130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1480 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1480  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 776 aa  1600    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.329669  normal  0.154283 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2339  TonB-dependent receptor  41.58 
 
 		 797 aa  615  1e-175  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.608898  normal  0.596694 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0270  TonB-dependent receptor  26.17 
 
 		 766 aa  259  1e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1214  TonB-dependent receptor  28.2 
 
 		 734 aa  189  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.772889  normal  0.0390037 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13940  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 682 aa  143  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.137662  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04789  TonB-dependent outer membrane Receptor  27.12 
 
 		 600 aa  142  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0342163  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0708  TonB-dependent receptor, plug  24.44 
 
 		 744 aa  138  5e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0295  TonB-dependent receptor  25.76 
 
 		 797 aa  134  6.999999999999999e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.141972  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1776  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 681 aa  132  2.0000000000000002e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.506157  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1847  outer membrane hemin receptor  25.36 
 
 		 681 aa  132  3e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3948  TonB-dependent receptor  24.45 
 
 		 730 aa  126  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32851 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3717  TonB-dependent receptor  24.75 
 
 		 702 aa  125  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429203  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03676  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 821 aa  121  3.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00269599  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4738  hypothetical protein  24.4 
 
 		 687 aa  121  6e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122905  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2378  TonB-dependent receptor  28.04 
 
 		 719 aa  120  9e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54180  hypothetical protein  24.21 
 
 		 687 aa  119  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1010  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 695 aa  119  3e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3627  TonB-dependent receptor  23.66 
 
 		 744 aa  117  5e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000139063  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1083  TonB-dependent receptor  24.76 
 
 		 681 aa  117  6e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.654229  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1446  TonB-dependent receptor  24.56 
 
 		 680 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.757282 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0159  TonB-dependent receptor  25.05 
 
 		 727 aa  117  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.630357  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2054  TonB-dependent receptor plug  27.24 
 
 		 714 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1842  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 		 693 aa  116  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1683  TonB-dependent receptor  25.25 
 
 		 727 aa  116  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4275  TonB-dependent receptor  24.52 
 
 		 685 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2033  TonB-dependent receptor  24.55 
 
 		 695 aa  115  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000947033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2102  TonB-dependent receptor plug  27.65 
 
 		 719 aa  115  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121164 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4694  TonB-dependent receptor  25.32 
 
 		 685 aa  114  6e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0123  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 		 719 aa  114  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.333478 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0745  TonB-dependent receptor, plug  23.84 
 
 		 758 aa  114  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3573  TonB-dependent receptor plug  24.14 
 
 		 758 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3695  outer membrane insertion C-terminal signal  23.94 
 
 		 758 aa  112  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.122908 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1978  outer membrane protein  23.67 
 
 		 801 aa  112  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.103542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0594  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 708 aa  112  4.0000000000000004e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.601286  hitchhiker  0.00250598 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3729  TonB-dependent receptor, putative  27.22 
 
 		 778 aa  111  5e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000373318  normal  0.721597 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4359  TonB-dependent receptor  23.75 
 
 		 682 aa  110  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503749 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3505  outer membrane insertion C-terminal signal  23.94 
 
 		 758 aa  110  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2807  TonB-dependent receptor  24.32 
 
 		 713 aa  110  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2510  TonB-dependent receptor  24.03 
 
 		 689 aa  108  4e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0311712  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2604  TonB-dependent receptor  22.61 
 
 		 706 aa  107  6e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000145461  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4488  TonB-dependent receptor  24.24 
 
 		 835 aa  107  7e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0134  TonB-dependent receptor  24.18 
 
 		 694 aa  105  4e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3383  TonB-dependent receptor, plug  24.55 
 
 		 758 aa  105  4e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1894  TonB-dependent receptor  24.79 
 
 		 709 aa  102  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.123894 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2321  TonB-dependent receptor, putative  25.42 
 
 		 709 aa  101  5e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.493897  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1489  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 689 aa  100  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000345981  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1865  TonB-dependent receptor  23.54 
 
 		 705 aa  97.1  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1180  TonB-dependent receptor  25.24 
 
 		 705 aa  96.3  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00173216  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0754  TonB-dependent receptor  24.8 
 
 		 709 aa  96.3  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5735  TonB-dependent receptor plug  25.66 
 
