More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0204 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_0204  TonB-dependent receptor  100 
 
 
678 aa  1407    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4568  TonB-dependent receptor  39.33 
 
 
776 aa  487  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1572  TonB-dependent receptor  38.41 
 
 
780 aa  471  1.0000000000000001e-131  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0693034  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1938  TonB-dependent receptor  37.19 
 
 
801 aa  417  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.17436  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3709  outer membrane receptor protein  37 
 
 
776 aa  402  1e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0256653 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08651  hypothetical protein  34.33 
 
 
799 aa  370  1e-101  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.950762  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  29.6 
 
 
759 aa  252  1e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0176  TonB-dependent receptor  30.39 
 
 
763 aa  246  9.999999999999999e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7106  TonB-dependent receptor  29.37 
 
 
818 aa  212  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.385774  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4561  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 
824 aa  206  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0251417  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1366  tonB-linked outer membrane receptor  27.76 
 
 
811 aa  200  6e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.351505  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1314  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 
735 aa  200  7.999999999999999e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3288  TonB-dependent receptor  24.73 
 
 
730 aa  192  2e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2015  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 
732 aa  174  5.999999999999999e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1847  outer membrane hemin receptor  22.27 
 
 
681 aa  110  7.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04789  TonB-dependent outer membrane Receptor  22.79 
 
 
600 aa  105  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0342163  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1776  TonB-dependent receptor  21.32 
 
 
681 aa  105  4e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.506157  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1524  TonB-dependent receptor  22.49 
 
 
692 aa  103  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.41177 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0754  TonB-dependent receptor  22.41 
 
 
709 aa  100  9e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3383  TonB-dependent receptor, plug  23.68 
 
 
758 aa  99  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4331  TonB-dependent receptor  21.73 
 
 
677 aa  97.8  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.467615  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  23.46 
 
 
698 aa  96.3  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3871  TonB-dependent receptor  21.77 
 
 
693 aa  96.3  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.284542 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0861  TonB-dependent receptor plug  23.81 
 
 
714 aa  94.7  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113091 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4439  TonB-dependent receptor  21.89 
 
 
677 aa  94.7  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3927  TonB-dependent receptor  21.89 
 
 
742 aa  94.4  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.889304  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5866  TonB-dependent receptor  22.19 
 
 
694 aa  94  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.754568 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0745  TonB-dependent receptor, plug  24.25 
 
 
758 aa  94  8e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4185  TonB-dependent receptor  21.73 
 
 
724 aa  93.2  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.423461  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3505  outer membrane insertion C-terminal signal  23.8 
 
 
758 aa  92.4  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3695  outer membrane insertion C-terminal signal  24.1 
 
 
758 aa  92.4  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.122908 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0708  TonB-dependent receptor, plug  21.54 
 
 
744 aa  91.7  4e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1083  TonB-dependent receptor  23.1 
 
 
681 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.654229  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3573  TonB-dependent receptor plug  23.68 
 
 
758 aa  90.5  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5735  TonB-dependent receptor plug  24.73 
 
 
676 aa  89  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0540  TonB-dependent receptor  23.64 
 
 
699 aa  88.6  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4359  TonB-dependent receptor  23.1 
 
 
682 aa  88.2  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.503749 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1180  TonB-dependent receptor  23.8 
 
 
705 aa  85.9  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00173216  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0551  TonB-dependent receptor  21.48 
 
 
733 aa  84.3  0.000000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.629102  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2604  TonB-dependent receptor  22.79 
 
 
706 aa  84  0.000000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000145461  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4426  TonB-dependent receptor plug  23.54 
 
 
707 aa  83.2  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.831114  normal  0.397066 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2510  TonB-dependent receptor  23.51 
 
 
689 aa  83.6  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0311712  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2033  TonB-dependent receptor  28.85 
 
 
695 aa  83.2  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000947033  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1189  TonB-dependent receptor  22.36 
 
 
702 aa  82.4  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000388358  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3951  TonB-dependent receptor plug  23.86 
 
 
731 aa  80.5  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.478156  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3948  TonB-dependent receptor  24.5 
 
 
730 aa  80.5  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.32851 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4319  TonB-dependent receptor plug  23.86 
 
 
723 aa  80.5  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.133256  normal  0.357062 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1894  TonB-dependent receptor  20.1 
 
 
709 aa  80.1  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.123894 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3051  TonB-dependent receptor  22.01 
 
