More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1572 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1572  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 780 aa  1612    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0693034  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0204  TonB-dependent receptor  38.41 
 
 		 678 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4568  TonB-dependent receptor  35.93 
 
 		 776 aa  464  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1938  TonB-dependent receptor  34.78 
 
 		 801 aa  407  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.17436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3709  outer membrane receptor protein  35.09 
 
 		 776 aa  402  9.999999999999999e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0256653 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08651  hypothetical protein  32 
 
 		 799 aa  377  1e-103  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.950762  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0176  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 		 763 aa  257  7e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 		 759 aa  242  2e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1314  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 		 735 aa  218  4e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4561  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 		 824 aa  194  4e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0251417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3288  TonB-dependent receptor  25.72 
 
 		 730 aa  193  1e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1366  tonB-linked outer membrane receptor  23.68 
 
 		 811 aa  192  2e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.351505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7106  TonB-dependent receptor  25.54 
 
 		 818 aa  189  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.385774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0540  TonB-dependent receptor  23.53 
 
 		 699 aa  142  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0754  TonB-dependent receptor  22.17 
 
 		 709 aa  130  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2015  TonB-dependent receptor  23.15 
 
 		 732 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1446  TonB-dependent receptor  23.06 
 
 		 680 aa  117  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.757282 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4275  TonB-dependent receptor  22.75 
 
 		 685 aa  114  9e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1083  TonB-dependent receptor  22.44 
 
 		 681 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.654229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4359  TonB-dependent receptor  21.99 
 
 		 682 aa  110  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503749 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4738  hypothetical protein  23.65 
 
 		 687 aa  106  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122905  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54180  hypothetical protein  23.5 
 
 		 687 aa  105  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1489  TonB-dependent receptor  20.95 
 
 		 689 aa  102  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000345981  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5866  TonB-dependent receptor  22.08 
 
 		 694 aa  98.2  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.754568 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0551  TonB-dependent receptor  21.07 
 
 		 733 aa  97.8  6e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.629102  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3927  TonB-dependent receptor  21.94 
 
 		 742 aa  97.8  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.889304  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4439  TonB-dependent receptor  21.94 
 
 		 677 aa  97.4  9e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3383  TonB-dependent receptor, plug  21.79 
 
 		 758 aa  92.8  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0745  TonB-dependent receptor, plug  21.9 
 
 		 758 aa  91.7  5e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3695  outer membrane insertion C-terminal signal  21.95 
 
 		 758 aa  89.7  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.122908 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3505  outer membrane insertion C-terminal signal  21.71 
 
 		 758 aa  87.4  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1894  TonB-dependent receptor  23.9 
 
 		 709 aa  85.9  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.123894 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4694  TonB-dependent receptor  24.36 
 
 		 685 aa  85.1  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3573  TonB-dependent receptor plug  21.47 
 
 		 758 aa  84  0.000000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1214  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 734 aa  84  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.772889  normal  0.0390037 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2510  TonB-dependent receptor  21.76 
 
 		 689 aa  81.6  0.00000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0311712  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2604  TonB-dependent receptor  21.6 
 
 		 706 aa  77.8  0.0000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000145461  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6129  TonB-dependent receptor plug  24.23 
 
 		 721 aa  76.3  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3729  TonB-dependent receptor, putative  27.01 
 
 		 778 aa  75.5  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000373318  normal  0.721597 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1180  TonB-dependent receptor  30.88 
 
 		 705 aa  73.9  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00173216  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2807  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 713 aa  73.9  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0159  TonB-dependent receptor  36.79 
 
 		 727 aa  71.6  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.630357  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0861  TonB-dependent receptor plug  23.73 
 
 		 714 aa  71.6  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113091 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3179  TonB-dependent receptor, plug  26.17 
 
 		 788 aa  71.2  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2054  TonB-dependent receptor plug  34.26 
 
 		 714 aa  71.2  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2102  TonB-dependent receptor plug  32.77 
 
 		 719 aa  70.5  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121164 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1524  TonB-dependent receptor  27.74 
 
 		 692 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.41177 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1405  TonB-dependent receptor  35.07 
 
 		 783 aa  70.5  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.148044  normal  0.749639 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0708  TonB-dependent receptor, plug  23.04 
 
 		 744 aa  70.5  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2378  TonB-dependent receptor  34.26 
 
 		 719 aa  70.5  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4185  TonB-dependent receptor  25.75 
 
