More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4561 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1366  tonB-linked outer membrane receptor  53.44 
 
 		 811 aa  885    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.351505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4561  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 824 aa  1686    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0251417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7106  TonB-dependent receptor  37.06 
 
 		 818 aa  446  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.385774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0176  TonB-dependent receptor  32.14 
 
 		 763 aa  362  2e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1314  TonB-dependent receptor  32.56 
 
 		 735 aa  339  9.999999999999999e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  30.18 
 
 		 759 aa  302  2e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1938  TonB-dependent receptor  27.34 
 
 		 801 aa  222  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.17436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3288  TonB-dependent receptor  26.08 
 
 		 730 aa  214  3.9999999999999995e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4568  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 776 aa  211  4e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0204  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 678 aa  206  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1572  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 		 780 aa  194  4e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0693034  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3709  outer membrane receptor protein  25.66 
 
 		 776 aa  192  2e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0256653 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08651  hypothetical protein  24.76 
 
 		 799 aa  157  1e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.950762  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54180  hypothetical protein  24.5 
 
 		 687 aa  114  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4738  hypothetical protein  24.42 
 
 		 687 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122905  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2510  TonB-dependent receptor  23.01 
 
 		 689 aa  109  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0311712  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3383  TonB-dependent receptor, plug  23.34 
 
 		 758 aa  107  7e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0551  TonB-dependent receptor  23.56 
 
 		 733 aa  107  9e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.629102  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4359  TonB-dependent receptor  24.31 
 
 		 682 aa  104  8e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503749 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4275  TonB-dependent receptor  23.93 
 
 		 685 aa  103  9e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1446  TonB-dependent receptor  23.92 
 
 		 680 aa  102  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.757282 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1804  TonB-dependent receptor  24.74 
 
 		 683 aa  100  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0894155  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0540  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 		 699 aa  99.8  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3871  TonB-dependent receptor  22.57 
 
 		 693 aa  99  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.284542 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2591  hemin receptor precursor, TonB-dependent outer membrane uptake protein  23.16 
 
 		 687 aa  98.6  4e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.125278 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1524  TonB-dependent receptor  22.57 
 
 		 692 aa  98.6  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.41177 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3927  TonB-dependent receptor  22.34 
 
 		 742 aa  98.6  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.889304  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0159  TonB-dependent receptor  22.42 
 
 		 727 aa  97.4  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.630357  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4439  TonB-dependent receptor  22.19 
 
 		 677 aa  97.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5866  TonB-dependent receptor  22.78 
 
 		 694 aa  96.3  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.754568 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4694  TonB-dependent receptor  23.22 
 
 		 685 aa  94.7  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04789  TonB-dependent outer membrane Receptor  23.59 
 
 		 600 aa  89.4  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0342163  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03722  outer membrane hemin receptor signal peptide protein  25.53 
 
 		 741 aa  89.4  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000281288  normal  0.0836882 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1769  TonB-dependent receptor plug  29.73 
 
 		 1085 aa  89  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2015  TonB-dependent receptor  21.81 
 
 		 732 aa  87.4  9e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1111  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  24.51 
 
 		 754 aa  87  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.192516 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1023  TonB-dependent receptor plug  29.07 
 
 		 769 aa  85.5  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.302797  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5315  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.35 
 
 		 767 aa  84.3  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6944  TonB-dependent receptor  28.87 
 
 		 757 aa  84.3  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1561  TonB-dependent receptor plug  23.29 
 
 		 681 aa  84.3  0.000000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000105774  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4534  TonB-dependent receptor  31.9 
 
 		 779 aa  84  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.732299 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1105  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor:TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  23.03 
 
 		 859 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  31.17 
 
 		 933 aa  83.2  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5752  TonB-dependent receptor  23.58 
 
 		 746 aa  83.2  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0523831  hitchhiker  0.0000000000276247 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3695  outer membrane insertion C-terminal signal  26.09 
 
 		 758 aa  83.2  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.122908 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0790  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  23.63 
 
 		 690 aa  82.4  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000110471  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1894  TonB-dependent receptor  27.5 
 
 		 709 aa  82.4  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.123894 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3573  TonB-dependent receptor plug  26.09 
 
 		 758 aa  82.4  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03676  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 821 aa  81.3  0.00000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00269599  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2320  TonB-dependent receptor  29.51 
 
 		 947 aa  81.6  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.500689  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1284  TonB-dependent outer membrane heme receptor  23.57 
 
 		 857 aa  81.3  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0645  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  23.83 
 
