More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2102 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2054  TonB-dependent receptor plug  93.05 
 
 		 714 aa  1313    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5735  TonB-dependent receptor plug  63.53 
 
 		 676 aa  863    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0861  TonB-dependent receptor plug  63.68 
 
 		 714 aa  886    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113091 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4426  TonB-dependent receptor plug  64.49 
 
 		 707 aa  866    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.831114  normal  0.397066 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1180  TonB-dependent receptor  65.38 
 
 		 705 aa  904    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00173216  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3951  TonB-dependent receptor plug  61.89 
 
 		 731 aa  845    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.478156  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2378  TonB-dependent receptor  98.89 
 
 		 719 aa  1422    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4319  TonB-dependent receptor plug  61.89 
 
 		 723 aa  845    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.133256  normal  0.357062 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2102  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 719 aa  1432    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121164 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2266  putative outer membrane hemin/siderophore receptor protein  46.99 
 
 		 774 aa  613  9.999999999999999e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1405  TonB-dependent receptor  45.64 
 
 		 783 aa  608  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.148044  normal  0.749639 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3051  TonB-dependent receptor  46.14 
 
 		 702 aa  600  1e-170  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.385439 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2631  TonB-dependent receptor  45.79 
 
 		 799 aa  590  1e-167  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0452445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3257  TonB-dependent receptor, plug  46.67 
 
 		 782 aa  585  1.0000000000000001e-165  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.393029  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4869  TonB-dependent receptor  45.49 
 
 		 784 aa  579  1e-164  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.188313  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4192  TonB-dependent receptor  45.24 
 
 		 784 aa  570  1e-161  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0530533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4046  TonB-dependent receptor  45.35 
 
 		 789 aa  555  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.236751 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1865  TonB-dependent receptor  43.29 
 
 		 705 aa  468  9.999999999999999e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1083  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 681 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.654229  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1446  TonB-dependent receptor  33.38 
 
 		 680 aa  300  5e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.757282 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4359  TonB-dependent receptor  33.43 
 
 		 682 aa  300  8e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503749 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4275  TonB-dependent receptor  32.99 
 
 		 685 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0159  TonB-dependent receptor  33.04 
 
 		 727 aa  297  5e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.630357  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4738  hypothetical protein  32.89 
 
 		 687 aa  295  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122905  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54180  hypothetical protein  32.75 
 
 		 687 aa  295  3e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0134  TonB-dependent receptor  32.31 
 
 		 694 aa  293  8e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0123  TonB-dependent receptor  33.29 
 
 		 719 aa  286  8e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.333478 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4331  TonB-dependent receptor  34.63 
 
 		 677 aa  279  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.467615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3871  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 693 aa  274  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.284542 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3717  TonB-dependent receptor  32.55 
 
 		 702 aa  273  9e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429203  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1524  TonB-dependent receptor  33.24 
 
 		 692 aa  273  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.41177 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1683  TonB-dependent receptor  31.2 
 
 		 727 aa  270  5e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5866  TonB-dependent receptor  33.53 
 
 		 694 aa  270  7e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.754568 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4185  TonB-dependent receptor  32.53 
 
 		 724 aa  269  1e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.423461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2033  TonB-dependent receptor  31.16 
 
 		 695 aa  268  2.9999999999999995e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000947033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1842  TonB-dependent receptor  31.36 
 
 		 693 aa  267  5e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4439  TonB-dependent receptor  33.53 
 
 		 677 aa  267  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3927  TonB-dependent receptor  33.53 
 
 		 742 aa  266  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.889304  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2932  putative iron complex outermembrane recepter protein  32.74 
 
 		 685 aa  266  1e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2604  TonB-dependent receptor  28.8 
 
 		 706 aa  260  6e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000145461  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1489  TonB-dependent receptor  29.99 
 
 		 689 aa  256  1.0000000000000001e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000345981  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0754  TonB-dependent receptor  30.36 
 
 		 709 aa  256  1.0000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0287  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 681 aa  254  3e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.566628  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1434  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 681 aa  254  3e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2505  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 698 aa  254  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.351153  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0251  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 698 aa  254  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.818078  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0939  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 751 aa  254  5.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1631  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 751 aa  254  6e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.374553  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2644  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 698 aa  254  6e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.700465  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3948  TonB-dependent receptor  29.47 
 
 		 730 aa  251  3e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32851 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0527  TonB-dependent receptor  33.24 
 
 		 725 aa  251  3e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1902  TonB-dependent receptor  30.25 
 
 		 751 aa  250  6e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.357712  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13940  TonB-dependent receptor  30.64 
 
