More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2932 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2932  putative iron complex outermembrane recepter protein  100 
 
 		 685 aa  1355    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0159  TonB-dependent receptor  49.85 
 
 		 727 aa  597  1e-169  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.630357  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1683  TonB-dependent receptor  48.84 
 
 		 727 aa  595  1e-168  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2807  TonB-dependent receptor  50.66 
 
 		 713 aa  588  1e-166  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0134  TonB-dependent receptor  45.26 
 
 		 694 aa  567  1e-160  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0123  TonB-dependent receptor  46.68 
 
 		 719 aa  565  1.0000000000000001e-159  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.333478 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54180  hypothetical protein  47.22 
 
 		 687 aa  554  1e-156  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4738  hypothetical protein  47.08 
 
 		 687 aa  549  1e-155  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122905  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4359  TonB-dependent receptor  45.64 
 
 		 682 aa  542  1e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503749 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1446  TonB-dependent receptor  45.63 
 
 		 680 aa  538  1e-151  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.757282 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1083  TonB-dependent receptor  45.2 
 
 		 681 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.654229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4275  TonB-dependent receptor  45.15 
 
 		 685 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3717  TonB-dependent receptor  44.82 
 
 		 702 aa  527  1e-148  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429203  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1524  TonB-dependent receptor  43.99 
 
 		 692 aa  526  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.41177 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4185  TonB-dependent receptor  45.4 
 
 		 724 aa  523  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.423461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4331  TonB-dependent receptor  44.65 
 
 		 677 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.467615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0287  TonB-dependent receptor  46.64 
 
 		 681 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.566628  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1631  TonB-dependent receptor  46.64 
 
 		 751 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.374553  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3871  TonB-dependent receptor  44.43 
 
 		 693 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.284542 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1434  TonB-dependent receptor  46.64 
 
 		 681 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5866  TonB-dependent receptor  44.63 
 
 		 694 aa  513  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.754568 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0251  TonB-dependent receptor  46.64 
 
 		 698 aa  514  1e-144  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.818078  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0939  TonB-dependent receptor  46.49 
 
 		 751 aa  514  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2644  TonB-dependent receptor  46.64 
 
 		 698 aa  514  1e-144  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.700465  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2505  TonB-dependent receptor  46.49 
 
 		 698 aa  512  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.351153  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0527  TonB-dependent receptor  45.16 
 
 		 725 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3927  TonB-dependent receptor  44.33 
 
 		 742 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.889304  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4439  TonB-dependent receptor  44.33 
 
 		 677 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1189  TonB-dependent receptor  39.13 
 
 		 702 aa  389  1e-106  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000388358  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1847  outer membrane hemin receptor  35.36 
 
 		 681 aa  343  5.999999999999999e-93  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1776  TonB-dependent receptor  34.79 
 
 		 681 aa  335  1e-90  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.506157  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2510  TonB-dependent receptor  36.95 
 
 		 689 aa  332  1e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0311712  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2604  TonB-dependent receptor  33.06 
 
 		 706 aa  323  6e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000145461  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1842  TonB-dependent receptor  35.76 
 
 		 693 aa  322  9.999999999999999e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2033  TonB-dependent receptor  35.67 
 
 		 695 aa  321  1.9999999999999998e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000947033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3948  TonB-dependent receptor  33.72 
 
 		 730 aa  316  8e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32851 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0754  TonB-dependent receptor  35.22 
 
 		 709 aa  315  9.999999999999999e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1214  TonB-dependent receptor  33.1 
 
 		 734 aa  311  4e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.772889  normal  0.0390037 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3627  TonB-dependent receptor  30.82 
 
 		 744 aa  304  4.0000000000000003e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000139063  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13940  TonB-dependent receptor  33.01 
 
 		 682 aa  300  8e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.137662  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04789  TonB-dependent outer membrane Receptor  33.91 
 
 		 600 aa  294  5e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0342163  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0540  TonB-dependent receptor  33.82 
 
 		 699 aa  282  2e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4488  TonB-dependent receptor  29.67 
 
 		 835 aa  280  5e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0861  TonB-dependent receptor plug  33.23 
 
 		 714 aa  278  2e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113091 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1489  TonB-dependent receptor  32.5 
 
 		 689 aa  277  6e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000345981  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1894  TonB-dependent receptor  32.97 
 
 		 709 aa  276  1.0000000000000001e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.123894 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4694  TonB-dependent receptor  33.53 
 
 		 685 aa  273  9e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5735  TonB-dependent receptor plug  32.68 
 
 		 676 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2054  TonB-dependent receptor plug  33.28 
 
 		 714 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03676  TonB-dependent receptor  29.77 
 
 		 821 aa  267  5.999999999999999e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00269599  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2102  TonB-dependent receptor plug  32.74 
 
