More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_1776 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1847  outer membrane hemin receptor  98.38 
 
 
681 aa  1363    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1776  TonB-dependent receptor  100 
 
 
681 aa  1389    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.506157  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04789  TonB-dependent outer membrane Receptor  71.5 
 
 
600 aa  865    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0342163  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1214  TonB-dependent receptor  43.42 
 
 
734 aa  523  1e-147  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.772889  normal  0.0390037 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0134  TonB-dependent receptor  36.52 
 
 
694 aa  389  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4359  TonB-dependent receptor  36.02 
 
 
682 aa  364  3e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.503749 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4738  hypothetical protein  35.9 
 
 
687 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122905  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1489  TonB-dependent receptor  37.78 
 
 
689 aa  362  1e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000345981  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54180  hypothetical protein  35.9 
 
 
687 aa  362  1e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2604  TonB-dependent receptor  33.19 
 
 
706 aa  361  2e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000145461  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3383  TonB-dependent receptor, plug  35.64 
 
 
758 aa  360  6e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13940  TonB-dependent receptor  34.82 
 
 
682 aa  359  8e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.137662  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1083  TonB-dependent receptor  35.93 
 
 
681 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.654229  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0745  TonB-dependent receptor, plug  35.88 
 
 
758 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0159  TonB-dependent receptor  35.07 
 
 
727 aa  358  1.9999999999999998e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.630357  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3573  TonB-dependent receptor plug  35.74 
 
 
758 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1446  TonB-dependent receptor  35.53 
 
 
680 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.757282 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3695  outer membrane insertion C-terminal signal  35.74 
 
 
758 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.122908 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3505  outer membrane insertion C-terminal signal  35.74 
 
 
758 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2510  TonB-dependent receptor  36.47 
 
 
689 aa  353  5.9999999999999994e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0311712  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4275  TonB-dependent receptor  35.12 
 
 
685 aa  353  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0123  TonB-dependent receptor  34.75 
 
 
719 aa  352  2e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.333478 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3627  TonB-dependent receptor  33.88 
 
 
744 aa  348  2e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000139063  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3948  TonB-dependent receptor  35.22 
 
 
730 aa  342  1e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.32851 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1842  TonB-dependent receptor  37.85 
 
 
693 aa  336  7.999999999999999e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2033  TonB-dependent receptor  37.44 
 
 
695 aa  330  7e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000947033  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03676  TonB-dependent receptor  32.78 
 
 
821 aa  329  1.0000000000000001e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00269599  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2932  putative iron complex outermembrane recepter protein  35.14 
 
 
685 aa  321  3e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2321  TonB-dependent receptor, putative  33.38 
 
 
709 aa  316  9.999999999999999e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.493897  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1524  TonB-dependent receptor  32.68 
 
 
692 aa  312  1e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.41177 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3717  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 
702 aa  308  2.0000000000000002e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429203  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0287  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 
681 aa  307  5.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.566628  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1434  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 
681 aa  307  5.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4694  TonB-dependent receptor  35.27 
 
 
685 aa  305  2.0000000000000002e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4185  TonB-dependent receptor  33.08 
 
 
724 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.423461  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5866  TonB-dependent receptor  32.53 
 
 
694 aa  304  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.754568 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1683  TonB-dependent receptor  31.77 
 
 
727 aa  303  9e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4331  TonB-dependent receptor  32.74 
 
 
677 aa  301  2e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.467615  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3927  TonB-dependent receptor  32.38 
 
 
742 aa  301  3e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.889304  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1631  TonB-dependent receptor  33.14 
 
 
751 aa  300  7e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.374553  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4439  TonB-dependent receptor  32.38 
 
 
677 aa  300  7e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0251  TonB-dependent receptor  33.14 
 
 
698 aa  299  1e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.818078  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2644  TonB-dependent receptor  33.14 
 
 
698 aa  299  1e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.700465  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2505  TonB-dependent receptor  33.14 
 
 
698 aa  298  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.351153  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0939  TonB-dependent receptor  33 
 
 
751 aa  298  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3871  TonB-dependent receptor  32.68 
 
 
693 aa  298  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.284542 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3729  TonB-dependent receptor, putative  30.32 
 
 
778 aa  297  6e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000373318  normal  0.721597 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0540  TonB-dependent receptor  31.4 
 
 
699 aa  293  1e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0527  TonB-dependent receptor  33.28 
 
 
725 aa  291  2e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0754  TonB-dependent receptor  32.47 
 
