927  TonB-dependent receptor  99.14 
 
 		 742 aa  1395    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.889304  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4275  TonB-dependent receptor  53.58 
 
 		 685 aa  724    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4738  hypothetical protein  57.35 
 
 		 687 aa  781    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122905  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4331  TonB-dependent receptor  94.68 
 
 		 677 aa  1294    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.467615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3871  TonB-dependent receptor  94.81 
 
 		 693 aa  1313    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.284542 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54180  hypothetical protein  57.2 
 
 		 687 aa  780    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4439  TonB-dependent receptor  99.26 
 
 		 677 aa  1362    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2505  TonB-dependent receptor  77.05 
 
 		 698 aa  1028    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.351153  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1631  TonB-dependent receptor  77.2 
 
 		 751 aa  1031    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.374553  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1434  TonB-dependent receptor  76.8 
 
 		 681 aa  1044    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0134  TonB-dependent receptor  44.62 
 
 		 694 aa  589  1e-167  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3717  TonB-dependent receptor  45.27 
 
 		 702 aa  516  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429203  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2932  putative iron complex outermembrane recepter protein  44.71 
 
 		 685 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2807  TonB-dependent receptor  44.97 
 
 		 713 aa  511  1e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1683  TonB-dependent receptor  42.6 
 
 		 727 aa  507  9.999999999999999e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1189  TonB-dependent receptor  37.4 
 
 		 702 aa  389  1e-106  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000388358  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2604  TonB-dependent receptor  32.91 
 
 		 706 aa  364  3e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000145461  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3383  TonB-dependent receptor, plug  34.86 
 
 		 758 aa  363  6e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3627  TonB-dependent receptor  32.72 
 
 		 744 aa  356  1e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000139063  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2510  TonB-dependent receptor  35.75 
 
 		 689 aa  350  5e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0311712  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0745  TonB-dependent receptor, plug  33.14 
 
 		 758 aa  346  8e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3573  TonB-dependent receptor plug  32.99 
 
 		 758 aa  345  2e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1489  TonB-dependent receptor  34.32 
 
 		 689 aa  343  5e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000345981  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3695  outer membrane insertion C-terminal signal  32.47 
 
 		 758 aa  342  9e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.122908 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3505  outer membrane insertion C-terminal signal  32.84 
 
 		 758 aa  342  1e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1214  TonB-dependent receptor  35.1 
 
 		 734 aa  335  1e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.772889  normal  0.0390037 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1865  TonB-dependent receptor  35.41 
 
 		 705 aa  322  9.999999999999999e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0861  TonB-dependent receptor plug  33.43 
 
 		 714 aa  312  1e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113091 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4426  TonB-dependent receptor plug  34.98 
 
 		 707 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.831114  normal  0.397066 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03676  TonB-dependent receptor  30.31 
 
 		 821 aa  308  2.0000000000000002e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00269599  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1010  TonB-dependent receptor  31.75 
 
 		 695 aa  308  3e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1776  TonB-dependent receptor  31.98 
 
 		 681 aa  307  3e-82  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.506157  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1847  outer membrane hemin receptor  31.98 
 
 		 681 aa  305  1.0000000000000001e-81  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5735  TonB-dependent receptor plug  33.09 
 
 		 676 aa  306  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13940  TonB-dependent receptor  30.97 
 
 		 682 aa  305  2.0000000000000002e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.137662  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0754  TonB-dependent receptor  32.32 
 
 		 709 aa  298  3e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2033  TonB-dependent receptor  33.19 
 
 		 695 aa  297  4e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000947033  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2321  TonB-dependent receptor, putative  30.78 
 
 		 709 aa  296  7e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.493897  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1842  TonB-dependent receptor  33.29 
 
 		 693 aa  296  7e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3948  TonB-dependent receptor  32.05 
 
 		 730 aa  296  8e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32851 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1180  TonB-dependent receptor  33.73 
 
 		 705 aa  295  2e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00173216  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4488  TonB-dependent receptor  29.07 
 
 		 835 aa  294  5e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1902  TonB-dependent receptor  30.39 
 
