142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0069 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0069  iron-regulated outer membrane protein  100 
 
 		 868 aa  1808    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.024885  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3948  TonB-dependent receptor  28.42 
 
 		 730 aa  326  9e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32851 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1842  TonB-dependent receptor  27.8 
 
 		 693 aa  303  1e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2033  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 695 aa  300  8e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000947033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3383  TonB-dependent receptor, plug  25 
 
 		 758 aa  175  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13940  TonB-dependent receptor  37.74 
 
 		 682 aa  175  2.9999999999999996e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.137662  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4694  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 685 aa  157  6e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3627  TonB-dependent receptor  40.64 
 
 		 744 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000139063  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0708  TonB-dependent receptor, plug  24.18 
 
 		 744 aa  149  3e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1902  TonB-dependent receptor  38.68 
 
 		 751 aa  147  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.357712  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0551  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 733 aa  146  2e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.629102  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2510  TonB-dependent receptor  40.58 
 
 		 689 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0311712  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1865  TonB-dependent receptor  23.24 
 
 		 705 aa  139  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1978  outer membrane protein  36.68 
 
 		 801 aa  139  3.0000000000000003e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.103542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2604  TonB-dependent receptor  36.49 
 
 		 706 aa  139  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000145461  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1489  TonB-dependent receptor  35.71 
 
 		 689 aa  135  3e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000345981  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1214  TonB-dependent receptor  32.33 
 
 		 734 aa  135  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.772889  normal  0.0390037 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2266  putative outer membrane hemin/siderophore receptor protein  22.74 
 
 		 774 aa  134  6.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03676  TonB-dependent receptor  36.06 
 
 		 821 aa  130  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00269599  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4488  TonB-dependent receptor  34.23 
 
 		 835 aa  128  4.0000000000000003e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3717  TonB-dependent receptor  38.18 
 
 		 702 aa  127  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429203  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0159  TonB-dependent receptor  34.51 
 
 		 727 aa  124  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.630357  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2932  putative iron complex outermembrane recepter protein  39.71 
 
 		 685 aa  124  9e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1010  TonB-dependent receptor  31.97 
 
 		 695 aa  124  9.999999999999999e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3695  outer membrane insertion C-terminal signal  36.23 
 
 		 758 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.122908 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2321  TonB-dependent receptor, putative  32 
 
 		 709 aa  123  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.493897  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1847  outer membrane hemin receptor  33.88 
 
 		 681 aa  121  6e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1776  TonB-dependent receptor  33.88 
 
 		 681 aa  120  9e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.506157  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3505  outer membrane insertion C-terminal signal  35.38 
 
 		 758 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2102  TonB-dependent receptor plug  31.82 
 
 		 719 aa  120  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121164 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3573  TonB-dependent receptor plug  35.75 
 
 		 758 aa  120  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2378  TonB-dependent receptor  31.82 
 
 		 719 aa  120  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0134  TonB-dependent receptor  23.95 
 
 		 694 aa  119  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0123  TonB-dependent receptor  33.2 
 
 		 719 aa  119  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.333478 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2054  TonB-dependent receptor plug  31.36 
 
 		 714 aa  119  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0745  TonB-dependent receptor, plug  35.27 
 
 		 758 aa  117  6e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0861  TonB-dependent receptor plug  30.11 
 
 		 714 aa  118  6e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113091 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1683  TonB-dependent receptor  36.45 
 
 		 727 aa  117  6.9999999999999995e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04789  TonB-dependent outer membrane Receptor  36.1 
 
 		 600 aa  117  6.9999999999999995e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0342163  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2340  TonB-dependent receptor  30.34 
 
 		 836 aa  116  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000058543  normal  0.137103 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2807  TonB-dependent receptor  35.21 
 
 		 713 aa  115  4.0000000000000004e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5735  TonB-dependent receptor plug  34.01 
 
 		 676 aa  114  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0754  TonB-dependent receptor  30.36 
 
 		 709 aa  112  4.0000000000000004e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1180  TonB-dependent receptor  28.62 
 
 		 705 aa  112  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00173216  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0859  TonB-dependent receptor plug  35.88 
 
 		 249 aa  108  3e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.152413  normal  0.604475 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0295  TonB-dependent receptor  36.54 
 
 		 797 aa  108  5e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.141972  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4738  hypothetical protein  33.21 
 
 		 687 aa  108  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122905  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4869  TonB-dependent receptor  23.99 
 
 		 784 aa  107  7e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.188313  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3729  TonB-dependent receptor, putative  31.54 
 
