More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5735 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2102  TonB-dependent receptor plug  65.09 
 
 		 719 aa  862    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121164 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4426  TonB-dependent receptor plug  78.62 
 
 		 707 aa  1048    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.831114  normal  0.397066 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4319  TonB-dependent receptor plug  75.83 
 
 		 723 aa  1019    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.133256  normal  0.357062 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0861  TonB-dependent receptor plug  84.76 
 
 		 714 aa  1179    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113091 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1180  TonB-dependent receptor  68.62 
 
 		 705 aa  917    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00173216  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5735  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 676 aa  1363    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3951  TonB-dependent receptor plug  75.83 
 
 		 731 aa  1019    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.478156  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2378  TonB-dependent receptor  64.79 
 
 		 719 aa  860    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2054  TonB-dependent receptor plug  65.05 
 
 		 714 aa  863    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2631  TonB-dependent receptor  47.9 
 
 		 799 aa  622  1e-177  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0452445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2266  putative outer membrane hemin/siderophore receptor protein  48.06 
 
 		 774 aa  625  1e-177  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3257  TonB-dependent receptor, plug  48.84 
 
 		 782 aa  617  1e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.393029  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3051  TonB-dependent receptor  47.06 
 
 		 702 aa  604  1.0000000000000001e-171  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.385439 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1405  TonB-dependent receptor  46.01 
 
 		 783 aa  598  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.148044  normal  0.749639 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4192  TonB-dependent receptor  45.01 
 
 		 784 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0530533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4869  TonB-dependent receptor  46.93 
 
 		 784 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.188313  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4046  TonB-dependent receptor  45.71 
 
 		 789 aa  560  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.236751 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1865  TonB-dependent receptor  42.09 
 
 		 705 aa  464  1e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0159  TonB-dependent receptor  34.07 
 
 		 727 aa  314  3.9999999999999997e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.630357  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5866  TonB-dependent receptor  33.63 
 
 		 694 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.754568 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3871  TonB-dependent receptor  33.09 
 
 		 693 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.284542 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1524  TonB-dependent receptor  33.48 
 
 		 692 aa  302  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.41177 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3927  TonB-dependent receptor  33.64 
 
 		 742 aa  302  2e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.889304  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4439  TonB-dependent receptor  33.8 
 
 		 677 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4185  TonB-dependent receptor  33.53 
 
 		 724 aa  298  2e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.423461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4331  TonB-dependent receptor  33.03 
 
 		 677 aa  296  1e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.467615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1083  TonB-dependent receptor  32.74 
 
 		 681 aa  295  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.654229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4275  TonB-dependent receptor  32.25 
 
 		 685 aa  295  3e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1446  TonB-dependent receptor  32.34 
 
 		 680 aa  292  1e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.757282 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4359  TonB-dependent receptor  32.39 
 
 		 682 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503749 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0123  TonB-dependent receptor  32.5 
 
 		 719 aa  290  5.0000000000000004e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.333478 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0134  TonB-dependent receptor  31.56 
 
 		 694 aa  288  2e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4738  hypothetical protein  32.34 
 
 		 687 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122905  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54180  hypothetical protein  32.78 
 
 		 687 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0939  TonB-dependent receptor  33.73 
 
 		 751 aa  284  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0287  TonB-dependent receptor  33.73 
 
 		 681 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.566628  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2505  TonB-dependent receptor  33.73 
 
 		 698 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.351153  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1434  TonB-dependent receptor  33.73 
 
 		 681 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0251  TonB-dependent receptor  33.73 
 
 		 698 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.818078  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1631  TonB-dependent receptor  33.73 
 
 		 751 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.374553  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2644  TonB-dependent receptor  33.73 
 
 		 698 aa  283  7.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.700465  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0527  TonB-dependent receptor  33.19 
 
 		 725 aa  281  2e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2604  TonB-dependent receptor  30.42 
 
 		 706 aa  274  5.000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000145461  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2932  putative iron complex outermembrane recepter protein  32.68 
 
 		 685 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1489  TonB-dependent receptor  31.36 
 
 		 689 aa  268  2.9999999999999995e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000345981  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4694  TonB-dependent receptor  33.53 
 
 		 685 aa  268  2.9999999999999995e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3717  TonB-dependent receptor  32.12 
 
 		 702 aa  266  8.999999999999999e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429203  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2807  TonB-dependent receptor  32.38 
 
 		 713 aa  265  1e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13940  TonB-dependent receptor  32.51 
 
 		 682 aa  263  1e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.137662  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2510  TonB-dependent receptor  32.63 
 
 		 689 aa  259  1e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0311712  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1010  TonB-dependent receptor  30.43 
 
 		 695 aa  258  2e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2033  TonB-dependent receptor  32.7 
 