 		 676 aa  95.1  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0861  TonB-dependent receptor plug  25.35 
 
 		 714 aa  94.7  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113091 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0551  TonB-dependent receptor  24.39 
 
 		 733 aa  91.3  6e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.629102  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3051  TonB-dependent receptor  24.85 
 
 		 702 aa  90.9  8e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.385439 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2932  putative iron complex outermembrane recepter protein  23.68 
 
 		 685 aa  90.1  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1902  TonB-dependent receptor  22.37 
 
 		 751 aa  86.3  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.357712  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1189  TonB-dependent receptor  23.92 
 
 		 702 aa  85.5  0.000000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000388358  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1405  TonB-dependent receptor  21.5 
 
 		 783 aa  80.1  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.148044  normal  0.749639 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2266  putative outer membrane hemin/siderophore receptor protein  24.82 
 
 		 774 aa  76.3  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0540  TonB-dependent receptor  30.26 
 
 		 699 aa  76.6  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1524  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 692 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.41177 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3927  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 742 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.889304  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4439  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 677 aa  75.5  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5866  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 694 aa  75.1  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.754568 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4185  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 724 aa  74.3  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.423461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4426  TonB-dependent receptor plug  24.66 
 
 		 707 aa  73.6  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.831114  normal  0.397066 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0527  TonB-dependent receptor  33.8 
 
 		 725 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4192  TonB-dependent receptor  23.31 
 
 		 784 aa  72.4  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0530533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4319  TonB-dependent receptor plug  24.59 
 
 		 723 aa  72.4  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.133256  normal  0.357062 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3951  TonB-dependent receptor plug  24.59 
 
 		 731 aa  72.4  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.478156  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3871  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 693 aa  71.2  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.284542 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4331  TonB-dependent receptor  30.28 
 
 		 677 aa  71.2  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.467615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2631  TonB-dependent receptor  21.71 
 
 		 799 aa  69.7  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0452445  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0251  TonB-dependent receptor  32.39 
 
 		 698 aa  69.3  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.818078  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4568  TonB-dependent receptor  23.91 
 
 		 776 aa  69.3  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0939  TonB-dependent receptor  32.39 
 
 		 751 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4046  TonB-dependent receptor  21.88 
 
 		 789 aa  68.9  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.236751 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1434  TonB-dependent receptor  32.39 
 
 		 681 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1631  TonB-dependent receptor  32.39 
 
 		 751 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.374553  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2644  TonB-dependent receptor  32.39 
 
 		 698 aa  69.3  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.700465  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2505  TonB-dependent receptor  32.39 
 
 		 698 aa  69.3  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.351153  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0287  TonB-dependent receptor  32.39 
 
 		 681 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.566628  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2340  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 836 aa  68.6  0.0000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000058543  normal  0.137103 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4869  TonB-dependent receptor  23.78 
 
 		 784 aa  67.8  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.188313  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0069  iron-regulated outer membrane protein  34.81 
 
 		 868 aa  67.4  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.024885  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1938  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 801 aa  64.3  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.17436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3257  TonB-dependent receptor, plug  41.86 
 
 		 782 aa  62  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.393029  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  22.28 
 
 		 759 aa  56.6  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3709  outer membrane receptor protein  30.08 
 
 		 776 aa  55.5  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0256653 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0590  hemoglobin and hemoglobin-haptoglobin binding protein B  31.82 
 
 		 998 aa  54.7  0.000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2015  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 732 aa  53.9  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1519  TonB-dependent receptor  23.46 
 
 		 657 aa  52.8  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.148558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3750  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 741 aa  53.1  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0204  TonB-dependent receptor  20.29 
 
 		 678 aa  52.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1572  TonB-dependent receptor  30.77 
 
 		 780 aa  52  0.00005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0693034  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2832  TonB-dependent receptor  23.65 
 
 		 768 aa  52  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3229  TonB-dependent receptor  23.65 
 
 		 768 aa  52  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3430  outer membrane receptor FepA  25.73 
 
 		 759 aa  50.8  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101807 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4607  TonB-dependent copper receptor  30.86 
 
 		 724 aa  48.1  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0702651  normal  0.0726755 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2509  TonB-dependent receptor  21.92 
 
 		 803 aa  48.5  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0337373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0821  TonB-dependent copper receptor  32.28 
 
 		 749 aa  48.1  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>