More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_2340 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_2340  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 836 aa  1738    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000058543  normal  0.137103 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3948  TonB-dependent receptor  30.58 
 
 		 730 aa  294  4e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32851 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1842  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 693 aa  289  1e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2033  TonB-dependent receptor  29.5 
 
 		 695 aa  285  3.0000000000000004e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000947033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1489  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 		 689 aa  228  3e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000345981  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0069  iron-regulated outer membrane protein  25.26 
 
 		 868 aa  191  5.999999999999999e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.024885  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1978  outer membrane protein  24.97 
 
 		 801 aa  184  4.0000000000000006e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.103542  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13940  TonB-dependent receptor  28.95 
 
 		 682 aa  159  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.137662  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0295  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 797 aa  158  5.0000000000000005e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.141972  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3383  TonB-dependent receptor, plug  40.95 
 
 		 758 aa  157  8e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0745  TonB-dependent receptor, plug  40.08 
 
 		 758 aa  157  9e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3695  outer membrane insertion C-terminal signal  40.08 
 
 		 758 aa  157  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.122908 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3505  outer membrane insertion C-terminal signal  39.68 
 
 		 758 aa  154  7e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3573  TonB-dependent receptor plug  39.29 
 
 		 758 aa  153  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2510  TonB-dependent receptor  41.28 
 
 		 689 aa  152  3e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0311712  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0134  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 		 694 aa  148  5e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4488  TonB-dependent receptor  28.3 
 
 		 835 aa  146  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2604  TonB-dependent receptor  27.57 
 
 		 706 aa  145  4e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000145461  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1865  TonB-dependent receptor  34.62 
 
 		 705 aa  142  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3627  TonB-dependent receptor  34.34 
 
 		 744 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000139063  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0123  TonB-dependent receptor  28.47 
 
 		 719 aa  141  4.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.333478 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03676  TonB-dependent receptor  36.17 
 
 		 821 aa  140  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00269599  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0159  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 727 aa  139  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.630357  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2321  TonB-dependent receptor, putative  37.45 
 
 		 709 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.493897  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4738  hypothetical protein  28.29 
 
 		 687 aa  139  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122905  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54180  hypothetical protein  29.39 
 
 		 687 aa  137  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1083  TonB-dependent receptor  33.47 
 
 		 681 aa  135  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.654229  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1446  TonB-dependent receptor  33.88 
 
 		 680 aa  134  5e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.757282 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4275  TonB-dependent receptor  33.88 
 
 		 685 aa  134  9e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4359  TonB-dependent receptor  35.27 
 
 		 682 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503749 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4694  TonB-dependent receptor  28.54 
 
 		 685 aa  132  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1214  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 		 734 aa  128  5e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.772889  normal  0.0390037 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1902  TonB-dependent receptor  33.89 
 
 		 751 aa  124  9e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.357712  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1847  outer membrane hemin receptor  25.17 
 
 		 681 aa  121  3.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1524  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 692 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.41177 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5866  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 		 694 aa  121  7e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.754568 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1776  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 		 681 aa  119  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.506157  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0551  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 		 733 aa  119  1.9999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.629102  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1683  TonB-dependent receptor  23.35 
 
 		 727 aa  119  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1894  TonB-dependent receptor  24.4 
 
 		 709 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.123894 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3927  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 		 742 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.889304  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04789  TonB-dependent outer membrane Receptor  26.28 
 
 		 600 aa  119  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0342163  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3717  TonB-dependent receptor  38.55 
 
 		 702 aa  118  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429203  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3729  TonB-dependent receptor, putative  40.61 
 
 		 778 aa  118  5e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000373318  normal  0.721597 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4439  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 		 677 aa  117  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4185  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 		 724 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.423461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0708  TonB-dependent receptor, plug  32.22 
 
 		 744 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2932  putative iron complex outermembrane recepter protein  34.15 
 
 		 685 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5735  TonB-dependent receptor plug  30.61 
 
 		 676 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0861  TonB-dependent receptor plug  31.64 
 
 		 714 aa  115  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113091 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0540  TonB-dependent receptor  24.61 
 
