More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_4185 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_4185  TonB-dependent receptor  100 
 
 
724 aa  1454    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.423461  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1446  TonB-dependent receptor  54.87 
 
 
680 aa  719    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.757282 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2644  TonB-dependent receptor  75.95 
 
 
698 aa  1001    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.700465  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0251  TonB-dependent receptor  75.8 
 
 
698 aa  999    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.818078  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1631  TonB-dependent receptor  75.8 
 
 
751 aa  1000    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.374553  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0159  TonB-dependent receptor  50.48 
 
 
727 aa  687    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.630357  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4331  TonB-dependent receptor  88.63 
 
 
677 aa  1216    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.467615  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0939  TonB-dependent receptor  75.8 
 
 
751 aa  1000    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0287  TonB-dependent receptor  75.92 
 
 
681 aa  1007    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.566628  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4738  hypothetical protein  57.47 
 
 
687 aa  777    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122905  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1524  TonB-dependent receptor  87.29 
 
 
692 aa  1232    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.41177 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4275  TonB-dependent receptor  54.61 
 
 
685 aa  714    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0527  TonB-dependent receptor  76.06 
 
 
725 aa  1004    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5866  TonB-dependent receptor  88.14 
 
 
694 aa  1228    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.754568 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0123  TonB-dependent receptor  52.47 
 
 
719 aa  664    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.333478 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3927  TonB-dependent receptor  87.66 
 
 
742 aa  1230    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.889304  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4359  TonB-dependent receptor  54.42 
 
 
682 aa  716    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.503749 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3871  TonB-dependent receptor  87.73 
 
 
693 aa  1226    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.284542 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2505  TonB-dependent receptor  75.66 
 
 
698 aa  996    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.351153  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54180  hypothetical protein  57.33 
 
 
687 aa  774    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4439  TonB-dependent receptor  88.63 
 
 
677 aa  1203    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1083  TonB-dependent receptor  55.54 
 
 
681 aa  723    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.654229  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1434  TonB-dependent receptor  75.92 
 
 
681 aa  1007    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0134  TonB-dependent receptor  44.06 
 
 
694 aa  586  1e-166  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3717  TonB-dependent receptor  45.35 
 
 
702 aa  528  1e-148  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429203  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2932  putative iron complex outermembrane recepter protein  45.4 
 
 
685 aa  523  1e-147  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1683  TonB-dependent receptor  42.64 
 
 
727 aa  518  1.0000000000000001e-145  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2807  TonB-dependent receptor  44.43 
 
 
713 aa  511  1e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1189  TonB-dependent receptor  39.08 
 
 
702 aa  399  1e-109  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000388358  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2604  TonB-dependent receptor  32.4 
 
 
706 aa  359  9.999999999999999e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000145461  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3383  TonB-dependent receptor, plug  33.92 
 
 
758 aa  340  4e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0745  TonB-dependent receptor, plug  33.14 
 
 
758 aa  340  5.9999999999999996e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3573  TonB-dependent receptor plug  33 
 
 
758 aa  340  8e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3695  outer membrane insertion C-terminal signal  33 
 
 
758 aa  339  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.122908 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2510  TonB-dependent receptor  34.44 
 
 
689 aa  338  2.9999999999999997e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0311712  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3505  outer membrane insertion C-terminal signal  32.86 
 
 
758 aa  337  5.999999999999999e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1489  TonB-dependent receptor  33.28 
 
 
689 aa  337  7e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000345981  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3627  TonB-dependent receptor  31.76 
 
 
744 aa  333  5e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000139063  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1214  TonB-dependent receptor  34.73 
 
 
734 aa  330  4e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.772889  normal  0.0390037 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1865  TonB-dependent receptor  35.87 
 
 
705 aa  325  2e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0861  TonB-dependent receptor plug  33.8 
 
 
714 aa  312  1e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113091 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1010  TonB-dependent receptor  32.03 
 
 
695 aa  312  2e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1847  outer membrane hemin receptor  33.05 
 
 
681 aa  310  4e-83  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1776  TonB-dependent receptor  32.77 
 
 
681 aa  309  2.0000000000000002e-82  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.506157  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0754  TonB-dependent receptor  32.88 
 
 
709 aa  307  4.0000000000000004e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4426  TonB-dependent receptor plug  34.94 
 
 
707 aa  306  9.000000000000001e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.831114  normal  0.397066 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2321  TonB-dependent receptor, putative  31.23 
 
 
709 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.493897  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5735  TonB-dependent receptor plug  33.53 
 
 
676 aa  298  2e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03676  TonB-dependent receptor  29.27 
 
