More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_54180 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4359  TonB-dependent receptor  69.66 
 
 		 682 aa  964    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503749 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1083  TonB-dependent receptor  70.4 
 
 		 681 aa  976    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.654229  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1446  TonB-dependent receptor  70.61 
 
 		 680 aa  973    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.757282 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0287  TonB-dependent receptor  56.91 
 
 		 681 aa  733    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.566628  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1631  TonB-dependent receptor  57.95 
 
 		 751 aa  731    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.374553  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4738  hypothetical protein  98.98 
 
 		 687 aa  1380    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122905  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0251  TonB-dependent receptor  57.95 
 
 		 698 aa  730    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.818078  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2505  TonB-dependent receptor  57.8 
 
 		 698 aa  728    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.351153  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0159  TonB-dependent receptor  51.79 
 
 		 727 aa  683    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.630357  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4185  TonB-dependent receptor  59.04 
 
 		 724 aa  764    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.423461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0939  TonB-dependent receptor  57.8 
 
 		 751 aa  729    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2644  TonB-dependent receptor  57.95 
 
 		 698 aa  731    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.700465  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1524  TonB-dependent receptor  56.65 
 
 		 692 aa  765    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.41177 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0527  TonB-dependent receptor  57.76 
 
 		 725 aa  733    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4275  TonB-dependent receptor  69.35 
 
 		 685 aa  967    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4331  TonB-dependent receptor  58.71 
 
 		 677 aa  761    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.467615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0123  TonB-dependent receptor  52.47 
 
 		 719 aa  664    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.333478 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3927  TonB-dependent receptor  58.71 
 
 		 742 aa  765    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.889304  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5866  TonB-dependent receptor  56.92 
 
 		 694 aa  771    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.754568 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3871  TonB-dependent receptor  56.42 
 
 		 693 aa  772    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.284542 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54180  hypothetical protein  100 
 
 		 687 aa  1389    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4439  TonB-dependent receptor  58.71 
 
 		 677 aa  765    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1434  TonB-dependent receptor  56.91 
 
 		 681 aa  733    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0134  TonB-dependent receptor  46.74 
 
 		 694 aa  615  1e-175  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2932  putative iron complex outermembrane recepter protein  48.04 
 
 		 685 aa  551  1e-155  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2807  TonB-dependent receptor  46.3 
 
 		 713 aa  550  1e-155  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1683  TonB-dependent receptor  44.19 
 
 		 727 aa  526  1e-148  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3717  TonB-dependent receptor  45.52 
 
 		 702 aa  516  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429203  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1189  TonB-dependent receptor  38.51 
 
 		 702 aa  400  9.999999999999999e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000388358  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2604  TonB-dependent receptor  34.92 
 
 		 706 aa  389  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000145461  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3627  TonB-dependent receptor  36.3 
 
 		 744 aa  392  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000139063  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3383  TonB-dependent receptor, plug  36.34 
 
 		 758 aa  385  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0745  TonB-dependent receptor, plug  35.84 
 
 		 758 aa  375  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3695  outer membrane insertion C-terminal signal  35.55 
 
 		 758 aa  372  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.122908 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3573  TonB-dependent receptor plug  35.55 
 
 		 758 aa  372  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3505  outer membrane insertion C-terminal signal  35.55 
 
 		 758 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1214  TonB-dependent receptor  35.43 
 
 		 734 aa  370  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.772889  normal  0.0390037 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1776  TonB-dependent receptor  35.9 
 
 		 681 aa  362  1e-98  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.506157  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1847  outer membrane hemin receptor  35.9 
 
 		 681 aa  361  2e-98  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04789  TonB-dependent outer membrane Receptor  36.45 
 
 		 600 aa  354  4e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0342163  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3948  TonB-dependent receptor  35.32 
 
 		 730 aa  343  8e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32851 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4694  TonB-dependent receptor  36.09 
 
 		 685 aa  342  1e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1842  TonB-dependent receptor  35.02 
 
 		 693 aa  338  1.9999999999999998e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2033  TonB-dependent receptor  35.1 
 
 		 695 aa  337  5e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000947033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2510  TonB-dependent receptor  35.6 
 
 		 689 aa  336  9e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0311712  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03676  TonB-dependent receptor  33.74 
 
 		 821 aa  335  1e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00269599  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0754  TonB-dependent receptor  36.19 
 
 		 709 aa  328  3e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1489  TonB-dependent receptor  33.68 
 
 		 689 aa  327  5e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000345981  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1865  TonB-dependent receptor  34.94 
 
 		 705 aa  326  8.000000000000001e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13940  TonB-dependent receptor  34.29 
 
 		 682 aa  326  1e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.137662  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1902  TonB-dependent receptor  33.1 
 
