More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03676 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03676  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 821 aa  1668    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00269599  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4488  TonB-dependent receptor  40.54 
 
 		 835 aa  596  1e-169  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0295  TonB-dependent receptor  43.05 
 
 		 797 aa  572  1e-161  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.141972  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1978  outer membrane protein  37.02 
 
 		 801 aa  550  1e-155  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.103542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3627  TonB-dependent receptor  44.91 
 
 		 744 aa  549  1e-155  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000139063  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2604  TonB-dependent receptor  39.86 
 
 		 706 aa  532  1e-150  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000145461  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0745  TonB-dependent receptor, plug  38.41 
 
 		 758 aa  531  1e-149  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3695  outer membrane insertion C-terminal signal  37.68 
 
 		 758 aa  525  1e-147  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.122908 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3573  TonB-dependent receptor plug  37.68 
 
 		 758 aa  525  1e-147  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3505  outer membrane insertion C-terminal signal  37.56 
 
 		 758 aa  525  1e-147  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1902  TonB-dependent receptor  39.8 
 
 		 751 aa  518  1.0000000000000001e-145  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.357712  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3383  TonB-dependent receptor, plug  36.51 
 
 		 758 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1489  TonB-dependent receptor  35.07 
 
 		 689 aa  418  9.999999999999999e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000345981  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2510  TonB-dependent receptor  33.93 
 
 		 689 aa  396  1e-109  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0311712  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13940  TonB-dependent receptor  34.28 
 
 		 682 aa  389  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.137662  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1214  TonB-dependent receptor  33.25 
 
 		 734 aa  380  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.772889  normal  0.0390037 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3948  TonB-dependent receptor  33.06 
 
 		 730 aa  365  3e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32851 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0123  TonB-dependent receptor  33.38 
 
 		 719 aa  360  5e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.333478 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0159  TonB-dependent receptor  33.42 
 
 		 727 aa  357  3.9999999999999996e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.630357  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4738  hypothetical protein  34.42 
 
 		 687 aa  351  3e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122905  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54180  hypothetical protein  34.42 
 
 		 687 aa  349  1e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1842  TonB-dependent receptor  33.69 
 
 		 693 aa  347  5e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1847  outer membrane hemin receptor  33.33 
 
 		 681 aa  345  2e-93  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1776  TonB-dependent receptor  33.61 
 
 		 681 aa  345  2e-93  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.506157  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0134  TonB-dependent receptor  32.33 
 
 		 694 aa  343  7e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2033  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 695 aa  343  1e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000947033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1083  TonB-dependent receptor  32.97 
 
 		 681 aa  335  3e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.654229  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1446  TonB-dependent receptor  33.38 
 
 		 680 aa  333  9e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.757282 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4275  TonB-dependent receptor  32.93 
 
 		 685 aa  327  6e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4359  TonB-dependent receptor  33.06 
 
 		 682 aa  326  9e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503749 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04789  TonB-dependent outer membrane Receptor  32.52 
 
 		 600 aa  320  9e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0342163  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0540  TonB-dependent receptor  31.49 
 
 		 699 aa  315  1.9999999999999998e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2321  TonB-dependent receptor, putative  30.16 
 
 		 709 aa  313  7.999999999999999e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.493897  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0754  TonB-dependent receptor  32.89 
 
 		 709 aa  313  1e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5866  TonB-dependent receptor  30.56 
 
 		 694 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.754568 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1524  TonB-dependent receptor  30.26 
 
 		 692 aa  310  1.0000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.41177 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1894  TonB-dependent receptor  30.07 
 
 		 709 aa  307  6e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.123894 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3927  TonB-dependent receptor  30.29 
 
 		 742 aa  307  6e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.889304  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4439  TonB-dependent receptor  30.29 
 
 		 677 aa  306  9.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4331  TonB-dependent receptor  30.29 
 
 		 677 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.467615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2807  TonB-dependent receptor  31.33 
 
 		 713 aa  304  3.0000000000000004e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3871  TonB-dependent receptor  29.88 
 
 		 693 aa  303  7.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.284542 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4185  TonB-dependent receptor  29.67 
 
 		 724 aa  300  8e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.423461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0594  TonB-dependent receptor  32.25 
 
 		 708 aa  296  1e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.601286  hitchhiker  0.00250598 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1010  TonB-dependent receptor  29.7 
 
 		 695 aa  293  1e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0527  TonB-dependent receptor  30.66 
 
 		 725 aa  292  2e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0939  TonB-dependent receptor  30.39 
 
 		 751 aa  291  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1631  TonB-dependent receptor  30.39 
 
 		 751 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.374553  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0287  TonB-dependent receptor  30.39 
 
