More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2321 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2321  TonB-dependent receptor, putative  100 
 
 		 709 aa  1447    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.493897  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2510  TonB-dependent receptor  37.5 
 
 		 689 aa  404  1e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0311712  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1489  TonB-dependent receptor  36.03 
 
 		 689 aa  385  1e-105  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000345981  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0708  TonB-dependent receptor, plug  35.11 
 
 		 744 aa  373  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13940  TonB-dependent receptor  32.96 
 
 		 682 aa  358  1.9999999999999998e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.137662  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3729  TonB-dependent receptor, putative  31.41 
 
 		 778 aa  348  2e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000373318  normal  0.721597 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1214  TonB-dependent receptor  31.78 
 
 		 734 aa  344  2.9999999999999997e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.772889  normal  0.0390037 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0134  TonB-dependent receptor  32.73 
 
 		 694 aa  334  3e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1847  outer membrane hemin receptor  33.58 
 
 		 681 aa  330  6e-89  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1776  TonB-dependent receptor  33.38 
 
 		 681 aa  327  4.0000000000000003e-88  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.506157  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1083  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 681 aa  327  7e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.654229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3695  outer membrane insertion C-terminal signal  31.74 
 
 		 758 aa  320  7.999999999999999e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.122908 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3573  TonB-dependent receptor plug  31.59 
 
 		 758 aa  318  2e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1842  TonB-dependent receptor  32.04 
 
 		 693 aa  318  2e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3383  TonB-dependent receptor, plug  31.59 
 
 		 758 aa  318  2e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4185  TonB-dependent receptor  31.69 
 
 		 724 aa  317  4e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.423461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3505  outer membrane insertion C-terminal signal  31.45 
 
 		 758 aa  317  4e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0745  TonB-dependent receptor, plug  31.59 
 
 		 758 aa  317  5e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4359  TonB-dependent receptor  32.4 
 
 		 682 aa  316  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503749 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4275  TonB-dependent receptor  32.11 
 
 		 685 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03676  TonB-dependent receptor  30.29 
 
 		 821 aa  315  1.9999999999999998e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00269599  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1446  TonB-dependent receptor  32.5 
 
 		 680 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.757282 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3871  TonB-dependent receptor  31.5 
 
 		 693 aa  312  1e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.284542 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2033  TonB-dependent receptor  31.66 
 
 		 695 aa  311  2e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000947033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1524  TonB-dependent receptor  31.06 
 
 		 692 aa  310  5e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.41177 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2604  TonB-dependent receptor  30.4 
 
 		 706 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000145461  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4738  hypothetical protein  32.16 
 
 		 687 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122905  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0159  TonB-dependent receptor  32.22 
 
 		 727 aa  305  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.630357  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54180  hypothetical protein  32.01 
 
 		 687 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4331  TonB-dependent receptor  31.21 
 
 		 677 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.467615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3627  TonB-dependent receptor  29.01 
 
 		 744 aa  301  2e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000139063  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04789  TonB-dependent outer membrane Receptor  33.39 
 
 		 600 aa  300  5e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0342163  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5866  TonB-dependent receptor  31 
 
 		 694 aa  300  8e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.754568 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3948  TonB-dependent receptor  30.33 
 
 		 730 aa  297  4e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32851 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0123  TonB-dependent receptor  30.92 
 
 		 719 aa  297  4e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.333478 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3927  TonB-dependent receptor  30.64 
 
 		 742 aa  296  6e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.889304  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0540  TonB-dependent receptor  30.28 
 
 		 699 aa  296  7e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4439  TonB-dependent receptor  30.64 
 
 		 677 aa  296  1e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1978  outer membrane protein  29.95 
 
 		 801 aa  293  7e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.103542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1010  TonB-dependent receptor  31 
 
 		 695 aa  288  2.9999999999999996e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0754  TonB-dependent receptor  29.14 
 
 		 709 aa  287  4e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1894  TonB-dependent receptor  29.06 
 
 		 709 aa  287  4e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.123894 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4488  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 835 aa  284  3.0000000000000004e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1865  TonB-dependent receptor  30.83 
 
 		 705 aa  275  2.0000000000000002e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0939  TonB-dependent receptor  29.52 
 
 		 751 aa  272  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1631  TonB-dependent receptor  29.52 
 
 		 751 aa  272  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.374553  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0287  TonB-dependent receptor  29.07 
 
 		 681 aa  273  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.566628  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1434  TonB-dependent receptor  29.07 
 
 		 681 aa  273  1e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0251  TonB-dependent receptor  29.52 
 
