More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1683 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1683  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 727 aa  1471    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3717  TonB-dependent receptor  59.03 
 
 		 702 aa  815    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429203  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2807  TonB-dependent receptor  62.11 
 
 		 713 aa  825    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2932  putative iron complex outermembrane recepter protein  49.05 
 
 		 685 aa  595  1e-169  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0159  TonB-dependent receptor  46.08 
 
 		 727 aa  586  1e-166  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.630357  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0123  TonB-dependent receptor  46.87 
 
 		 719 aa  568  1e-160  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.333478 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54180  hypothetical protein  44.19 
 
 		 687 aa  526  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4738  hypothetical protein  44.05 
 
 		 687 aa  523  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122905  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0134  TonB-dependent receptor  42.96 
 
 		 694 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4185  TonB-dependent receptor  43.6 
 
 		 724 aa  514  1e-144  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.423461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1524  TonB-dependent receptor  43.04 
 
 		 692 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.41177 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4359  TonB-dependent receptor  43.13 
 
 		 682 aa  504  1e-141  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503749 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1446  TonB-dependent receptor  42.52 
 
 		 680 aa  501  1e-140  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.757282 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4275  TonB-dependent receptor  43.3 
 
 		 685 aa  501  1e-140  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1083  TonB-dependent receptor  43.43 
 
 		 681 aa  501  1e-140  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.654229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3871  TonB-dependent receptor  43.17 
 
 		 693 aa  502  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.284542 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4331  TonB-dependent receptor  43.83 
 
 		 677 aa  500  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.467615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5866  TonB-dependent receptor  43.73 
 
 		 694 aa  502  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.754568 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3927  TonB-dependent receptor  43.28 
 
 		 742 aa  498  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.889304  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4439  TonB-dependent receptor  43.28 
 
 		 677 aa  498  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1434  TonB-dependent receptor  42.82 
 
 		 681 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2644  TonB-dependent receptor  43.15 
 
 		 698 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.700465  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0287  TonB-dependent receptor  42.82 
 
 		 681 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.566628  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0251  TonB-dependent receptor  43.07 
 
 		 698 aa  491  1e-137  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.818078  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0939  TonB-dependent receptor  42.92 
 
 		 751 aa  490  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1631  TonB-dependent receptor  43.07 
 
 		 751 aa  491  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.374553  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2505  TonB-dependent receptor  42.92 
 
 		 698 aa  489  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.351153  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0527  TonB-dependent receptor  42.56 
 
 		 725 aa  484  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1189  TonB-dependent receptor  37.16 
 
 		 702 aa  369  1e-101  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000388358  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2604  TonB-dependent receptor  32.37 
 
 		 706 aa  319  1e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000145461  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3948  TonB-dependent receptor  31.96 
 
 		 730 aa  316  9.999999999999999e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32851 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1214  TonB-dependent receptor  31.92 
 
 		 734 aa  312  2e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.772889  normal  0.0390037 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2033  TonB-dependent receptor  33.65 
 
 		 695 aa  305  3.0000000000000004e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000947033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1842  TonB-dependent receptor  33.74 
 
 		 693 aa  304  4.0000000000000003e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1489  TonB-dependent receptor  32.95 
 
 		 689 aa  302  1e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000345981  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1776  TonB-dependent receptor  31.77 
 
 		 681 aa  303  1e-80  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.506157  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1847  outer membrane hemin receptor  31.63 
 
 		 681 aa  298  3e-79  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2510  TonB-dependent receptor  32.94 
 
 		 689 aa  296  8e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0311712  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04789  TonB-dependent outer membrane Receptor  32.06 
 
 		 600 aa  296  1e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0342163  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1865  TonB-dependent receptor  31.88 
 
 		 705 aa  287  4e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0754  TonB-dependent receptor  32.47 
 
 		 709 aa  280  5e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2054  TonB-dependent receptor plug  32.06 
 
 		 714 aa  280  8e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3627  TonB-dependent receptor  29.95 
 
 		 744 aa  279  1e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000139063  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03676  TonB-dependent receptor  29.44 
 
 		 821 aa  276  7e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00269599  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3383  TonB-dependent receptor, plug  30.77 
 
 		 758 aa  275  3e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0861  TonB-dependent receptor plug  30.73 
 
 		 714 aa  273  1e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113091 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13940  TonB-dependent receptor  28.49 
 
 		 682 aa  271  4e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.137662  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2102  TonB-dependent receptor plug  30.94 
 
 		 719 aa  270  5e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121164 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2378  TonB-dependent receptor  31.35 
 
 		 719 aa  270  7e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1180  TonB-dependent receptor  30.06 
 
