More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1865 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1865  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 705 aa  1424    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1180  TonB-dependent receptor  44.46 
 
 		 705 aa  498  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00173216  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2054  TonB-dependent receptor plug  41.47 
 
 		 714 aa  474  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2378  TonB-dependent receptor  41.63 
 
 		 719 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2102  TonB-dependent receptor plug  41.63 
 
 		 719 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121164 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0861  TonB-dependent receptor plug  39.61 
 
 		 714 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113091 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4426  TonB-dependent receptor plug  42.77 
 
 		 707 aa  465  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.831114  normal  0.397066 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5735  TonB-dependent receptor plug  42.09 
 
 		 676 aa  465  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3051  TonB-dependent receptor  40.92 
 
 		 702 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.385439 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3951  TonB-dependent receptor plug  40.75 
 
 		 731 aa  444  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.478156  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4319  TonB-dependent receptor plug  40.75 
 
 		 723 aa  444  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.133256  normal  0.357062 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2266  putative outer membrane hemin/siderophore receptor protein  39.8 
 
 		 774 aa  424  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3257  TonB-dependent receptor, plug  40.63 
 
 		 782 aa  424  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.393029  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1405  TonB-dependent receptor  39.16 
 
 		 783 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.148044  normal  0.749639 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4192  TonB-dependent receptor  37.41 
 
 		 784 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0530533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2631  TonB-dependent receptor  38.02 
 
 		 799 aa  398  1e-109  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0452445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4869  TonB-dependent receptor  36.14 
 
 		 784 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.188313  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4046  TonB-dependent receptor  38.61 
 
 		 789 aa  391  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.236751 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1083  TonB-dependent receptor  36.6 
 
 		 681 aa  352  1e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.654229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0134  TonB-dependent receptor  35.62 
 
 		 694 aa  349  1e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1446  TonB-dependent receptor  35.92 
 
 		 680 aa  347  3e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.757282 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4275  TonB-dependent receptor  35.26 
 
 		 685 aa  342  1e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4359  TonB-dependent receptor  35.47 
 
 		 682 aa  340  7e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503749 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2604  TonB-dependent receptor  32.52 
 
 		 706 aa  340  8e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000145461  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4738  hypothetical protein  35.24 
 
 		 687 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122905  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1524  TonB-dependent receptor  34.73 
 
 		 692 aa  329  1.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.41177 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3505  outer membrane insertion C-terminal signal  35.06 
 
 		 758 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3695  outer membrane insertion C-terminal signal  35.06 
 
 		 758 aa  327  4.0000000000000003e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.122908 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3383  TonB-dependent receptor, plug  34.61 
 
 		 758 aa  327  4.0000000000000003e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0745  TonB-dependent receptor, plug  34.32 
 
 		 758 aa  327  6e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0159  TonB-dependent receptor  35.76 
 
 		 727 aa  327  7e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.630357  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3573  TonB-dependent receptor plug  34.91 
 
 		 758 aa  325  1e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54180  hypothetical protein  34.94 
 
 		 687 aa  326  1e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4185  TonB-dependent receptor  35.87 
 
 		 724 aa  325  2e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.423461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3871  TonB-dependent receptor  34.98 
 
 		 693 aa  320  6e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.284542 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13940  TonB-dependent receptor  32.01 
 
 		 682 aa  319  9e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.137662  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4331  TonB-dependent receptor  35.2 
 
 		 677 aa  317  3e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.467615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5866  TonB-dependent receptor  34.99 
 
 		 694 aa  317  6e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.754568 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1489  TonB-dependent receptor  33.14 
 
 		 689 aa  316  9e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000345981  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0754  TonB-dependent receptor  32.34 
 
 		 709 aa  315  1.9999999999999998e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3927  TonB-dependent receptor  34.55 
 
 		 742 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.889304  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4439  TonB-dependent receptor  34.55 
 
 		 677 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0287  TonB-dependent receptor  33.57 
 
 		 681 aa  314  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.566628  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1434  TonB-dependent receptor  33.57 
 
 		 681 aa  314  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2644  TonB-dependent receptor  34.28 
 
 		 698 aa  312  1e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.700465  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0939  TonB-dependent receptor  34.28 
 
 		 751 aa  312  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2505  TonB-dependent receptor  34.28 
 
 		 698 aa  312  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.351153  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0251  TonB-dependent receptor  34.28 
 
 		 698 aa  312  2e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.818078  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1631  TonB-dependent receptor  34.28 
 
 		 751 aa  312  2e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.374553  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0527  TonB-dependent receptor  34.32 
 
