More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_3505 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_3505  outer membrane insertion C-terminal signal  100 
 
 		 758 aa  1556    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3573  TonB-dependent receptor plug  98.42 
 
 		 758 aa  1532    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3383  TonB-dependent receptor, plug  83.77 
 
 		 758 aa  1346    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3695  outer membrane insertion C-terminal signal  98.28 
 
 		 758 aa  1531    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.122908 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0745  TonB-dependent receptor, plug  98.94 
 
 		 758 aa  1541    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03676  TonB-dependent receptor  37.44 
 
 		 821 aa  518  1.0000000000000001e-145  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00269599  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2604  TonB-dependent receptor  38.4 
 
 		 706 aa  476  1e-133  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000145461  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3627  TonB-dependent receptor  38.32 
 
 		 744 aa  473  1e-132  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000139063  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0295  TonB-dependent receptor  35.94 
 
 		 797 aa  452  1e-125  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.141972  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4488  TonB-dependent receptor  35.71 
 
 		 835 aa  444  1e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1978  outer membrane protein  34.62 
 
 		 801 aa  433  1e-120  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.103542  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1902  TonB-dependent receptor  36.36 
 
 		 751 aa  425  1e-117  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.357712  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2510  TonB-dependent receptor  38.87 
 
 		 689 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0311712  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1489  TonB-dependent receptor  36.3 
 
 		 689 aa  398  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000345981  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13940  TonB-dependent receptor  35.94 
 
 		 682 aa  383  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.137662  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4738  hypothetical protein  35.62 
 
 		 687 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122905  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1214  TonB-dependent receptor  34.7 
 
 		 734 aa  375  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.772889  normal  0.0390037 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54180  hypothetical protein  35.55 
 
 		 687 aa  371  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1446  TonB-dependent receptor  34.85 
 
 		 680 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.757282 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0159  TonB-dependent receptor  33.94 
 
 		 727 aa  368  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.630357  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4359  TonB-dependent receptor  34.75 
 
 		 682 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503749 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1083  TonB-dependent receptor  34.65 
 
 		 681 aa  363  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.654229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0134  TonB-dependent receptor  34.29 
 
 		 694 aa  360  5e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4275  TonB-dependent receptor  34.45 
 
 		 685 aa  360  5e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1847  outer membrane hemin receptor  35.88 
 
 		 681 aa  358  2.9999999999999997e-97  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1776  TonB-dependent receptor  35.74 
 
 		 681 aa  357  3.9999999999999996e-97  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.506157  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0123  TonB-dependent receptor  34.11 
 
 		 719 aa  355  2e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.333478 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1524  TonB-dependent receptor  33.19 
 
 		 692 aa  348  2e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.41177 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3948  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 730 aa  348  2e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32851 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3871  TonB-dependent receptor  33.19 
 
 		 693 aa  347  6e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.284542 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4331  TonB-dependent receptor  33.04 
 
 		 677 aa  347  7e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.467615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04789  TonB-dependent outer membrane Receptor  36.86 
 
 		 600 aa  343  7e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0342163  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5866  TonB-dependent receptor  32.99 
 
 		 694 aa  342  1e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.754568 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3927  TonB-dependent receptor  32.69 
 
 		 742 aa  339  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.889304  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4439  TonB-dependent receptor  32.69 
 
 		 677 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0939  TonB-dependent receptor  35.2 
 
 		 751 aa  338  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0287  TonB-dependent receptor  34.76 
 
 		 681 aa  337  5.999999999999999e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.566628  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1434  TonB-dependent receptor  34.76 
 
 		 681 aa  337  5.999999999999999e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1631  TonB-dependent receptor  35.05 
 
 		 751 aa  337  7e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.374553  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2505  TonB-dependent receptor  34.76 
 
 		 698 aa  336  7.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.351153  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0251  TonB-dependent receptor  34.76 
 
 		 698 aa  336  1e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.818078  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4185  TonB-dependent receptor  32.86 
 
 		 724 aa  336  1e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.423461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2644  TonB-dependent receptor  34.76 
 
 		 698 aa  336  1e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.700465  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1842  TonB-dependent receptor  33.86 
 
 		 693 aa  331  3e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0527  TonB-dependent receptor  34.21 
 
 		 725 aa  329  1.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1865  TonB-dependent receptor  35.06 
 
 		 705 aa  327  4.0000000000000003e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2033  TonB-dependent receptor  33.62 
 
 		 695 aa  327  5e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000947033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0754  TonB-dependent receptor  32.33 
 
 		 709 aa  318  2e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2321  TonB-dependent receptor, putative  31.45 
 
 		 709 aa  306  1.0000000000000001e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.493897  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1010  TonB-dependent receptor  32.44 
 