 		 724 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.423461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  26.72 
 
 		 795 aa  70.1  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4269  TonB-dependent receptor, plug  25.76 
 
 		 797 aa  69.3  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4331  TonB-dependent receptor  28.36 
 
 		 677 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.467615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1010  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 695 aa  69.7  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3871  TonB-dependent receptor  28.36 
 
 		 693 aa  69.3  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.284542 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00089  putative outer membrane receptor protein  43.84 
 
 		 87 aa  68.6  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13940  TonB-dependent receptor  21.79 
 
 		 682 aa  68.6  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.137662  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0527  TonB-dependent receptor  30.56 
 
 		 725 aa  67.4  0.0000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2932  putative iron complex outermembrane recepter protein  32.31 
 
 		 685 aa  67.4  0.0000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4192  TonB-dependent receptor  33.05 
 
 		 784 aa  66.6  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0530533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1434  TonB-dependent receptor  31.48 
 
 		 681 aa  67  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0287  TonB-dependent receptor  31.48 
 
 		 681 aa  67  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.566628  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0251  TonB-dependent receptor  31.48 
 
 		 698 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.818078  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0939  TonB-dependent receptor  31.48 
 
 		 751 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2266  putative outer membrane hemin/siderophore receptor protein  28.21 
 
 		 774 aa  66.6  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04789  TonB-dependent outer membrane Receptor  24.7 
 
 		 600 aa  66.6  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0342163  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1631  TonB-dependent receptor  31.48 
 
 		 751 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.374553  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2644  TonB-dependent receptor  31.48 
 
 		 698 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.700465  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1776  TonB-dependent receptor  32.69 
 
 		 681 aa  65.5  0.000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.506157  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1847  outer membrane hemin receptor  32.69 
 
 		 681 aa  65.5  0.000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0123  TonB-dependent receptor  33.02 
 
 		 719 aa  65.9  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.333478 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5735  TonB-dependent receptor plug  32.35 
 
 		 676 aa  65.9  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3717  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 		 702 aa  65.5  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429203  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2505  TonB-dependent receptor  31.48 
 
 		 698 aa  65.5  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.351153  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3051  TonB-dependent receptor  30.65 
 
 		 702 aa  65.1  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.385439 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0134  TonB-dependent receptor  35.51 
 
 		 694 aa  64.7  0.000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  25.57 
 
 		 776 aa  64.7  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1842  TonB-dependent receptor  23.55 
 
 		 693 aa  64.7  0.000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3409  TonB-dependent receptor  31.61 
 
 		 698 aa  63.5  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4046  TonB-dependent receptor  34.58 
 
 		 789 aa  63.9  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.236751 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3276  TonB-dependent receptor  31.61 
 
 		 698 aa  63.5  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2033  TonB-dependent receptor  23.24 
 
 		 695 aa  63.5  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000947033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0938  TonB-dependent receptor  31.61 
 
 		 698 aa  63.5  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00410623  normal  0.440689 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2631  TonB-dependent receptor  32.26 
 
 		 799 aa  63.2  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0452445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3257  TonB-dependent receptor, plug  36.17 
 
 		 782 aa  62.8  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.393029  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4607  TonB-dependent copper receptor  32.56 
 
 		 724 aa  62.4  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0702651  normal  0.0726755 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4869  TonB-dependent receptor  30.51 
 
 		 784 aa  62  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.188313  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02495  hypothetical protein  27.4 
 
 		 777 aa  61.6  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1865  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 705 aa  62  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4426  TonB-dependent receptor plug  26.96 
 
 		 707 aa  61.2  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.831114  normal  0.397066 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0596  TonB-dependent copper receptor  27.27 
 
 		 710 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.834175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2516  TonB-dependent receptor plug  25 
 
 		 772 aa  60.8  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3627  TonB-dependent receptor  29.71 
 
 		 744 aa  60.1  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000139063  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  26.94 
 
 		 663 aa  60.5  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0558  TonB-dependent receptor plug  24.72 
 
 		 817 aa  60.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000727933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1453  TonB-dependent receptor  28.46 
 
 		 798 aa  59.7  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545362  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4319  TonB-dependent receptor plug  38.89 
 
 		 723 aa  59.7  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.133256  normal  0.357062 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3951  TonB-dependent receptor plug  38.89 
 
 		 731 aa  59.7  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.478156  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5346  TonB-dependent receptor plug  25.35 
 
 		 763 aa  58.5  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>