More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3709 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_3709  outer membrane receptor protein  100 
 
 
776 aa  1607    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0256653 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1938  TonB-dependent receptor  41.46 
 
 
801 aa  592  1e-168  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.17436  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4568  TonB-dependent receptor  40.89 
 
 
776 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0204  TonB-dependent receptor  37 
 
 
678 aa  402  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1572  TonB-dependent receptor  35.09 
 
 
780 aa  402  9.999999999999999e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0693034  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08651  hypothetical protein  31.38 
 
 
799 aa  366  1e-100  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.950762  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  27.32 
 
 
759 aa  251  3e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1314  TonB-dependent receptor  28.84 
 
 
735 aa  245  3e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0176  TonB-dependent receptor  28.13 
 
 
763 aa  239  1e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7106  TonB-dependent receptor  26.17 
 
 
818 aa  208  3e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.385774  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1366  tonB-linked outer membrane receptor  26.53 
 
 
811 aa  193  8e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.351505  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4561  TonB-dependent receptor  25.66 
 
 
824 aa  192  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0251417  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3288  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 
730 aa  183  1e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2015  TonB-dependent receptor  24.69 
 
 
732 aa  161  5e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0540  TonB-dependent receptor  22.88 
 
 
699 aa  138  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2321  TonB-dependent receptor, putative  24.72 
 
 
709 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.493897  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0861  TonB-dependent receptor plug  24.79 
 
 
714 aa  117  6e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113091 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0134  TonB-dependent receptor  23.2 
 
 
694 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3051  TonB-dependent receptor  22.56 
 
 
702 aa  109  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.385439 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2932  putative iron complex outermembrane recepter protein  22.58 
 
 
685 aa  108  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4694  TonB-dependent receptor  21.44 
 
 
685 aa  106  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1180  TonB-dependent receptor  24.11 
 
 
705 aa  103  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00173216  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0551  TonB-dependent receptor  22.7 
 
 
733 aa  102  3e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.629102  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2631  TonB-dependent receptor  23.37 
 
 
799 aa  101  6e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0452445  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2510  TonB-dependent receptor  23.7 
 
 
689 aa  100  7e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0311712  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5735  TonB-dependent receptor plug  24.39 
 
 
676 aa  100  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4319  TonB-dependent receptor plug  23.7 
 
 
723 aa  97.8  7e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.133256  normal  0.357062 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3951  TonB-dependent receptor plug  23.7 
 
 
731 aa  97.4  8e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.478156  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1776  TonB-dependent receptor  32.8 
 
 
681 aa  96.7  1e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.506157  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1847  outer membrane hemin receptor  32.8 
 
 
681 aa  96.3  2e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1489  TonB-dependent receptor  21.71 
 
 
689 aa  93.2  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000345981  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4426  TonB-dependent receptor plug  23.76 
 
 
707 aa  91.3  6e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.831114  normal  0.397066 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4488  TonB-dependent receptor  31.05 
 
 
835 aa  89.4  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0159  TonB-dependent receptor  25 
 
 
727 aa  90.1  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.630357  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0123  TonB-dependent receptor  24.51 
 
 
719 aa  89.7  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.333478 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1083  TonB-dependent receptor  24.72 
 
 
681 aa  88.2  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.654229  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1446  TonB-dependent receptor  24.23 
 
 
680 aa  87.8  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.757282 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4738  hypothetical protein  32.97 
 
 
687 aa  87.4  8e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122905  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54180  hypothetical protein  32.97 
 
 
687 aa  87.8  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  26.84 
 
 
698 aa  85.9  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4359  TonB-dependent receptor  23.55 
 
 
682 aa  84.7  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.503749 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4275  TonB-dependent receptor  23.35 
 
 
685 aa  84  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0745  TonB-dependent receptor, plug  28.18 
 
 
758 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3383  TonB-dependent receptor, plug  27.93 
 
 
758 aa  83.2  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3505  outer membrane insertion C-terminal signal  28.18 
 
 
758 aa  82.4  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13940  TonB-dependent receptor  29.18 
 
 
682 aa  82  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.137662  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3695  outer membrane insertion C-terminal signal  27.73 
 
 
758 aa  82  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.122908 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2054  TonB-dependent receptor plug  31.88 
 
 
714 aa  81.3  0.00000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03676  TonB-dependent receptor  28.04 
 
 
821 aa  81.3  0.00000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00269599  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2102  TonB-dependent receptor plug  40.5 
 
 
719 aa  80.1  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00121164 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4331  TonB-dependent receptor  35.34 
 