 		 695 aa  298  3e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4694  TonB-dependent receptor  30.71 
 
 		 685 aa  294  5e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0540  TonB-dependent receptor  31.18 
 
 		 699 aa  290  7e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1894  TonB-dependent receptor  32.16 
 
 		 709 aa  290  8e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.123894 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3729  TonB-dependent receptor, putative  28.7 
 
 		 778 aa  288  2.9999999999999996e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000373318  normal  0.721597 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2807  TonB-dependent receptor  31.38 
 
 		 713 aa  278  2e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3717  TonB-dependent receptor  30.91 
 
 		 702 aa  273  7e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429203  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0551  TonB-dependent receptor  30.51 
 
 		 733 aa  267  5.999999999999999e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.629102  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1683  TonB-dependent receptor  30.1 
 
 		 727 aa  266  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0594  TonB-dependent receptor  31.42 
 
 		 708 aa  263  8.999999999999999e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.601286  hitchhiker  0.00250598 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0708  TonB-dependent receptor, plug  27.6 
 
 		 744 aa  259  1e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2932  putative iron complex outermembrane recepter protein  31.52 
 
 		 685 aa  258  2e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0861  TonB-dependent receptor plug  30.33 
 
 		 714 aa  249  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113091 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4426  TonB-dependent receptor plug  31.7 
 
 		 707 aa  248  3e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.831114  normal  0.397066 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1180  TonB-dependent receptor  32.11 
 
 		 705 aa  248  4e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00173216  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3051  TonB-dependent receptor  29.61 
 
 		 702 aa  245  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.385439 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5735  TonB-dependent receptor plug  30.65 
 
 		 676 aa  245  3e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2102  TonB-dependent receptor plug  30.3 
 
 		 719 aa  240  6.999999999999999e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121164 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2378  TonB-dependent receptor  30.3 
 
 		 719 aa  240  8e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2054  TonB-dependent receptor plug  30.39 
 
 		 714 aa  239  1e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1405  TonB-dependent receptor  29.64 
 
 		 783 aa  235  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.148044  normal  0.749639 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3951  TonB-dependent receptor plug  29.68 
 
 		 731 aa  229  2e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.478156  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4319  TonB-dependent receptor plug  29.68 
 
 		 723 aa  228  3e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.133256  normal  0.357062 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3257  TonB-dependent receptor, plug  29.42 
 
 		 782 aa  215  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.393029  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 759 aa  213  9e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2266  putative outer membrane hemin/siderophore receptor protein  28.72 
 
 		 774 aa  210  9e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1189  TonB-dependent receptor  27.83 
 
 		 702 aa  203  9.999999999999999e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000388358  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4192  TonB-dependent receptor  27.65 
 
 		 784 aa  200  7e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0530533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4869  TonB-dependent receptor  27.72 
 
 		 784 aa  197  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.188313  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4046  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 		 789 aa  196  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.236751 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2631  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 799 aa  180  1e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0452445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0270  TonB-dependent receptor  23.89 
 
 		 766 aa  174  5e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2340  TonB-dependent receptor  39.68 
 
 		 836 aa  155  4e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000058543  normal  0.137103 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1314  TonB-dependent receptor  24.27 
 
 		 735 aa  151  4e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7106  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 818 aa  143  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.385774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0859  TonB-dependent receptor plug  45.68 
 
 		 249 aa  140  6e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.152413  normal  0.604475 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0069  iron-regulated outer membrane protein  35.38 
 
 		 868 aa  120  9e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.024885  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1480  TonB-dependent receptor  23.94 
 
 		 776 aa  110  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.329669  normal  0.154283 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3288  TonB-dependent receptor  23.11 
 
 		 730 aa  103  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0176  TonB-dependent receptor  30.74 
 
 		 763 aa  95.9  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0204  TonB-dependent receptor  23.54 
 
 		 678 aa  92.4  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1572  TonB-dependent receptor  21.71 
 
 		 780 aa  87.4  0.000000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0693034  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2339  TonB-dependent receptor  24.35 
 
 		 797 aa  84.7  0.000000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.608898  normal  0.596694 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2015  TonB-dependent receptor  22.39 
 
 		 732 aa  84.7  0.000000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3340  TonB-dependent receptor  22.29 
 
 		 685 aa  84  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3709  outer membrane receptor protein  28.18 
 
 		 776 aa  82.4  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0256653 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4561  TonB-dependent receptor  25.54 
 
 		 824 aa  80.5  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0251417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 698 aa  80.5  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  30.4 
 
 		 747 aa  78.2  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0570  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system protein  27.92 
 
 		 675 aa  77.8  0.0000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.168599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  24.05 
 
 		 646 aa  76.3  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>