 		 750 aa  81.3  0.00000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0446508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0754  TonB-dependent receptor  29.41 
 
 		 709 aa  81.3  0.00000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2807  TonB-dependent receptor  23.37 
 
 		 713 aa  80.9  0.00000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1189  TonB-dependent receptor  22.31 
 
 		 702 aa  80.5  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000388358  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1180  TonB-dependent receptor  25.04 
 
 		 705 aa  80.1  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00173216  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3735  TonB-dependent receptor plug  23.31 
 
 		 628 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000331916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  31.33 
 
 		 1060 aa  80.5  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3505  outer membrane insertion C-terminal signal  25.54 
 
 		 758 aa  80.5  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2845  putative TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 715 aa  79.7  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.328029 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0745  TonB-dependent receptor, plug  27.97 
 
 		 758 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1274  TonB-dependent receptor plug  28.98 
 
 		 861 aa  79.7  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  30.5 
 
 		 698 aa  79  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5364  TonB-dependent receptor plug  25.75 
 
 		 729 aa  79.3  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2033  TonB-dependent receptor  27.5 
 
 		 695 aa  78.6  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000947033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2631  TonB-dependent receptor  25.05 
 
 		 799 aa  78.6  0.0000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0452445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1842  TonB-dependent receptor  27.5 
 
 		 693 aa  78.2  0.0000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4523  TonB-dependent receptor  35.95 
 
 		 998 aa  77.4  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0414328  normal  0.0764127 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5926  TonB-dependent receptor  29.72 
 
 		 924 aa  77.4  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.61038 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3040  TonB-dependent receptor plug  29.3 
 
 		 1107 aa  77  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0955373 
 
 
-
 
NC_002950  PG0668  TonB-dependent receptor  30.81 
 
 		 757 aa  76.6  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.217902 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5426  outer membrane hemin receptor  23.53 
 
 		 764 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3051  TonB-dependent receptor  24.37 
 
 		 702 aa  75.5  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.385439 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1691  TonB-dependent receptor, plug  31.17 
 
 		 732 aa  75.1  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524758  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1098  TonB-dependent receptor  30.25 
 
 		 1105 aa  75.1  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939091  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1865  TonB-dependent receptor  29.51 
 
 		 705 aa  74.7  0.000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04095  putative TonB-linked outer membrane receptor  27.91 
 
 		 767 aa  74.7  0.000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.221249  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4416  TonB-dependent receptor plug  30.42 
 
 		 996 aa  74.3  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000494503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4225  TonB-dependent receptor plug  25.53 
 
 		 1041 aa  74.3  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.501222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0277  TonB-dependent receptor plug  28.96 
 
 		 1096 aa  74.3  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.97163  normal  0.971813 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3948  TonB-dependent receptor  25.76 
 
 		 730 aa  73.9  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32851 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5431  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  24.62 
 
 		 755 aa  73.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.447482  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5431  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  24.62 
 
 		 755 aa  73.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.469015  normal  0.608312 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1902  TonB-dependent receptor  28.03 
 
 		 751 aa  73.6  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.357712  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3951  TonB-dependent receptor plug  25.45 
 
 		 731 aa  72.8  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.478156  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1683  TonB-dependent receptor  22.37 
 
 		 727 aa  72.8  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4319  TonB-dependent receptor plug  25.45 
 
 		 723 aa  73.2  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.133256  normal  0.357062 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0274  TonB-dependent receptor  29.8 
 
 		 1083 aa  73.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.302704 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62350  putative haem/haemoglobin uptake outer membrane receptor PhuR precursor  22.63 
 
 		 764 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4838  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  24.79 
 
 		 757 aa  73.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.982435 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  37.5 
 
 		 652 aa  73.2  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1083  TonB-dependent receptor  24.61 
 
 		 681 aa  72  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.654229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5579  TonB-dependent siderophore receptor  26.52 
 
 		 812 aa  72  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.761851 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1567  TonB-dependent receptor  28.84 
 
 		 780 aa  71.6  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0615105  normal  0.74927 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  32.22 
 
 		 1189 aa  71.2  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2102  TonB-dependent receptor plug  24.75 
 
 		 719 aa  71.6  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121164 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6611  TonB-dependent receptor plug  29.02 
 
 		 1137 aa  71.6  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2744  TonB-dependent receptor  22.01 
 
 		 701 aa  71.6  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5735  TonB-dependent receptor plug  24.64 
 
 		 676 aa  71.2  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0967  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 1093 aa  71.2  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>