 		 698 aa  272  2e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.818078  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2644  TonB-dependent receptor  29.52 
 
 		 698 aa  272  2e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.700465  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2505  TonB-dependent receptor  29.52 
 
 		 698 aa  271  4e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.351153  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0527  TonB-dependent receptor  29.59 
 
 		 725 aa  266  1e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1902  TonB-dependent receptor  28.14 
 
 		 751 aa  264  3e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.357712  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3717  TonB-dependent receptor  29.94 
 
 		 702 aa  257  6e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429203  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1683  TonB-dependent receptor  28.86 
 
 		 727 aa  257  7e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0295  TonB-dependent receptor  27.55 
 
 		 797 aa  254  5.000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.141972  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2932  putative iron complex outermembrane recepter protein  29.81 
 
 		 685 aa  253  7e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3051  TonB-dependent receptor  29.3 
 
 		 702 aa  239  1e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.385439 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4694  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 685 aa  239  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1189  TonB-dependent receptor  29.49 
 
 		 702 aa  233  1e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000388358  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0861  TonB-dependent receptor plug  29.61 
 
 		 714 aa  232  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113091 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0551  TonB-dependent receptor  28.44 
 
 		 733 aa  228  4e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.629102  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4869  TonB-dependent receptor  29.26 
 
 		 784 aa  225  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.188313  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5735  TonB-dependent receptor plug  28.36 
 
 		 676 aa  223  9e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2807  TonB-dependent receptor  28.11 
 
 		 713 aa  220  7e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1405  TonB-dependent receptor  28.75 
 
 		 783 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.148044  normal  0.749639 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2266  putative outer membrane hemin/siderophore receptor protein  29.37 
 
 		 774 aa  217  5.9999999999999996e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2054  TonB-dependent receptor plug  28.46 
 
 		 714 aa  216  9e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3257  TonB-dependent receptor, plug  29.4 
 
 		 782 aa  214  3.9999999999999995e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.393029  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0594  TonB-dependent receptor  29.77 
 
 		 708 aa  213  1e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.601286  hitchhiker  0.00250598 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1180  TonB-dependent receptor  28.34 
 
 		 705 aa  210  6e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00173216  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4192  TonB-dependent receptor  28.13 
 
 		 784 aa  210  7e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0530533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4046  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 789 aa  210  7e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.236751 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2378  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 719 aa  208  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2102  TonB-dependent receptor plug  28.74 
 
 		 719 aa  207  4e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121164 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4426  TonB-dependent receptor plug  27.98 
 
 		 707 aa  206  1e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.831114  normal  0.397066 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2631  TonB-dependent receptor  27.41 
 
 		 799 aa  200  6e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0452445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4319  TonB-dependent receptor plug  26.48 
 
 		 723 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.133256  normal  0.357062 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3951  TonB-dependent receptor plug  26.48 
 
 		 731 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.478156  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0270  TonB-dependent receptor  23.93 
 
 		 766 aa  163  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2340  TonB-dependent receptor  36.43 
 
 		 836 aa  138  4e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000058543  normal  0.137103 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3709  outer membrane receptor protein  24.72 
 
 		 776 aa  132  3e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0256653 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 759 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4568  TonB-dependent receptor  25.14 
 
 		 776 aa  127  6e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1314  TonB-dependent receptor  24.78 
 
 		 735 aa  125  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0069  iron-regulated outer membrane protein  32 
 
 		 868 aa  123  9.999999999999999e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.024885  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0859  TonB-dependent receptor plug  38.24 
 
 		 249 aa  118  3.9999999999999997e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.152413  normal  0.604475 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1480  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 776 aa  113  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.329669  normal  0.154283 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2015  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 732 aa  105  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2339  TonB-dependent receptor  21.94 
 
 		 797 aa  92.4  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.608898  normal  0.596694 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3235  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.25 
 
 		 695 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000386167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0176  TonB-dependent receptor  25.66 
 
 		 763 aa  76.6  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3327  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.93 
 
 		 688 aa  75.5  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0926253  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1366  tonB-linked outer membrane receptor  25.55 
 
 		 811 aa  73.9  0.000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.351505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  26.83 
 
 		 698 aa  72.8  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  25.47 
 
 		 646 aa  72.4  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1054  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  31.91 
 
 		 696 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000147815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3288  TonB-dependent receptor  34.68 
 
 		 730 aa  72.4  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7106  TonB-dependent receptor  24.13 
 
 		 818 aa  72.4  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.385774  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3669  heme transport protein  31.35 
 
 		 697 aa  72  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>