More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2266 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2631  TonB-dependent receptor  60.51 
 
 		 799 aa  942    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0452445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2266  putative outer membrane hemin/siderophore receptor protein  100 
 
 		 774 aa  1568    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4192  TonB-dependent receptor  69.87 
 
 		 784 aa  1051    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0530533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1405  TonB-dependent receptor  75.38 
 
 		 783 aa  1174    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.148044  normal  0.749639 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4046  TonB-dependent receptor  70.46 
 
 		 789 aa  1033    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.236751 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4869  TonB-dependent receptor  69.26 
 
 		 784 aa  1058    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.188313  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3257  TonB-dependent receptor, plug  61.98 
 
 		 782 aa  934    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.393029  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1180  TonB-dependent receptor  49.78 
 
 		 705 aa  640    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00173216  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0861  TonB-dependent receptor plug  45.89 
 
 		 714 aa  630  1e-179  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113091 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5735  TonB-dependent receptor plug  48.11 
 
 		 676 aa  626  1e-178  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4426  TonB-dependent receptor plug  45.78 
 
 		 707 aa  624  1e-177  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.831114  normal  0.397066 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2102  TonB-dependent receptor plug  46.99 
 
 		 719 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121164 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3051  TonB-dependent receptor  43.91 
 
 		 702 aa  608  1e-173  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.385439 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2054  TonB-dependent receptor plug  46.94 
 
 		 714 aa  610  1e-173  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2378  TonB-dependent receptor  46.99 
 
 		 719 aa  609  1e-173  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4319  TonB-dependent receptor plug  45.47 
 
 		 723 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.133256  normal  0.357062 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3951  TonB-dependent receptor plug  45.03 
 
 		 731 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.478156  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1865  TonB-dependent receptor  39.8 
 
 		 705 aa  423  1e-117  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0159  TonB-dependent receptor  32.49 
 
 		 727 aa  298  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.630357  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0123  TonB-dependent receptor  31.51 
 
 		 719 aa  269  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.333478 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1083  TonB-dependent receptor  30.97 
 
 		 681 aa  267  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.654229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0134  TonB-dependent receptor  31.92 
 
 		 694 aa  267  5.999999999999999e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4185  TonB-dependent receptor  31.54 
 
 		 724 aa  267  7e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.423461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4359  TonB-dependent receptor  30.66 
 
 		 682 aa  265  3e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503749 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5866  TonB-dependent receptor  31.2 
 
 		 694 aa  263  8e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.754568 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4275  TonB-dependent receptor  30.48 
 
 		 685 aa  263  1e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1446  TonB-dependent receptor  30.78 
 
 		 680 aa  262  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.757282 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3927  TonB-dependent receptor  31.05 
 
 		 742 aa  262  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.889304  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54180  hypothetical protein  30.69 
 
 		 687 aa  262  2e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4439  TonB-dependent receptor  31.05 
 
 		 677 aa  261  3e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4738  hypothetical protein  30.94 
 
 		 687 aa  261  4e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122905  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3871  TonB-dependent receptor  30.81 
 
 		 693 aa  260  6e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.284542 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1524  TonB-dependent receptor  30.56 
 
 		 692 aa  259  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.41177 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4331  TonB-dependent receptor  31.1 
 
 		 677 aa  257  5e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.467615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1010  TonB-dependent receptor  30.79 
 
 		 695 aa  257  6e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2510  TonB-dependent receptor  32.31 
 
 		 689 aa  254  4.0000000000000004e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0311712  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1489  TonB-dependent receptor  29.62 
 
 		 689 aa  247  6e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000345981  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2932  putative iron complex outermembrane recepter protein  31.05 
 
 		 685 aa  243  1e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2604  TonB-dependent receptor  28.75 
 
 		 706 aa  243  1e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000145461  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0527  TonB-dependent receptor  30.65 
 
 		 725 aa  242  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1631  TonB-dependent receptor  30.51 
 
 		 751 aa  239  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.374553  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1683  TonB-dependent receptor  28.69 
 
 		 727 aa  238  3e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2644  TonB-dependent receptor  30.51 
 
 		 698 aa  238  4e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.700465  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0251  TonB-dependent receptor  30.51 
 
 		 698 aa  238  4e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.818078  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3717  TonB-dependent receptor  31.04 
 
 		 702 aa  238  4e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429203  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0939  TonB-dependent receptor  30.36 
 
 		 751 aa  238  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2505  TonB-dependent receptor  30.38 
 
 		 698 aa  237  6e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.351153  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1434  TonB-dependent receptor  29.97 
 
 		 681 aa  237  7e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0287  TonB-dependent receptor  29.97 
 
