More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0594 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0594  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 708 aa  1401    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.601286  hitchhiker  0.00250598 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4694  TonB-dependent receptor  38.53 
 
 		 685 aa  422  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0540  TonB-dependent receptor  36.08 
 
 		 699 aa  379  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0754  TonB-dependent receptor  35.61 
 
 		 709 aa  371  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1894  TonB-dependent receptor  36.06 
 
 		 709 aa  369  1e-100  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.123894 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0134  TonB-dependent receptor  32.92 
 
 		 694 aa  341  2e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1214  TonB-dependent receptor  34.05 
 
 		 734 aa  332  1e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.772889  normal  0.0390037 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0159  TonB-dependent receptor  33.05 
 
 		 727 aa  325  1e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.630357  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03676  TonB-dependent receptor  32.66 
 
 		 821 aa  325  1e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00269599  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2604  TonB-dependent receptor  29.16 
 
 		 706 aa  323  5e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000145461  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1489  TonB-dependent receptor  32.78 
 
 		 689 aa  322  1.9999999999999998e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000345981  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13940  TonB-dependent receptor  33.52 
 
 		 682 aa  322  1.9999999999999998e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.137662  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3729  TonB-dependent receptor, putative  32.3 
 
 		 778 aa  315  1.9999999999999998e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000373318  normal  0.721597 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54180  hypothetical protein  33.48 
 
 		 687 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4738  hypothetical protein  33.48 
 
 		 687 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122905  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0123  TonB-dependent receptor  32.11 
 
 		 719 aa  309  1.0000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.333478 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4359  TonB-dependent receptor  32.12 
 
 		 682 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503749 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1446  TonB-dependent receptor  31.57 
 
 		 680 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.757282 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3627  TonB-dependent receptor  29.96 
 
 		 744 aa  304  4.0000000000000003e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000139063  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3948  TonB-dependent receptor  32.52 
 
 		 730 aa  303  8.000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32851 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2510  TonB-dependent receptor  32.86 
 
 		 689 aa  303  1e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0311712  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4275  TonB-dependent receptor  31.49 
 
 		 685 aa  301  3e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1083  TonB-dependent receptor  32.15 
 
 		 681 aa  300  5e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.654229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3573  TonB-dependent receptor plug  31.64 
 
 		 758 aa  296  9e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3383  TonB-dependent receptor, plug  31.54 
 
 		 758 aa  295  2e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3695  outer membrane insertion C-terminal signal  31.66 
 
 		 758 aa  292  1e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.122908 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3505  outer membrane insertion C-terminal signal  31.54 
 
 		 758 aa  291  2e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0745  TonB-dependent receptor, plug  31.59 
 
 		 758 aa  289  1e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1842  TonB-dependent receptor  34.2 
 
 		 693 aa  289  1e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0295  TonB-dependent receptor  31.47 
 
 		 797 aa  288  2e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.141972  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2033  TonB-dependent receptor  33.81 
 
 		 695 aa  286  7e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000947033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1776  TonB-dependent receptor  31.69 
 
 		 681 aa  284  4.0000000000000003e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.506157  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3871  TonB-dependent receptor  32.11 
 
 		 693 aa  282  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.284542 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4331  TonB-dependent receptor  32.15 
 
 		 677 aa  281  3e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.467615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1847  outer membrane hemin receptor  31.55 
 
 		 681 aa  281  3e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4488  TonB-dependent receptor  29.33 
 
 		 835 aa  278  3e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0939  TonB-dependent receptor  32.05 
 
 		 751 aa  278  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2505  TonB-dependent receptor  32.05 
 
 		 698 aa  278  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.351153  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2644  TonB-dependent receptor  32.05 
 
 		 698 aa  277  4e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.700465  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0251  TonB-dependent receptor  32.05 
 
 		 698 aa  277  4e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.818078  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1524  TonB-dependent receptor  32.02 
 
 		 692 aa  278  4e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.41177 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0287  TonB-dependent receptor  32.05 
 
 		 681 aa  277  4e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.566628  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1434  TonB-dependent receptor  32.05 
 
 		 681 aa  277  4e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4439  TonB-dependent receptor  31.95 
 
 		 677 aa  277  5e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1631  TonB-dependent receptor  32.05 
 
 		 751 aa  277  5e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.374553  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3927  TonB-dependent receptor  31.95 
 
 		 742 aa  277  6e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.889304  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1902  TonB-dependent receptor  28.83 
 
 		 751 aa  276  1.0000000000000001e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.357712  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5866  TonB-dependent receptor  31.95 
 
