More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3288 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3288  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 730 aa  1509    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0176  TonB-dependent receptor  29.59 
 
 		 763 aa  269  1e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  28.49 
 
 		 759 aa  259  1e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7106  TonB-dependent receptor  28.01 
 
 		 818 aa  223  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.385774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4561  TonB-dependent receptor  26.08 
 
 		 824 aa  214  2.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0251417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1314  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 735 aa  208  3e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1366  tonB-linked outer membrane receptor  26.19 
 
 		 811 aa  196  2e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.351505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1572  TonB-dependent receptor  25.72 
 
 		 780 aa  193  1e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0693034  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0204  TonB-dependent receptor  24.73 
 
 		 678 aa  192  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4568  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 		 776 aa  192  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3709  outer membrane receptor protein  26.33 
 
 		 776 aa  183  1e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0256653 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1938  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 801 aa  178  4e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.17436  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08651  hypothetical protein  25.66 
 
 		 799 aa  146  2e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.950762  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4359  TonB-dependent receptor  22.05 
 
 		 682 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503749 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1446  TonB-dependent receptor  21.7 
 
 		 680 aa  114  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.757282 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4275  TonB-dependent receptor  21.63 
 
 		 685 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3383  TonB-dependent receptor, plug  23.57 
 
 		 758 aa  106  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3505  outer membrane insertion C-terminal signal  23.11 
 
 		 758 aa  103  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3051  TonB-dependent receptor  23.99 
 
 		 702 aa  102  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.385439 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3695  outer membrane insertion C-terminal signal  23.11 
 
 		 758 aa  101  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.122908 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3573  TonB-dependent receptor plug  22.97 
 
 		 758 aa  101  6e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54180  hypothetical protein  21 
 
 		 687 aa  99  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4694  TonB-dependent receptor  21.88 
 
 		 685 aa  98.2  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4738  hypothetical protein  20.85 
 
 		 687 aa  97.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122905  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2015  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 		 732 aa  92  3e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0861  TonB-dependent receptor plug  23.6 
 
 		 714 aa  91.7  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113091 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2604  TonB-dependent receptor  25.23 
 
 		 706 aa  89.4  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000145461  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2932  putative iron complex outermembrane recepter protein  23.86 
 
 		 685 aa  88.2  5e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1683  TonB-dependent receptor  29.8 
 
 		 727 aa  86.7  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1894  TonB-dependent receptor  24.54 
 
 		 709 aa  86.3  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.123894 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1083  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 681 aa  84.3  0.000000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.654229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4192  TonB-dependent receptor  47.87 
 
 		 784 aa  83.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0530533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3627  TonB-dependent receptor  21.72 
 
 		 744 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000139063  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0540  TonB-dependent receptor  24.12 
 
 		 699 aa  83.6  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1180  TonB-dependent receptor  22.83 
 
 		 705 aa  84  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00173216  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0745  TonB-dependent receptor, plug  28.47 
 
 		 758 aa  81.3  0.00000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1865  TonB-dependent receptor  30.27 
 
 		 705 aa  80.5  0.00000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3729  TonB-dependent receptor, putative  28.32 
 
 		 778 aa  80.5  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000373318  normal  0.721597 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4046  TonB-dependent receptor  46.81 
 
 		 789 aa  80.5  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.236751 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2340  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 836 aa  80.1  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000058543  normal  0.137103 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3717  TonB-dependent receptor  29.93 
 
 		 702 aa  78.6  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429203  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0159  TonB-dependent receptor  35.19 
 
 		 727 aa  78.2  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.630357  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5735  TonB-dependent receptor plug  22.24 
 
 		 676 aa  78.2  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1842  TonB-dependent receptor  23.97 
 
 		 693 aa  78.2  0.0000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2807  TonB-dependent receptor  27.89 
 
 		 713 aa  78.2  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1978  outer membrane protein  20.64 
 
 		 801 aa  77.8  0.0000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.103542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3257  TonB-dependent receptor, plug  44.44 
 
 		 782 aa  78.2  0.0000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.393029  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4185  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 724 aa  77.8  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.423461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3948  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 		 730 aa  77.8  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32851 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2054  TonB-dependent receptor plug  21.57 
 
 		 714 aa  77.8  0.0000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1214  TonB-dependent receptor  23.76 
 