 		 751 aa  320  5e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.357712  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0540  TonB-dependent receptor  34.84 
 
 		 699 aa  317  6e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4488  TonB-dependent receptor  32.07 
 
 		 835 aa  315  1.9999999999999998e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1010  TonB-dependent receptor  31.21 
 
 		 695 aa  307  4.0000000000000004e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1894  TonB-dependent receptor  32.64 
 
 		 709 aa  306  7e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.123894 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2054  TonB-dependent receptor plug  34.04 
 
 		 714 aa  300  8e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1978  outer membrane protein  31.62 
 
 		 801 aa  296  8e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.103542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1180  TonB-dependent receptor  32.93 
 
 		 705 aa  296  9e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00173216  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2321  TonB-dependent receptor, putative  31.86 
 
 		 709 aa  294  3e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.493897  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0861  TonB-dependent receptor plug  32.69 
 
 		 714 aa  295  3e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113091 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2378  TonB-dependent receptor  33.59 
 
 		 719 aa  294  4e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2102  TonB-dependent receptor plug  33.28 
 
 		 719 aa  293  6e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121164 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0295  TonB-dependent receptor  32.66 
 
 		 797 aa  293  1e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.141972  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4426  TonB-dependent receptor plug  33.08 
 
 		 707 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.831114  normal  0.397066 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5735  TonB-dependent receptor plug  32.78 
 
 		 676 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3729  TonB-dependent receptor, putative  28.92 
 
 		 778 aa  282  1e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000373318  normal  0.721597 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0594  TonB-dependent receptor  32.76 
 
 		 708 aa  282  1e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.601286  hitchhiker  0.00250598 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3051  TonB-dependent receptor  32.3 
 
 		 702 aa  281  3e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.385439 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4869  TonB-dependent receptor  29.61 
 
 		 784 aa  274  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.188313  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4319  TonB-dependent receptor plug  31.91 
 
 		 723 aa  272  2e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.133256  normal  0.357062 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3951  TonB-dependent receptor plug  31.91 
 
 		 731 aa  272  2e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.478156  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4192  TonB-dependent receptor  29.81 
 
 		 784 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0530533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0551  TonB-dependent receptor  31 
 
 		 733 aa  270  5e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.629102  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4046  TonB-dependent receptor  29.53 
 
 		 789 aa  264  4e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.236751 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2266  putative outer membrane hemin/siderophore receptor protein  30.55 
 
 		 774 aa  261  3e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1405  TonB-dependent receptor  29.79 
 
 		 783 aa  257  6e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.148044  normal  0.749639 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0708  TonB-dependent receptor, plug  29.57 
 
 		 744 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3257  TonB-dependent receptor, plug  29.81 
 
 		 782 aa  252  1e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.393029  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2631  TonB-dependent receptor  28.35 
 
 		 799 aa  224  4e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0452445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 759 aa  184  6e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0270  TonB-dependent receptor  24.05 
 
 		 766 aa  173  1e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0176  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 763 aa  154  5e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1314  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 735 aa  145  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2340  TonB-dependent receptor  29.39 
 
 		 836 aa  139  2e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000058543  normal  0.137103 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1938  TonB-dependent receptor  24.75 
 
 		 801 aa  123  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.17436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0859  TonB-dependent receptor plug  39.16 
 
 		 249 aa  121  3e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.152413  normal  0.604475 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1480  TonB-dependent receptor  24.21 
 
 		 776 aa  119  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.329669  normal  0.154283 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4561  TonB-dependent receptor  24.5 
 
 		 824 aa  114  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0251417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2339  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 		 797 aa  114  5e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.608898  normal  0.596694 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0069  iron-regulated outer membrane protein  35.45 
 
 		 868 aa  107  8e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.024885  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1572  TonB-dependent receptor  23.5 
 
 		 780 aa  105  2e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0693034  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3288  TonB-dependent receptor  21 
 
 		 730 aa  99  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2015  TonB-dependent receptor  24.05 
 
 		 732 aa  94.7  5e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4568  TonB-dependent receptor  22.48 
 
 		 776 aa  94.4  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2591  hemin receptor precursor, TonB-dependent outer membrane uptake protein  24.7 
 
 		 687 aa  92.8  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.125278 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000158  TonB-dependent heme and hemoglobin receptor HutA  23.48 
 
 		 693 aa  92  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00497898  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  23.26 
 
 		 698 aa  87.8  6e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3709  outer membrane receptor protein  32.97 
 
 		 776 aa  87.8  7e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0256653 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0519  heme transport protein HutA  21.71 
 
 		 698 aa  86.7  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1266  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 679 aa  85.9  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0152296  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>