 
821 aa  297  4e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00269599  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0540  TonB-dependent receptor  32.4 
 
 
699 aa  297  5e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2033  TonB-dependent receptor  33.14 
 
 
695 aa  296  6e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000947033  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1180  TonB-dependent receptor  33.73 
 
 
705 aa  295  2e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00173216  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1842  TonB-dependent receptor  33.09 
 
 
693 aa  294  4e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13940  TonB-dependent receptor  31.19 
 
 
682 aa  294  4e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.137662  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3948  TonB-dependent receptor  32.1 
 
 
730 aa  293  1e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.32851 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3051  TonB-dependent receptor  31.84 
 
 
702 aa  288  2.9999999999999996e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.385439 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4488  TonB-dependent receptor  28.79 
 
 
835 aa  286  1.0000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4694  TonB-dependent receptor  31.76 
 
 
685 aa  282  1e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04789  TonB-dependent outer membrane Receptor  31.65 
 
 
600 aa  281  3e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0342163  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1978  outer membrane protein  29.37 
 
 
801 aa  278  3e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.103542  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3951  TonB-dependent receptor plug  32.58 
 
 
731 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.478156  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4319  TonB-dependent receptor plug  32.58 
 
 
723 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.133256  normal  0.357062 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1902  TonB-dependent receptor  29.67 
 
 
751 aa  272  1e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.357712  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1894  TonB-dependent receptor  29.45 
 
 
709 aa  264  4e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.123894 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2102  TonB-dependent receptor plug  33.23 
 
 
719 aa  264  4e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00121164 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2054  TonB-dependent receptor plug  33.38 
 
 
714 aa  264  4e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0708  TonB-dependent receptor, plug  29.74 
 
 
744 aa  263  6.999999999999999e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2378  TonB-dependent receptor  33.38 
 
 
719 aa  263  8e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2266  putative outer membrane hemin/siderophore receptor protein  31.54 
 
 
774 aa  263  1e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3729  TonB-dependent receptor, putative  27.65 
 
 
778 aa  255  2.0000000000000002e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000373318  normal  0.721597 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4869  TonB-dependent receptor  29.2 
 
 
784 aa  252  1e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.188313  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4192  TonB-dependent receptor  30.18 
 
 
784 aa  251  3e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0530533  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1405  TonB-dependent receptor  30.91 
 
 
783 aa  251  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.148044  normal  0.749639 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3257  TonB-dependent receptor, plug  30.92 
 
 
782 aa  251  3e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.393029  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0594  TonB-dependent receptor  31.29 
 
 
708 aa  242  2e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.601286  hitchhiker  0.00250598 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2631  TonB-dependent receptor  30.16 
 
 
799 aa  240  5.999999999999999e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0452445  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4046  TonB-dependent receptor  29.73 
 
 
789 aa  237  4e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.236751 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0295  TonB-dependent receptor  27.49 
 
 
797 aa  231  4e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.141972  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0551  TonB-dependent receptor  29.61 
 
 
733 aa  228  3e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.629102  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0270  TonB-dependent receptor  24.23 
 
 
766 aa  195  3e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 
759 aa  176  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0176  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 
763 aa  144  8e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0859  TonB-dependent receptor plug  41.46 
 
 
249 aa  132  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.152413  normal  0.604475 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2015  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 
732 aa  131  4.0000000000000003e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2340  TonB-dependent receptor  27.61 
 
 
836 aa  119  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000058543  normal  0.137103 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4568  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 
776 aa  100  8e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1314  TonB-dependent receptor  26.08 
 
 
735 aa  99.8  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0654  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 
638 aa  94.4  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.561107  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0069  iron-regulated outer membrane protein  31.46 
 
 
868 aa  94  8e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.024885  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0204  TonB-dependent receptor  21.73 
 
 
678 aa  92.8  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2547  TonB-dependent receptor plug  23.99 
 
 
615 aa  91.3  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792273  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7106  TonB-dependent receptor  22.11 
 
 
818 aa  90.5  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.385774  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4607  TonB-dependent copper receptor  23.18 
 
 
724 aa  89.7  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0702651  normal  0.0726755 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  24.44 
 
 
702 aa  87  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3757  TonB-dependent receptor plug  26.43 
 
 
612 aa  83.6  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0645  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  23.64 
 
 
750 aa  82.8  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0446508  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1476  TonB-dependent receptor  22.69 
 
 
668 aa  82.4  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2507  TonB-dependent copper receptor  23.56 
 
 
745 aa  82.4  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0638  TonB-dependent copper receptor  23.52 
 
 
753 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0821  TonB-dependent copper receptor  23.52 
 
 
749 aa  81.6  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>