 
702 aa  79.3  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.385439 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3327  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.82 
 
 
688 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0926253  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0134  TonB-dependent receptor  20.67 
 
 
694 aa  79.3  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1842  TonB-dependent receptor  28.46 
 
 
693 aa  79.3  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13940  TonB-dependent receptor  23.97 
 
 
682 aa  77.8  0.0000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.137662  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4694  TonB-dependent receptor  22.56 
 
 
685 aa  76.6  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1489  TonB-dependent receptor  22.1 
 
 
689 aa  75.9  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000345981  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0859  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  23.36 
 
 
676 aa  73.6  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32697  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4004  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  21.85 
 
 
681 aa  73.9  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.371484 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2102  TonB-dependent receptor plug  31.19 
 
 
719 aa  73.6  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00121164 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2378  TonB-dependent receptor  31.19 
 
 
719 aa  73.6  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2054  TonB-dependent receptor plug  31.73 
 
 
714 aa  72.8  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1214  TonB-dependent receptor  23.53 
 
 
734 aa  71.6  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.772889  normal  0.0390037 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1054  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.51 
 
 
696 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000147815  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2932  putative iron complex outermembrane recepter protein  29.83 
 
 
685 aa  69.7  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0159  TonB-dependent receptor  24.22 
 
 
727 aa  68.9  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.630357  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3627  TonB-dependent receptor  30.97 
 
 
744 aa  68.2  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000139063  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0966  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.2 
 
 
696 aa  68.2  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.942987  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1902  TonB-dependent receptor  19.97 
 
 
751 aa  67.8  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.357712  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2340  TonB-dependent receptor  30.15 
 
 
836 aa  67.4  0.0000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000058543  normal  0.137103 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2631  TonB-dependent receptor  33.07 
 
 
799 aa  66.6  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0452445  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2751  TonB-dependent receptor plug  33.51 
 
 
722 aa  66.6  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.930878  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0619  TonB-dependent receptor  21.35 
 
 
673 aa  66.6  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.000000000412727  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0790  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  22.88 
 
 
690 aa  66.2  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000110471  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1518  TonB-dependent receptor plug  32.98 
 
 
727 aa  65.5  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1405  TonB-dependent receptor  30.49 
 
 
783 aa  65.1  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.148044  normal  0.749639 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3338  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.56 
 
 
696 aa  64.7  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000719833  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3729  TonB-dependent receptor, putative  28.22 
 
 
778 aa  64.3  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000373318  normal  0.721597 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0952  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.48 
 
 
696 aa  64.3  0.000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000391517  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2591  hemin receptor precursor, TonB-dependent outer membrane uptake protein  21.89 
 
 
687 aa  63.5  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.125278 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1446  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 
680 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.757282 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2321  TonB-dependent receptor, putative  26.29 
 
 
709 aa  62.4  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.493897  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0571  TonB-dependent receptor plug  20.14 
 
 
628 aa  62  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.487741  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3235  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  21.88 
 
 
695 aa  62  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000386167  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3717  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 
702 aa  62  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429203  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0969  outer membrane receptor for transport of vitamin B  23.57 
 
 
645 aa  61.2  0.00000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.01117 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0638  TonB-dependent copper receptor  21.85 
 
 
753 aa  61.2  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2266  putative outer membrane hemin/siderophore receptor protein  33.04 
 
 
774 aa  60.8  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4869  TonB-dependent receptor  34.62 
 
 
784 aa  60.1  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.188313  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  29.57 
 
 
628 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0527  TonB-dependent receptor  32.04 
 
 
725 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2339  TonB-dependent receptor  22.62 
 
 
797 aa  59.3  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.608898  normal  0.596694 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0525  B12 family TonB-dependent receptor  28.1 
 
 
641 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0939  TonB-dependent receptor  31.07 
 
 
751 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4192  TonB-dependent receptor  32.48 
 
 
784 aa  59.7  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0530533  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1683  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 
727 aa  59.3  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1631  TonB-dependent receptor  31.07 
 
 
751 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.374553  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4275  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 
685 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1162  tonB-dependent vitamin B12 receptor  32.38 
 
 
622 aa  58.9  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2845  putative TonB-dependent receptor  31.55 
 
 
715 aa  58.9  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.328029 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4046  TonB-dependent receptor  33.65 
 
 
789 aa  58.9  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.236751 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2505  TonB-dependent receptor  31.07 
 
 
698 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.351153  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>