 		 778 aa  107  7e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000373318  normal  0.721597 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54180  hypothetical protein  35.45 
 
 		 687 aa  107  9e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3051  TonB-dependent receptor  31.27 
 
 		 702 aa  107  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.385439 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4426  TonB-dependent receptor plug  32.99 
 
 		 707 aa  107  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.831114  normal  0.397066 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4319  TonB-dependent receptor plug  32.34 
 
 		 723 aa  107  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.133256  normal  0.357062 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0540  TonB-dependent receptor  29.73 
 
 		 699 aa  106  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3951  TonB-dependent receptor plug  32.34 
 
 		 731 aa  106  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.478156  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1083  TonB-dependent receptor  34.25 
 
 		 681 aa  105  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.654229  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1446  TonB-dependent receptor  34.55 
 
 		 680 aa  104  8e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.757282 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4275  TonB-dependent receptor  34.55 
 
 		 685 aa  103  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4359  TonB-dependent receptor  34.25 
 
 		 682 aa  103  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503749 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0594  TonB-dependent receptor  32.14 
 
 		 708 aa  102  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.601286  hitchhiker  0.00250598 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3927  TonB-dependent receptor  33.94 
 
 		 742 aa  100  9e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.889304  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4439  TonB-dependent receptor  33.94 
 
 		 677 aa  100  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5866  TonB-dependent receptor  33.94 
 
 		 694 aa  100  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.754568 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1524  TonB-dependent receptor  33.48 
 
 		 692 aa  99  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.41177 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4331  TonB-dependent receptor  32.42 
 
 		 677 aa  97.8  9e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.467615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4192  TonB-dependent receptor  23.48 
 
 		 784 aa  96.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0530533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3871  TonB-dependent receptor  31.96 
 
 		 693 aa  96.3  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.284542 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1894  TonB-dependent receptor  28.27 
 
 		 709 aa  95.5  4e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.123894 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4185  TonB-dependent receptor  31.46 
 
 		 724 aa  94  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.423461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3257  TonB-dependent receptor, plug  32.27 
 
 		 782 aa  93.2  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.393029  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1405  TonB-dependent receptor  29.39 
 
 		 783 aa  91.7  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.148044  normal  0.749639 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2631  TonB-dependent receptor  29.46 
 
 		 799 aa  89.7  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0452445  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0251  TonB-dependent receptor  46.88 
 
 		 698 aa  89.4  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.818078  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0939  TonB-dependent receptor  46.88 
 
 		 751 aa  89.4  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0527  TonB-dependent receptor  47.92 
 
 		 725 aa  89.4  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1434  TonB-dependent receptor  46.88 
 
 		 681 aa  89  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1631  TonB-dependent receptor  46.88 
 
 		 751 aa  89.4  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.374553  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2644  TonB-dependent receptor  46.88 
 
 		 698 aa  89.4  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.700465  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2505  TonB-dependent receptor  46.88 
 
 		 698 aa  89.4  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.351153  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0287  TonB-dependent receptor  46.88 
 
 		 681 aa  89  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.566628  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1189  TonB-dependent receptor  26.83 
 
 		 702 aa  86.3  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000388358  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4046  TonB-dependent receptor  22.45 
 
 		 789 aa  85.9  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.236751 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0270  TonB-dependent receptor  31.36 
 
 		 766 aa  74.7  0.000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1480  TonB-dependent receptor  31.85 
 
 		 776 aa  72  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.329669  normal  0.154283 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2015  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 732 aa  63.5  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4568  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 		 776 aa  62  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  22.51 
 
 		 759 aa  62  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2339  TonB-dependent receptor  32 
 
 		 797 aa  58.2  0.0000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.608898  normal  0.596694 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1314  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 		 735 aa  57.8  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0303  TonB-dependent receptor  28.18 
 
 		 681 aa  57.4  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1006  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.16 
 
 		 759 aa  54.3  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3288  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 730 aa  54.3  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1043  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.16 
 
 		 862 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0176  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 763 aa  51.6  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0131  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 695 aa  51.6  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0947  TonB-dependent siderophore receptor  31.82 
 
 		 683 aa  51.6  0.00007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0779656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1938  TonB-dependent receptor  28.24 
 
 		 801 aa  51.6  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.17436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4561  TonB-dependent receptor  23.43 
 
 		 824 aa  51.2  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0251417  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4077  TonB-dependent receptor, putative  29.27 
 
 		 708 aa  50.1  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  25.14 
 
 		 686 aa  49.3  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>