 		 725 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2510  TonB-dependent receptor  32.93 
 
 		 689 aa  310  5.9999999999999995e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0311712  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1902  TonB-dependent receptor  32.1 
 
 		 751 aa  309  1.0000000000000001e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.357712  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0123  TonB-dependent receptor  34.46 
 
 		 719 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.333478 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4694  TonB-dependent receptor  33.57 
 
 		 685 aa  304  3.0000000000000004e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4488  TonB-dependent receptor  31.32 
 
 		 835 aa  297  5e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1894  TonB-dependent receptor  32.44 
 
 		 709 aa  293  8e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.123894 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3717  TonB-dependent receptor  32.27 
 
 		 702 aa  290  6e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429203  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1683  TonB-dependent receptor  32.14 
 
 		 727 aa  289  1e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3627  TonB-dependent receptor  30.82 
 
 		 744 aa  279  1e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000139063  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0295  TonB-dependent receptor  31.41 
 
 		 797 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.141972  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03676  TonB-dependent receptor  30.16 
 
 		 821 aa  275  2.0000000000000002e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00269599  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2807  TonB-dependent receptor  32.7 
 
 		 713 aa  275  2.0000000000000002e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1214  TonB-dependent receptor  30.68 
 
 		 734 aa  273  7e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.772889  normal  0.0390037 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1842  TonB-dependent receptor  32.71 
 
 		 693 aa  268  2e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2033  TonB-dependent receptor  32.62 
 
 		 695 aa  266  7e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000947033  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2321  TonB-dependent receptor, putative  30.73 
 
 		 709 aa  265  2e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.493897  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0540  TonB-dependent receptor  30.33 
 
 		 699 aa  262  1e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1010  TonB-dependent receptor  29.31 
 
 		 695 aa  261  2e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1776  TonB-dependent receptor  32.56 
 
 		 681 aa  261  3e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.506157  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2932  putative iron complex outermembrane recepter protein  34.48 
 
 		 685 aa  258  2e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1978  outer membrane protein  29.18 
 
 		 801 aa  258  3e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.103542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1847  outer membrane hemin receptor  32.25 
 
 		 681 aa  256  7e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04789  TonB-dependent outer membrane Receptor  33.55 
 
 		 600 aa  256  8e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0342163  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3948  TonB-dependent receptor  30.6 
 
 		 730 aa  256  1.0000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32851 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0708  TonB-dependent receptor, plug  28.23 
 
 		 744 aa  231  4e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0594  TonB-dependent receptor  30.27 
 
 		 708 aa  228  4e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.601286  hitchhiker  0.00250598 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3729  TonB-dependent receptor, putative  25.56 
 
 		 778 aa  204  4e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000373318  normal  0.721597 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0551  TonB-dependent receptor  30.21 
 
 		 733 aa  201  5e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.629102  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0270  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 766 aa  167  5e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1189  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 		 702 aa  156  1e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000388358  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2340  TonB-dependent receptor  34.16 
 
 		 836 aa  144  6e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000058543  normal  0.137103 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0069  iron-regulated outer membrane protein  23.06 
 
 		 868 aa  140  6e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.024885  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0859  TonB-dependent receptor plug  38.42 
 
 		 249 aa  133  1.0000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.152413  normal  0.604475 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0176  TonB-dependent receptor  23.91 
 
 		 763 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 759 aa  126  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1314  TonB-dependent receptor  23.26 
 
 		 735 aa  104  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4568  TonB-dependent receptor  23.66 
 
 		 776 aa  96.7  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1480  TonB-dependent receptor  23.9 
 
 		 776 aa  96.3  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.329669  normal  0.154283 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7106  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 		 818 aa  94.4  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.385774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1266  TonB-dependent receptor  23.76 
 
 		 679 aa  93.2  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0152296  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  24.86 
 
 		 698 aa  91.3  5e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3738  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 665 aa  86.7  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  0.0543439 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3288  TonB-dependent receptor  30.32 
 
 		 730 aa  81.6  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0084  TonB-dependent receptor, plug  32.1 
 
 		 671 aa  80.1  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  32.06 
 
 		 686 aa  80.1  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  35.54 
 
 		 680 aa  80.5  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  34.78 
 
 		 681 aa  78.2  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2339  TonB-dependent receptor  23.13 
 
 		 797 aa  77.8  0.0000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.608898  normal  0.596694 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3807  TonB-dependent receptor plug  31.94 
 
 		 655 aa  77.4  0.0000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  33.73 
 
 		 640 aa  75.1  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>