 		 695 aa  257  5e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000947033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1842  TonB-dependent receptor  32.65 
 
 		 693 aa  256  7e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0754  TonB-dependent receptor  32.46 
 
 		 709 aa  256  1.0000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1683  TonB-dependent receptor  30.04 
 
 		 727 aa  254  3e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0540  TonB-dependent receptor  31.88 
 
 		 699 aa  254  4.0000000000000004e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1894  TonB-dependent receptor  30.68 
 
 		 709 aa  252  1e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.123894 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3695  outer membrane insertion C-terminal signal  30.8 
 
 		 758 aa  248  3e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.122908 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3573  TonB-dependent receptor plug  30.8 
 
 		 758 aa  247  4.9999999999999997e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1776  TonB-dependent receptor  30.83 
 
 		 681 aa  246  9.999999999999999e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.506157  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1847  outer membrane hemin receptor  30.83 
 
 		 681 aa  245  1.9999999999999999e-63  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3505  outer membrane insertion C-terminal signal  30.65 
 
 		 758 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3948  TonB-dependent receptor  29.9 
 
 		 730 aa  245  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32851 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0745  TonB-dependent receptor, plug  30.8 
 
 		 758 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3627  TonB-dependent receptor  29.48 
 
 		 744 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000139063  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3383  TonB-dependent receptor, plug  31.31 
 
 		 758 aa  243  9e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04789  TonB-dependent outer membrane Receptor  31.03 
 
 		 600 aa  243  1e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0342163  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1902  TonB-dependent receptor  29.9 
 
 		 751 aa  234  4.0000000000000004e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.357712  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03676  TonB-dependent receptor  28.24 
 
 		 821 aa  228  2e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00269599  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1214  TonB-dependent receptor  28.41 
 
 		 734 aa  227  7e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.772889  normal  0.0390037 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4488  TonB-dependent receptor  29.15 
 
 		 835 aa  226  1e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1978  outer membrane protein  28 
 
 		 801 aa  223  7e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.103542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0708  TonB-dependent receptor, plug  27.79 
 
 		 744 aa  210  6e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0295  TonB-dependent receptor  28.29 
 
 		 797 aa  207  4e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.141972  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2321  TonB-dependent receptor, putative  29.21 
 
 		 709 aa  207  7e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.493897  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0551  TonB-dependent receptor  29.27 
 
 		 733 aa  199  1.0000000000000001e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.629102  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0594  TonB-dependent receptor  29.44 
 
 		 708 aa  198  2.0000000000000003e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.601286  hitchhiker  0.00250598 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1189  TonB-dependent receptor  29.85 
 
 		 702 aa  191  2.9999999999999997e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000388358  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3729  TonB-dependent receptor, putative  24.64 
 
 		 778 aa  177  4e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000373318  normal  0.721597 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  26.65 
 
 		 759 aa  139  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1314  TonB-dependent receptor  24.39 
 
 		 735 aa  127  8.000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0069  iron-regulated outer membrane protein  34.01 
 
 		 868 aa  114  5e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.024885  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0176  TonB-dependent receptor  23.33 
 
 		 763 aa  114  6e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0859  TonB-dependent receptor plug  36.97 
 
 		 249 aa  113  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.152413  normal  0.604475 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2340  TonB-dependent receptor  32.77 
 
 		 836 aa  113  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000058543  normal  0.137103 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4568  TonB-dependent receptor  26.17 
 
 		 776 aa  101  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3709  outer membrane receptor protein  24.39 
 
 		 776 aa  100  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0256653 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1480  TonB-dependent receptor  25.66 
 
 		 776 aa  95.1  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.329669  normal  0.154283 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7106  TonB-dependent receptor  23.35 
 
 		 818 aa  90.1  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.385774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0204  TonB-dependent receptor  24.73 
 
 		 678 aa  89  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0270  TonB-dependent receptor  23.42 
 
 		 766 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3288  TonB-dependent receptor  22.24 
 
 		 730 aa  78.2  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2015  TonB-dependent receptor  22.98 
 
 		 732 aa  76.3  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1366  tonB-linked outer membrane receptor  24.05 
 
 		 811 aa  75.9  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.351505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1938  TonB-dependent receptor  24.04 
 
 		 801 aa  75.5  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.17436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2339  TonB-dependent receptor  24.6 
 
 		 797 aa  73.6  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.608898  normal  0.596694 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4561  TonB-dependent receptor  24.64 
 
 		 824 aa  71.2  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0251417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1105  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor:TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  32.52 
 
 		 859 aa  67.8  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1572  TonB-dependent receptor  32.35 
 
 		 780 aa  65.9  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0693034  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1926  TonB-dependent receptor  36.28 
 
 		 627 aa  65.1  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.201933  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>