 		 681 aa  290  8e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.566628  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1434  TonB-dependent receptor  30.39 
 
 		 681 aa  290  8e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2644  TonB-dependent receptor  30.39 
 
 		 698 aa  290  9e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.700465  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0251  TonB-dependent receptor  30.39 
 
 		 698 aa  290  1e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.818078  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2505  TonB-dependent receptor  30.12 
 
 		 698 aa  288  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.351153  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3717  TonB-dependent receptor  30.54 
 
 		 702 aa  286  2.0000000000000002e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429203  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4694  TonB-dependent receptor  29.56 
 
 		 685 aa  283  1e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1683  TonB-dependent receptor  29.65 
 
 		 727 aa  282  2e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1865  TonB-dependent receptor  30.88 
 
 		 705 aa  279  1e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2932  putative iron complex outermembrane recepter protein  29.8 
 
 		 685 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3729  TonB-dependent receptor, putative  28.41 
 
 		 778 aa  270  5.9999999999999995e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000373318  normal  0.721597 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1180  TonB-dependent receptor  31.05 
 
 		 705 aa  252  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00173216  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4426  TonB-dependent receptor plug  29.78 
 
 		 707 aa  250  6e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.831114  normal  0.397066 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0551  TonB-dependent receptor  29.42 
 
 		 733 aa  246  9.999999999999999e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.629102  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0708  TonB-dependent receptor, plug  27.83 
 
 		 744 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5735  TonB-dependent receptor plug  29.47 
 
 		 676 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4319  TonB-dependent receptor plug  28.38 
 
 		 723 aa  240  8e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.133256  normal  0.357062 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3951  TonB-dependent receptor plug  28.38 
 
 		 731 aa  240  9e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.478156  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0069  iron-regulated outer membrane protein  23.94 
 
 		 868 aa  231  3e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.024885  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0861  TonB-dependent receptor plug  27.98 
 
 		 714 aa  231  5e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113091 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3051  TonB-dependent receptor  27.64 
 
 		 702 aa  230  1e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.385439 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2054  TonB-dependent receptor plug  28.55 
 
 		 714 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4869  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 		 784 aa  220  7e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.188313  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2266  putative outer membrane hemin/siderophore receptor protein  28.7 
 
 		 774 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3257  TonB-dependent receptor, plug  27.79 
 
 		 782 aa  218  5e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.393029  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0270  TonB-dependent receptor  25.09 
 
 		 766 aa  218  5e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2102  TonB-dependent receptor plug  27.87 
 
 		 719 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121164 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2378  TonB-dependent receptor  28.14 
 
 		 719 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1405  TonB-dependent receptor  27.46 
 
 		 783 aa  212  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.148044  normal  0.749639 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4192  TonB-dependent receptor  27.93 
 
 		 784 aa  206  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0530533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4046  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 789 aa  204  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.236751 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1189  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 702 aa  191  5e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000388358  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2631  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 799 aa  186  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0452445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  25.24 
 
 		 759 aa  176  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0176  TonB-dependent receptor  25.25 
 
 		 763 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2340  TonB-dependent receptor  36.4 
 
 		 836 aa  147  1e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000058543  normal  0.137103 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0859  TonB-dependent receptor plug  40.96 
 
 		 249 aa  137  8e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.152413  normal  0.604475 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7106  TonB-dependent receptor  23.89 
 
 		 818 aa  137  8e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.385774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1480  TonB-dependent receptor  25.14 
 
 		 776 aa  125  4e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.329669  normal  0.154283 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1366  tonB-linked outer membrane receptor  22.86 
 
 		 811 aa  110  7.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.351505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2015  TonB-dependent receptor  24.12 
 
 		 732 aa  90.5  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4568  TonB-dependent receptor  29.91 
 
 		 776 aa  85.9  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1314  TonB-dependent receptor  29.55 
 
 		 735 aa  85.5  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2339  TonB-dependent receptor  21.43 
 
 		 797 aa  84  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.608898  normal  0.596694 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4561  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 824 aa  81.3  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0251417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3709  outer membrane receptor protein  28.04 
 
 		 776 aa  79.7  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0256653 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0464  TonB-dependent receptor plug  27.43 
 
 		 748 aa  77.8  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1186  TonB-dependent receptor  33.7 
 
 		 634 aa  75.5  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.874956  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0928  TonB-dependent receptor, plug  26.87 
 
 		 750 aa  75.1  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.228004  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  27.72 
 
 		 646 aa  73.6  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3052  TonB-dependent receptor plug  30.08 
 
 		 753 aa  73.9  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1518  TonB-dependent receptor plug  23.67 
 
 		 727 aa  73.2  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>