 
677 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.467615  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3871  TonB-dependent receptor  35.34 
 
 
693 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.284542 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2378  TonB-dependent receptor  40.5 
 
 
719 aa  80.5  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4185  TonB-dependent receptor  31.25 
 
 
724 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.423461  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0754  TonB-dependent receptor  37.01 
 
 
709 aa  79  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3927  TonB-dependent receptor  38.14 
 
 
742 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.889304  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3573  TonB-dependent receptor plug  27.27 
 
 
758 aa  79  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1524  TonB-dependent receptor  38.14 
 
 
692 aa  79  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.41177 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5866  TonB-dependent receptor  38.14 
 
 
694 aa  78.6  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.754568 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4439  TonB-dependent receptor  38.14 
 
 
677 aa  78.6  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1902  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 
751 aa  77.8  0.0000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.357712  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04789  TonB-dependent outer membrane Receptor  40.45 
 
 
600 aa  77.8  0.0000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0342163  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0251  TonB-dependent receptor  31.54 
 
 
698 aa  77  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.818078  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0939  TonB-dependent receptor  31.54 
 
 
751 aa  77  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3729  TonB-dependent receptor, putative  37.5 
 
 
778 aa  77  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000373318  normal  0.721597 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0287  TonB-dependent receptor  31.54 
 
 
681 aa  77.4  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.566628  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0708  TonB-dependent receptor, plug  21.9 
 
 
744 aa  77.4  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1894  TonB-dependent receptor  21.45 
 
 
709 aa  77  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.123894 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2644  TonB-dependent receptor  31.54 
 
 
698 aa  77  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.700465  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1434  TonB-dependent receptor  31.54 
 
 
681 aa  77.4  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1631  TonB-dependent receptor  31.54 
 
 
751 aa  77  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.374553  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2505  TonB-dependent receptor  31.54 
 
 
698 aa  76.6  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.351153  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3627  TonB-dependent receptor  34.38 
 
 
744 aa  75.9  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000139063  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0527  TonB-dependent receptor  37.11 
 
 
725 aa  75.5  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0295  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 
797 aa  74.7  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.141972  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2165  TonB-dependent vitamin B12 receptor  23.65 
 
 
616 aa  73.9  0.000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1214  TonB-dependent receptor  31.03 
 
 
734 aa  73.6  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.772889  normal  0.0390037 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3717  TonB-dependent receptor  31.72 
 
 
702 aa  73.2  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429203  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00089  putative outer membrane receptor protein  43.84 
 
 
87 aa  71.2  0.00000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1405  TonB-dependent receptor  37.5 
 
 
783 aa  70.9  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.148044  normal  0.749639 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2751  TonB-dependent receptor plug  30.24 
 
 
722 aa  70.9  0.00000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.930878  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1683  TonB-dependent receptor  32.31 
 
 
727 aa  69.7  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2604  TonB-dependent receptor  35.71 
 
 
706 aa  70.1  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000145461  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4838  TonB-dependent copper receptor  41.28 
 
 
688 aa  68.2  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.412488 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4716  TonB-dependent copper receptor  41.28 
 
 
688 aa  68.6  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.129936 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1518  TonB-dependent receptor plug  30.05 
 
 
727 aa  67.8  0.0000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4192  TonB-dependent receptor  34.82 
 
 
784 aa  67.8  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0530533  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0638  TonB-dependent copper receptor  34.17 
 
 
753 aa  67.8  0.0000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3257  TonB-dependent receptor, plug  34.82 
 
 
782 aa  67.4  0.0000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.393029  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4630  TonB-dependent copper receptor  41.28 
 
 
688 aa  67  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.102852 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2266  putative outer membrane hemin/siderophore receptor protein  34.82 
 
 
774 aa  67.4  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0596  TonB-dependent copper receptor  37.5 
 
 
710 aa  67  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.834175  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0477  TonB-dependent copper receptor  34.43 
 
 
745 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.157724  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0427  TonB-dependent copper receptor  34.43 
 
 
745 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0821  TonB-dependent copper receptor  33.33 
 
 
749 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05789  hypothetical protein  21.97 
 
 
712 aa  66.2  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2368  TonB-dependent copper receptor  33.33 
 
 
749 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.468955  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1806  TonB-dependent copper receptor  34.43 
 
 
745 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2507  TonB-dependent copper receptor  33.33 
 
 
745 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4894  TonB-dependent copper receptor  40.37 
 
 
688 aa  66.6  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386711  normal  0.630866 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>