 		 694 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.754568 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4185  TonB-dependent receptor  31.44 
 
 		 724 aa  273  7e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.423461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1978  outer membrane protein  28.53 
 
 		 801 aa  270  5e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.103542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04789  TonB-dependent outer membrane Receptor  33.08 
 
 		 600 aa  268  2.9999999999999995e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0342163  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0527  TonB-dependent receptor  31.62 
 
 		 725 aa  266  1e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1180  TonB-dependent receptor  30.52 
 
 		 705 aa  260  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00173216  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3051  TonB-dependent receptor  28.46 
 
 		 702 aa  258  3e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.385439 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1865  TonB-dependent receptor  30.37 
 
 		 705 aa  253  9.000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0708  TonB-dependent receptor, plug  29.69 
 
 		 744 aa  243  7.999999999999999e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2932  putative iron complex outermembrane recepter protein  31.17 
 
 		 685 aa  239  9e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0861  TonB-dependent receptor plug  29 
 
 		 714 aa  238  2e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113091 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2321  TonB-dependent receptor, putative  29.63 
 
 		 709 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.493897  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4426  TonB-dependent receptor plug  29.77 
 
 		 707 aa  236  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.831114  normal  0.397066 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3951  TonB-dependent receptor plug  29.54 
 
 		 731 aa  234  3e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.478156  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4319  TonB-dependent receptor plug  29.54 
 
 		 723 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.133256  normal  0.357062 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1683  TonB-dependent receptor  29.12 
 
 		 727 aa  232  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2807  TonB-dependent receptor  29.92 
 
 		 713 aa  231  3e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3717  TonB-dependent receptor  29.93 
 
 		 702 aa  230  6e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429203  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5735  TonB-dependent receptor plug  29.58 
 
 		 676 aa  227  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2378  TonB-dependent receptor  29 
 
 		 719 aa  226  1e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2102  TonB-dependent receptor plug  28.85 
 
 		 719 aa  226  2e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121164 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2054  TonB-dependent receptor plug  28.99 
 
 		 714 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0551  TonB-dependent receptor  29.31 
 
 		 733 aa  218  4e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.629102  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4869  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 784 aa  214  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.188313  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3257  TonB-dependent receptor, plug  27.44 
 
 		 782 aa  210  6e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.393029  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4192  TonB-dependent receptor  26.84 
 
 		 784 aa  206  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0530533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4046  TonB-dependent receptor  26.66 
 
 		 789 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.236751 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2266  putative outer membrane hemin/siderophore receptor protein  27.05 
 
 		 774 aa  203  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1010  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 		 695 aa  200  7e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1189  TonB-dependent receptor  28.17 
 
 		 702 aa  195  3e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000388358  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1405  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 783 aa  185  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.148044  normal  0.749639 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2631  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 		 799 aa  181  4e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0452445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0270  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 766 aa  178  3e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0069  iron-regulated outer membrane protein  25.48 
 
 		 868 aa  173  1e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.024885  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 		 759 aa  140  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2340  TonB-dependent receptor  31.79 
 
 		 836 aa  130  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000058543  normal  0.137103 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0176  TonB-dependent receptor  23.86 
 
 		 763 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1480  TonB-dependent receptor  26.29 
 
 		 776 aa  114  9e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.329669  normal  0.154283 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2339  TonB-dependent receptor  23.67 
 
 		 797 aa  105  3e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.608898  normal  0.596694 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1366  tonB-linked outer membrane receptor  21.09 
 
 		 811 aa  99  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.351505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0859  TonB-dependent receptor plug  35.33 
 
 		 249 aa  97.1  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.152413  normal  0.604475 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1938  TonB-dependent receptor  23.61 
 
 		 801 aa  89  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.17436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1314  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 735 aa  83.2  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3288  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 730 aa  77.4  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7106  TonB-dependent receptor  38.02 
 
 		 818 aa  76.6  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.385774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4020  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  35 
 
 		 615 aa  72  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000194494  normal  0.015002 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02166  TonB-dependent outer membrane Receptor  36 
 
 		 619 aa  71.6  0.00000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1486  TonB-dependent receptor, plug  28.96 
 
 		 677 aa  70.5  0.00000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.243313  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3189  TonB-dependent receptor, plug  32.93 
 
 		 623 aa  70.1  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2720  iron complex outermembrane recepter protein  32.89 
 
 		 631 aa  70.1  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.83965  normal  0.415567 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  31.06 
 
 		 686 aa  70.1  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  29.19 
 
 		 634 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  28.95 
 
 		 618 aa  68.9  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>