 		 699 aa  115  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4331  TonB-dependent receptor  25.74 
 
 		 677 aa  114  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.467615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1010  TonB-dependent receptor  33.89 
 
 		 695 aa  113  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1434  TonB-dependent receptor  27.94 
 
 		 681 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0287  TonB-dependent receptor  27.94 
 
 		 681 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.566628  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2807  TonB-dependent receptor  33.09 
 
 		 713 aa  112  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3871  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 		 693 aa  112  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.284542 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0939  TonB-dependent receptor  28.16 
 
 		 751 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0594  TonB-dependent receptor  24.78 
 
 		 708 aa  111  4.0000000000000004e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.601286  hitchhiker  0.00250598 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1631  TonB-dependent receptor  27.85 
 
 		 751 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.374553  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3051  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 702 aa  110  9.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.385439 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2644  TonB-dependent receptor  39.31 
 
 		 698 aa  110  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.700465  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1180  TonB-dependent receptor  35.38 
 
 		 705 aa  110  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00173216  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0251  TonB-dependent receptor  27.85 
 
 		 698 aa  110  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.818078  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2505  TonB-dependent receptor  39.31 
 
 		 698 aa  109  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.351153  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0527  TonB-dependent receptor  31.2 
 
 		 725 aa  108  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4426  TonB-dependent receptor plug  27.21 
 
 		 707 aa  108  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.831114  normal  0.397066 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3951  TonB-dependent receptor plug  27.47 
 
 		 731 aa  108  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.478156  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4319  TonB-dependent receptor plug  27.47 
 
 		 723 aa  108  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.133256  normal  0.357062 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2054  TonB-dependent receptor plug  32.87 
 
 		 714 aa  107  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0754  TonB-dependent receptor  28.16 
 
 		 709 aa  104  8e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2378  TonB-dependent receptor  31.94 
 
 		 719 aa  102  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2102  TonB-dependent receptor plug  31.94 
 
 		 719 aa  101  5e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121164 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2631  TonB-dependent receptor  28.7 
 
 		 799 aa  101  6e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0452445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  22.31 
 
 		 759 aa  101  6e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1189  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 		 702 aa  99.8  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000388358  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0859  TonB-dependent receptor plug  34.39 
 
 		 249 aa  96.7  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.152413  normal  0.604475 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4869  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 		 784 aa  93.2  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.188313  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1405  TonB-dependent receptor  34.88 
 
 		 783 aa  92.4  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.148044  normal  0.749639 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3257  TonB-dependent receptor, plug  41.53 
 
 		 782 aa  92.4  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.393029  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2339  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 		 797 aa  92  4e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.608898  normal  0.596694 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4192  TonB-dependent receptor  39.44 
 
 		 784 aa  91.7  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0530533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0176  TonB-dependent receptor  27.11 
 
 		 763 aa  91.7  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2266  putative outer membrane hemin/siderophore receptor protein  39.83 
 
 		 774 aa  89.4  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4046  TonB-dependent receptor  41.23 
 
 		 789 aa  88.2  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.236751 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0270  TonB-dependent receptor  31.02 
 
 		 766 aa  88.2  6e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0074  heme receptor HutR  36.36 
 
 		 713 aa  81.6  0.00000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0136209  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1314  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 735 aa  80.1  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  32.95 
 
 		 686 aa  80.9  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  34.93 
 
 		 618 aa  79.7  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3288  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 730 aa  79.7  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  35.33 
 
 		 634 aa  77.4  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001257  TonB-dependent heme receptor HutR  31.74 
 
 		 712 aa  72.8  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.299412  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0582  TonB-dependent receptor plug  27.23 
 
 		 664 aa  72.4  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000848459  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  32.5 
 
 		 646 aa  72  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  30.05 
 
 		 655 aa  72  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05128  hypothetical protein  31.74 
 
 		 458 aa  71.2  0.00000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  30.69 
 
 		 640 aa  68.9  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1480  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 776 aa  68.2  0.0000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.329669  normal  0.154283 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1541  putative outer membrane receptor  32.93 
 
 		 665 aa  68.2  0.0000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>