 		 734 aa  77.4  0.0000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.772889  normal  0.0390037 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4869  TonB-dependent receptor  42.55 
 
 		 784 aa  77.4  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.188313  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0594  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 708 aa  77  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.601286  hitchhiker  0.00250598 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2033  TonB-dependent receptor  24.32 
 
 		 695 aa  76.6  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000947033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2378  TonB-dependent receptor  22.2 
 
 		 719 aa  76.6  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2631  TonB-dependent receptor  41.38 
 
 		 799 aa  76.3  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0452445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0754  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 		 709 aa  76.6  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3927  TonB-dependent receptor  23.83 
 
 		 742 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.889304  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2102  TonB-dependent receptor plug  22 
 
 		 719 aa  76.3  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121164 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5866  TonB-dependent receptor  23.73 
 
 		 694 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.754568 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4439  TonB-dependent receptor  23.73 
 
 		 677 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4331  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 677 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.467615  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13940  TonB-dependent receptor  29.85 
 
 		 682 aa  75.1  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.137662  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3871  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 693 aa  74.7  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.284542 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1524  TonB-dependent receptor  23.44 
 
 		 692 aa  74.7  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.41177 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4200  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.05 
 
 		 614 aa  73.2  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000101627  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4020  TonB-dependent vitamin B12 receptor  25.05 
 
 		 614 aa  73.6  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348064  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4050  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.05 
 
 		 614 aa  73.6  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00780594  decreased coverage  0.000540594 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1111  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  21.76 
 
 		 754 aa  73.6  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.192516 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1902  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 751 aa  73.2  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.357712  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4507  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.05 
 
 		 614 aa  72.8  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000315572  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0708  TonB-dependent receptor, plug  20.7 
 
 		 744 aa  72.8  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5430  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.85 
 
 		 614 aa  72.8  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0043717  normal  0.0207602 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2321  TonB-dependent receptor, putative  34.68 
 
 		 709 aa  72.4  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.493897  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2845  putative TonB-dependent receptor  29.8 
 
 		 715 aa  72.4  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.328029 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4459  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  23.39 
 
 		 614 aa  72  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0519388  hitchhiker  0.0000109547 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4413  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.66 
 
 		 614 aa  72  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000903793  hitchhiker  0.00898611 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0123  TonB-dependent receptor  23.51 
 
 		 719 aa  71.6  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.333478 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1776  TonB-dependent receptor  29.37 
 
 		 681 aa  71.2  0.00000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.506157  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1847  outer membrane hemin receptor  29.37 
 
 		 681 aa  70.9  0.00000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00089  putative outer membrane receptor protein  37.97 
 
 		 87 aa  70.1  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1405  TonB-dependent receptor  39.36 
 
 		 783 aa  70.1  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.148044  normal  0.749639 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4341  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  23.39 
 
 		 614 aa  70.5  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139999  normal  0.582372 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4372  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  23.39 
 
 		 614 aa  70.5  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0258695  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0251  TonB-dependent receptor  32.32 
 
 		 698 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.818078  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2505  TonB-dependent receptor  28.95 
 
 		 698 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.351153  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0939  TonB-dependent receptor  32.32 
 
 		 751 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0527  TonB-dependent receptor  29.82 
 
 		 725 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2644  TonB-dependent receptor  32.32 
 
 		 698 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.700465  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  31.71 
 
 		 698 aa  69.7  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0287  TonB-dependent receptor  32.32 
 
 		 681 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.566628  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1434  TonB-dependent receptor  32.32 
 
 		 681 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1631  TonB-dependent receptor  32.32 
 
 		 751 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.374553  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4462  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  23.39 
 
 		 614 aa  68.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0180001  hitchhiker  0.0000000000824718 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1266  TonB-dependent receptor  21.53 
 
 		 679 aa  69.3  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0152296  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0134  TonB-dependent receptor  26.58 
 
 		 694 aa  68.6  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4536  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  23.21 
 
 		 614 aa  68.6  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.329693  hitchhiker  0.0000000267555 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0551  TonB-dependent receptor  32.06 
 
 		 733 aa  68.6  0.0000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.629102  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2266  putative outer membrane hemin/siderophore receptor protein  38.3 
 
 		 774 aa  68.2  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1804  TonB-dependent receptor  26.73 
 
 		 683 aa  67.8  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0894155  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>