 
709 aa  291  2e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1902  TonB-dependent receptor  31.79 
 
 
751 aa  290  4e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.357712  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4488  TonB-dependent receptor  30.92 
 
 
835 aa  289  1e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2807  TonB-dependent receptor  32.6 
 
 
713 aa  288  2.9999999999999996e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0295  TonB-dependent receptor  31.1 
 
 
797 aa  281  3e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.141972  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1010  TonB-dependent receptor  30.15 
 
 
695 aa  275  2.0000000000000002e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1894  TonB-dependent receptor  30.39 
 
 
709 aa  274  3e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.123894 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0708  TonB-dependent receptor, plug  30.96 
 
 
744 aa  274  4.0000000000000004e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1865  TonB-dependent receptor  32.56 
 
 
705 aa  261  2e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1189  TonB-dependent receptor  30.29 
 
 
702 aa  262  2e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000388358  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0594  TonB-dependent receptor  31.38 
 
 
708 aa  258  2e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.601286  hitchhiker  0.00250598 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4869  TonB-dependent receptor  31.17 
 
 
784 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.188313  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1978  outer membrane protein  27.27 
 
 
801 aa  249  1e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.103542  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2054  TonB-dependent receptor plug  31.97 
 
 
714 aa  248  2e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2378  TonB-dependent receptor  31.75 
 
 
719 aa  247  4e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2102  TonB-dependent receptor plug  31.44 
 
 
719 aa  246  9e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00121164 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0861  TonB-dependent receptor plug  32 
 
 
714 aa  246  9.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113091 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4426  TonB-dependent receptor plug  32.35 
 
 
707 aa  246  9.999999999999999e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.831114  normal  0.397066 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5735  TonB-dependent receptor plug  30.83 
 
 
676 aa  246  9.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4319  TonB-dependent receptor plug  32.02 
 
 
723 aa  244  3e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.133256  normal  0.357062 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3951  TonB-dependent receptor plug  32.02 
 
 
731 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.478156  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1405  TonB-dependent receptor  29.44 
 
 
783 aa  243  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.148044  normal  0.749639 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4192  TonB-dependent receptor  29.83 
 
 
784 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0530533  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4046  TonB-dependent receptor  29.16 
 
 
789 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.236751 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1180  TonB-dependent receptor  31.4 
 
 
705 aa  239  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00173216  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3051  TonB-dependent receptor  31.55 
 
 
702 aa  235  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.385439 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2266  putative outer membrane hemin/siderophore receptor protein  30.32 
 
 
774 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3257  TonB-dependent receptor, plug  29.78 
 
 
782 aa  233  9e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.393029  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0270  TonB-dependent receptor  27.63 
 
 
766 aa  231  4e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0551  TonB-dependent receptor  29.15 
 
 
733 aa  223  9.999999999999999e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.629102  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2631  TonB-dependent receptor  28.81 
 
 
799 aa  212  2e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0452445  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0176  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 
763 aa  162  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1314  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 
735 aa  156  9e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 
759 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1480  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 
776 aa  132  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.329669  normal  0.154283 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1938  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 
801 aa  126  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.17436  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2340  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 
836 aa  121  3e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000058543  normal  0.137103 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0069  iron-regulated outer membrane protein  36.14 
 
 
868 aa  120  9e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.024885  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0859  TonB-dependent receptor plug  35.16 
 
 
249 aa  108  4e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.152413  normal  0.604475 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0204  TonB-dependent receptor  21.32 
 
 
678 aa  105  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3709  outer membrane receptor protein  32.8 
 
 
776 aa  96.7  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0256653 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2339  TonB-dependent receptor  21.01 
 
 
797 aa  93.6  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.608898  normal  0.596694 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000158  TonB-dependent heme and hemoglobin receptor HutA  23.4 
 
 
693 aa  86.3  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00497898  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4568  TonB-dependent receptor  32.84 
 
 
776 aa  85.1  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7106  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 
818 aa  82.4  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.385774  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2015  TonB-dependent receptor  27.91 
 
 
732 aa  74.7  0.000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4669  TonB-dependent copper receptor  23.4 
 
 
713 aa  72  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0923349  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0638  TonB-dependent copper receptor  24.36 
 
 
753 aa  72  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3288  TonB-dependent receptor  29.37 
 
 
730 aa  71.2  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2133  TonB-dependent receptor  23.72 
 
 
760 aa  70.1  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.207681  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0074  heme receptor HutR  38.24 
 
 
713 aa  69.3  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0136209  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>