 		 705 aa  270  1e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00173216  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0745  TonB-dependent receptor, plug  29.84 
 
 		 758 aa  266  1e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3505  outer membrane insertion C-terminal signal  30.1 
 
 		 758 aa  266  1e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3573  TonB-dependent receptor plug  29.7 
 
 		 758 aa  265  2e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0540  TonB-dependent receptor  32.85 
 
 		 699 aa  264  3e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3695  outer membrane insertion C-terminal signal  29.48 
 
 		 758 aa  263  1e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.122908 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3051  TonB-dependent receptor  29.59 
 
 		 702 aa  261  3e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.385439 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4426  TonB-dependent receptor plug  30.72 
 
 		 707 aa  260  6e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.831114  normal  0.397066 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4488  TonB-dependent receptor  28.24 
 
 		 835 aa  258  2e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4869  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 784 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.188313  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4694  TonB-dependent receptor  31.13 
 
 		 685 aa  259  2e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1978  outer membrane protein  27.59 
 
 		 801 aa  258  3e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.103542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5735  TonB-dependent receptor plug  30.04 
 
 		 676 aa  254  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4046  TonB-dependent receptor  31.18 
 
 		 789 aa  253  7e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.236751 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1894  TonB-dependent receptor  29.54 
 
 		 709 aa  250  6e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.123894 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2321  TonB-dependent receptor, putative  28.86 
 
 		 709 aa  249  1e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.493897  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4319  TonB-dependent receptor plug  29.31 
 
 		 723 aa  246  9e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.133256  normal  0.357062 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3951  TonB-dependent receptor plug  29.31 
 
 		 731 aa  246  9.999999999999999e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.478156  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1405  TonB-dependent receptor  30.18 
 
 		 783 aa  244  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.148044  normal  0.749639 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1902  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 		 751 aa  242  2e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.357712  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4192  TonB-dependent receptor  29.7 
 
 		 784 aa  238  3e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0530533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2266  putative outer membrane hemin/siderophore receptor protein  29.11 
 
 		 774 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0708  TonB-dependent receptor, plug  27.31 
 
 		 744 aa  232  2e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3257  TonB-dependent receptor, plug  29.49 
 
 		 782 aa  231  4e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.393029  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1010  TonB-dependent receptor  29.12 
 
 		 695 aa  226  2e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0295  TonB-dependent receptor  27.83 
 
 		 797 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.141972  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3729  TonB-dependent receptor, putative  25.12 
 
 		 778 aa  199  1.0000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000373318  normal  0.721597 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2631  TonB-dependent receptor  27.26 
 
 		 799 aa  195  3e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0452445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0551  TonB-dependent receptor  26.41 
 
 		 733 aa  188  3e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.629102  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0176  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 763 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 759 aa  139  3.0000000000000003e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0594  TonB-dependent receptor  29.79 
 
 		 708 aa  137  9.999999999999999e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.601286  hitchhiker  0.00250598 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2340  TonB-dependent receptor  23.35 
 
 		 836 aa  120  6e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000058543  normal  0.137103 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0069  iron-regulated outer membrane protein  36.45 
 
 		 868 aa  117  6e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.024885  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1480  TonB-dependent receptor  25.25 
 
 		 776 aa  116  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.329669  normal  0.154283 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0270  TonB-dependent receptor  31.93 
 
 		 766 aa  112  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1314  TonB-dependent receptor  23.31 
 
 		 735 aa  110  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2015  TonB-dependent receptor  26.73 
 
 		 732 aa  100  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0859  TonB-dependent receptor plug  39.86 
 
 		 249 aa  98.2  5e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.152413  normal  0.604475 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2339  TonB-dependent receptor  23.51 
 
 		 797 aa  95.5  3e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.608898  normal  0.596694 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1938  TonB-dependent receptor  23.58 
 
 		 801 aa  89  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.17436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3288  TonB-dependent receptor  29.8 
 
 		 730 aa  86.7  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4561  TonB-dependent receptor  22.37 
 
 		 824 aa  72.8  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0251417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  34.43 
 
 		 698 aa  71.2  0.00000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3709  outer membrane receptor protein  32.31 
 
 		 776 aa  69.7  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0256653 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3675  TonB-dependent receptor  30.98 
 
 		 737 aa  67.8  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0831004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  36.24 
 
 		 656 aa  67.4  0.0000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  33.53 
 
 		 656 aa  67  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4568  TonB-dependent receptor  29.21 
 
 		 776 aa  66.6  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1806  TonB-dependent receptor  33.94 
 
 		 649 aa  65.1  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  36.73 
 
 		 650 aa  64.7  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>