 		 681 aa  237  7e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.566628  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1847  outer membrane hemin receptor  30.03 
 
 		 681 aa  236  9e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2807  TonB-dependent receptor  32.02 
 
 		 713 aa  236  1.0000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1214  TonB-dependent receptor  29.28 
 
 		 734 aa  235  2.0000000000000002e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.772889  normal  0.0390037 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1776  TonB-dependent receptor  30.17 
 
 		 681 aa  234  4.0000000000000004e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.506157  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1902  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 751 aa  223  9.999999999999999e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.357712  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1894  TonB-dependent receptor  28.53 
 
 		 709 aa  219  1e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.123894 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04789  TonB-dependent outer membrane Receptor  29.79 
 
 		 600 aa  219  2e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0342163  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0295  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 		 797 aa  218  4e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.141972  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03676  TonB-dependent receptor  28.24 
 
 		 821 aa  218  4e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00269599  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1842  TonB-dependent receptor  29.2 
 
 		 693 aa  214  3.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0745  TonB-dependent receptor, plug  29 
 
 		 758 aa  213  1e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0754  TonB-dependent receptor  27.87 
 
 		 709 aa  212  3e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3948  TonB-dependent receptor  28.93 
 
 		 730 aa  212  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32851 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2033  TonB-dependent receptor  28.77 
 
 		 695 aa  211  5e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000947033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3505  outer membrane insertion C-terminal signal  28.72 
 
 		 758 aa  210  1e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3573  TonB-dependent receptor plug  28.72 
 
 		 758 aa  209  1e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3695  outer membrane insertion C-terminal signal  28.72 
 
 		 758 aa  209  2e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.122908 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3383  TonB-dependent receptor, plug  27.93 
 
 		 758 aa  209  2e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0540  TonB-dependent receptor  29.89 
 
 		 699 aa  208  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4694  TonB-dependent receptor  28.92 
 
 		 685 aa  208  3e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4488  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 835 aa  207  4e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3729  TonB-dependent receptor, putative  25.86 
 
 		 778 aa  206  1e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000373318  normal  0.721597 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2321  TonB-dependent receptor, putative  29.35 
 
 		 709 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.493897  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1978  outer membrane protein  26.38 
 
 		 801 aa  197  5.000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.103542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0708  TonB-dependent receptor, plug  26.72 
 
 		 744 aa  194  4e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3627  TonB-dependent receptor  25.23 
 
 		 744 aa  185  3e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000139063  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0551  TonB-dependent receptor  27.5 
 
 		 733 aa  184  6e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.629102  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1189  TonB-dependent receptor  30.73 
 
 		 702 aa  184  8.000000000000001e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000388358  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13940  TonB-dependent receptor  25.89 
 
 		 682 aa  176  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.137662  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0594  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 708 aa  170  9e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.601286  hitchhiker  0.00250598 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0069  iron-regulated outer membrane protein  23.52 
 
 		 868 aa  134  5e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.024885  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0859  TonB-dependent receptor plug  32.65 
 
 		 249 aa  99.4  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.152413  normal  0.604475 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2340  TonB-dependent receptor  36.42 
 
 		 836 aa  91.7  5e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000058543  normal  0.137103 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7106  TonB-dependent receptor  24.09 
 
 		 818 aa  91.7  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.385774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4568  TonB-dependent receptor  23.03 
 
 		 776 aa  82.8  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0270  TonB-dependent receptor  30.73 
 
 		 766 aa  80.1  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2591  hemin receptor precursor, TonB-dependent outer membrane uptake protein  23.39 
 
 		 687 aa  77.4  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.125278 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1480  TonB-dependent receptor  24.82 
 
 		 776 aa  75.5  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.329669  normal  0.154283 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1314  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 		 735 aa  74.3  0.000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  32.32 
 
 		 759 aa  73.6  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0176  TonB-dependent receptor  35.65 
 
 		 763 aa  71.6  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3738  TonB-dependent receptor  31.25 
 
 		 665 aa  68.6  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  0.0543439 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3288  TonB-dependent receptor  38.3 
 
 		 730 aa  68.6  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1572  TonB-dependent receptor  29.95 
 
 		 780 aa  68.2  0.0000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0693034  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3709  outer membrane receptor protein  34.82 
 
 		 776 aa  67.4  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0256653 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  30.83 
 
 		 681 aa  64.3  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  33.81 
 
 		 617 aa  63.5  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0074  heme receptor HutR  37.61 
 
 		 713 aa  62.8  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0136209  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  29.84 
 
 		 698 aa  63.2  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1868  TonB-dependent receptor  30.54 
 
 		 734 aa  62.4  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.155376  normal  0.191225 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05789  hypothetical protein  23.18 
 
 		 712 aa  62  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>