 		 682 aa  249  1e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.137662  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2807  TonB-dependent receptor  33 
 
 		 713 aa  249  1e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1894  TonB-dependent receptor  30.93 
 
 		 709 aa  247  4.9999999999999997e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.123894 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1776  TonB-dependent receptor  31.44 
 
 		 681 aa  247  6.999999999999999e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.506157  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1847  outer membrane hemin receptor  31.44 
 
 		 681 aa  245  1.9999999999999999e-63  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2510  TonB-dependent receptor  32.06 
 
 		 689 aa  242  1e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0311712  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3695  outer membrane insertion C-terminal signal  30.15 
 
 		 758 aa  243  1e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.122908 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0745  TonB-dependent receptor, plug  30.45 
 
 		 758 aa  243  1e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3573  TonB-dependent receptor plug  29.38 
 
 		 758 aa  242  2e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3505  outer membrane insertion C-terminal signal  30.3 
 
 		 758 aa  240  5e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0540  TonB-dependent receptor  30.76 
 
 		 699 aa  240  5.999999999999999e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04789  TonB-dependent outer membrane Receptor  32.82 
 
 		 600 aa  240  8e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0342163  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1010  TonB-dependent receptor  29.66 
 
 		 695 aa  239  2e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3627  TonB-dependent receptor  28.69 
 
 		 744 aa  234  5e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000139063  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3383  TonB-dependent receptor, plug  29.1 
 
 		 758 aa  230  8e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4694  TonB-dependent receptor  30.47 
 
 		 685 aa  226  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1214  TonB-dependent receptor  28.02 
 
 		 734 aa  222  1.9999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.772889  normal  0.0390037 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1978  outer membrane protein  26.68 
 
 		 801 aa  220  7.999999999999999e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.103542  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4488  TonB-dependent receptor  29.09 
 
 		 835 aa  216  9.999999999999999e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03676  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 821 aa  210  7e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00269599  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0551  TonB-dependent receptor  30.19 
 
 		 733 aa  202  9.999999999999999e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.629102  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2321  TonB-dependent receptor, putative  28.57 
 
 		 709 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.493897  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0594  TonB-dependent receptor  28.85 
 
 		 708 aa  201  5e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.601286  hitchhiker  0.00250598 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1189  TonB-dependent receptor  30.63 
 
 		 702 aa  197  4.0000000000000005e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000388358  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0708  TonB-dependent receptor, plug  26.87 
 
 		 744 aa  196  2e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0295  TonB-dependent receptor  27.58 
 
 		 797 aa  192  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.141972  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  26.63 
 
 		 759 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0859  TonB-dependent receptor plug  42.33 
 
 		 249 aa  121  6e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.152413  normal  0.604475 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4568  TonB-dependent receptor  26.28 
 
 		 776 aa  120  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0069  iron-regulated outer membrane protein  31.82 
 
 		 868 aa  119  9.999999999999999e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.024885  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1480  TonB-dependent receptor  27.65 
 
 		 776 aa  115  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.329669  normal  0.154283 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3729  TonB-dependent receptor, putative  29.39 
 
 		 778 aa  105  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000373318  normal  0.721597 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2340  TonB-dependent receptor  31.94 
 
 		 836 aa  102  3e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000058543  normal  0.137103 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1314  TonB-dependent receptor  22.37 
 
 		 735 aa  98.2  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0270  TonB-dependent receptor  38.27 
 
 		 766 aa  97.8  6e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7106  TonB-dependent receptor  24.85 
 
 		 818 aa  92.4  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.385774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2339  TonB-dependent receptor  24.61 
 
 		 797 aa  93.2  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.608898  normal  0.596694 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2015  TonB-dependent receptor  24.95 
 
 		 732 aa  87  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3709  outer membrane receptor protein  40.5 
 
 		 776 aa  80.1  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0256653 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1938  TonB-dependent receptor  40.71 
 
 		 801 aa  78.6  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.17436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0176  TonB-dependent receptor  34.42 
 
 		 763 aa  78.6  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3288  TonB-dependent receptor  22.05 
 
 		 730 aa  76.3  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0204  TonB-dependent receptor  31.19 
 
 		 678 aa  73.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4561  TonB-dependent receptor  24.75 
 
 		 824 aa  72  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0251417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1572  TonB-dependent receptor  34.26 
 
 		 780 aa  70.1  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0693034  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1105  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor:TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  33.04 
 
 		 859 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0677  TonB-dependent receptor  23.06 
 
 		 672 aa  68.9  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0620216  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1366  tonB-linked outer membrane receptor  29.86 
 
 		 811 aa  66.6  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.351505  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>