 		 751 aa  287  4e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.357712  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4694  TonB-dependent receptor  32.74 
 
 		 685 aa  286  7e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0540  TonB-dependent receptor  31.91 
 
 		 699 aa  284  3.0000000000000004e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3051  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 702 aa  284  5.000000000000001e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.385439 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4319  TonB-dependent receptor plug  32.38 
 
 		 723 aa  282  2e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.133256  normal  0.357062 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3951  TonB-dependent receptor plug  32.38 
 
 		 731 aa  281  2e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.478156  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04789  TonB-dependent outer membrane Receptor  31.92 
 
 		 600 aa  280  6e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0342163  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1978  outer membrane protein  29.66 
 
 		 801 aa  280  7e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.103542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1894  TonB-dependent receptor  30.42 
 
 		 709 aa  271  2.9999999999999997e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.123894 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2102  TonB-dependent receptor plug  33.58 
 
 		 719 aa  270  8e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121164 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2378  TonB-dependent receptor  33.43 
 
 		 719 aa  269  1e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2054  TonB-dependent receptor plug  33.48 
 
 		 714 aa  267  5.999999999999999e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2266  putative outer membrane hemin/siderophore receptor protein  30.39 
 
 		 774 aa  263  8.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4192  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 784 aa  262  2e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0530533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4869  TonB-dependent receptor  30.53 
 
 		 784 aa  261  3e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.188313  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0708  TonB-dependent receptor, plug  29.93 
 
 		 744 aa  256  8e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2631  TonB-dependent receptor  30.26 
 
 		 799 aa  249  1e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0452445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3257  TonB-dependent receptor, plug  30.32 
 
 		 782 aa  249  1e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.393029  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3729  TonB-dependent receptor, putative  27.08 
 
 		 778 aa  248  4e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000373318  normal  0.721597 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1405  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 783 aa  247  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.148044  normal  0.749639 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0594  TonB-dependent receptor  31.67 
 
 		 708 aa  246  9e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.601286  hitchhiker  0.00250598 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4046  TonB-dependent receptor  30.29 
 
 		 789 aa  242  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.236751 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0295  TonB-dependent receptor  27.77 
 
 		 797 aa  238  4e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.141972  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0551  TonB-dependent receptor  28.49 
 
 		 733 aa  223  7e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.629102  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0270  TonB-dependent receptor  24.26 
 
 		 766 aa  192  1e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 759 aa  162  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0176  TonB-dependent receptor  24.22 
 
 		 763 aa  145  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1314  TonB-dependent receptor  24.92 
 
 		 735 aa  136  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2015  TonB-dependent receptor  26.18 
 
 		 732 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0859  TonB-dependent receptor plug  41.46 
 
 		 249 aa  129  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.152413  normal  0.604475 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1938  TonB-dependent receptor  24.51 
 
 		 801 aa  122  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.17436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2340  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 		 836 aa  122  3e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000058543  normal  0.137103 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4568  TonB-dependent receptor  23.88 
 
 		 776 aa  107  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 702 aa  100  6e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0069  iron-regulated outer membrane protein  33.94 
 
 		 868 aa  100  9e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.024885  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7106  TonB-dependent receptor  23.78 
 
 		 818 aa  98.6  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.385774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1572  TonB-dependent receptor  22.08 
 
 		 780 aa  98.2  5e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0693034  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4561  TonB-dependent receptor  22.93 
 
 		 824 aa  96.7  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0251417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0204  TonB-dependent receptor  22.19 
 
 		 678 aa  93.2  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5070  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  23.49 
 
 		 762 aa  92.8  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.565094  normal  0.157746 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2547  TonB-dependent receptor plug  24.36 
 
 		 615 aa  93.2  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792273  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4607  TonB-dependent copper receptor  24.25 
 
 		 724 aa  88.2  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0702651  normal  0.0726755 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0654  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 		 638 aa  87.4  9e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.561107  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2591  hemin receptor precursor, TonB-dependent outer membrane uptake protein  25.56 
 
 		 687 aa  86.7  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.125278 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  25.89 
 
 		 648 aa  84  0.000000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>