 		 719 aa  266  8.999999999999999e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121164 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2378  TonB-dependent receptor  33.24 
 
 		 719 aa  266  1e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0745  TonB-dependent receptor, plug  31.5 
 
 		 758 aa  264  4e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1010  TonB-dependent receptor  31.14 
 
 		 695 aa  264  4.999999999999999e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1180  TonB-dependent receptor  32.74 
 
 		 705 aa  263  6e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00173216  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3051  TonB-dependent receptor  32.88 
 
 		 702 aa  263  8e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.385439 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3573  TonB-dependent receptor plug  31.36 
 
 		 758 aa  262  2e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3505  outer membrane insertion C-terminal signal  31.36 
 
 		 758 aa  261  4e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1902  TonB-dependent receptor  29.11 
 
 		 751 aa  260  7e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.357712  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1865  TonB-dependent receptor  34.48 
 
 		 705 aa  258  2e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3695  outer membrane insertion C-terminal signal  31.07 
 
 		 758 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.122908 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4426  TonB-dependent receptor plug  33.49 
 
 		 707 aa  258  3e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.831114  normal  0.397066 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1978  outer membrane protein  29 
 
 		 801 aa  257  6e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.103542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0295  TonB-dependent receptor  30.24 
 
 		 797 aa  253  1e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.141972  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3383  TonB-dependent receptor, plug  31.55 
 
 		 758 aa  249  2e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2321  TonB-dependent receptor, putative  29.39 
 
 		 709 aa  247  4e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.493897  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4192  TonB-dependent receptor  29.99 
 
 		 784 aa  247  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0530533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4319  TonB-dependent receptor plug  32.63 
 
 		 723 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.133256  normal  0.357062 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3951  TonB-dependent receptor plug  32.63 
 
 		 731 aa  244  3e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.478156  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4869  TonB-dependent receptor  30.56 
 
 		 784 aa  242  2e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.188313  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3257  TonB-dependent receptor, plug  30.77 
 
 		 782 aa  241  4e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.393029  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2266  putative outer membrane hemin/siderophore receptor protein  30.71 
 
 		 774 aa  240  8e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4046  TonB-dependent receptor  30.16 
 
 		 789 aa  231  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.236751 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1405  TonB-dependent receptor  30.29 
 
 		 783 aa  224  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.148044  normal  0.749639 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3729  TonB-dependent receptor, putative  26.46 
 
 		 778 aa  211  2e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000373318  normal  0.721597 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0708  TonB-dependent receptor, plug  27.86 
 
 		 744 aa  211  3e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0551  TonB-dependent receptor  30.42 
 
 		 733 aa  207  5e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.629102  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0594  TonB-dependent receptor  30.18 
 
 		 708 aa  206  2e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.601286  hitchhiker  0.00250598 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2631  TonB-dependent receptor  28.75 
 
 		 799 aa  204  3e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0452445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  28.93 
 
 		 759 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0176  TonB-dependent receptor  23.66 
 
 		 763 aa  137  9e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0069  iron-regulated outer membrane protein  39.71 
 
 		 868 aa  124  7e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.024885  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2340  TonB-dependent receptor  33.84 
 
 		 836 aa  117  7.999999999999999e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000058543  normal  0.137103 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1314  TonB-dependent receptor  23.92 
 
 		 735 aa  116  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2015  TonB-dependent receptor  23.79 
 
 		 732 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3709  outer membrane receptor protein  22.19 
 
 		 776 aa  110  8.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0256653 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0270  TonB-dependent receptor  33.8 
 
 		 766 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4568  TonB-dependent receptor  22.45 
 
 		 776 aa  107  7e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0859  TonB-dependent receptor plug  32.95 
 
 		 249 aa  96.3  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.152413  normal  0.604475 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2339  TonB-dependent receptor  22.84 
 
 		 797 aa  95.5  3e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.608898  normal  0.596694 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2591  hemin receptor precursor, TonB-dependent outer membrane uptake protein  25 
 
 		 687 aa  94  9e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.125278 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  24.37 
 
 		 698 aa  94  9e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1480  TonB-dependent receptor  23.68 
 
 		 776 aa  89.7  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.329669  normal  0.154283 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1537  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 		 593 aa  88.6  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00891985  normal  0.735799 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3288  TonB-dependent receptor  23.86 
 
 		 730 aa  87.8  6e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1096  TonB-dependent receptor  24.96 
 
 		 626 aa  83.2  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4607  TonB-dependent copper receptor  22.93 
 
 		 724 aa  83.6  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0702651  normal  0.0726755 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  26.04 
 
 		 617 aa  82.4  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1366  tonB-linked outer membrane receptor  21.53 
 
 		 811 aa  82.4  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.351505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1012  TonB-dependent receptor  25.15 
 
 		 626 aa  80.1  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>