More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II0527 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_1083  TonB-dependent receptor  55.69 
 
 		 681 aa  717    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.654229  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1446  TonB-dependent receptor  55.19 
 
 		 680 aa  712    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.757282 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0251  TonB-dependent receptor  93.98 
 
 		 698 aa  1251    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.818078  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0159  TonB-dependent receptor  55.04 
 
 		 727 aa  687    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.630357  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4359  TonB-dependent receptor  56.27 
 
 		 682 aa  712    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503749 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0939  TonB-dependent receptor  93.53 
 
 		 751 aa  1301    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4185  TonB-dependent receptor  76.65 
 
 		 724 aa  1035    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.423461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1631  TonB-dependent receptor  93.39 
 
 		 751 aa  1300    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.374553  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1524  TonB-dependent receptor  77.23 
 
 		 692 aa  1087    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.41177 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4275  TonB-dependent receptor  54.79 
 
 		 685 aa  709    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0527  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 725 aa  1448    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0123  TonB-dependent receptor  54.74 
 
 		 719 aa  686    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.333478 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2505  TonB-dependent receptor  93.84 
 
 		 698 aa  1249    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.351153  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3927  TonB-dependent receptor  74.03 
 
 		 742 aa  1068    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.889304  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4331  TonB-dependent receptor  77.1 
 
 		 677 aa  1068    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.467615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5866  TonB-dependent receptor  76.5 
 
 		 694 aa  1066    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.754568 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3871  TonB-dependent receptor  76.64 
 
 		 693 aa  1070    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.284542 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54180  hypothetical protein  57.27 
 
 		 687 aa  770    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4439  TonB-dependent receptor  76.51 
 
 		 677 aa  1060    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4738  hypothetical protein  57.41 
 
 		 687 aa  771    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122905  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0287  TonB-dependent receptor  93.98 
 
 		 681 aa  1240    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.566628  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2644  TonB-dependent receptor  93.98 
 
 		 698 aa  1251    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.700465  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1434  TonB-dependent receptor  93.98 
 
 		 681 aa  1240    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0134  TonB-dependent receptor  44.52 
 
 		 694 aa  589  1e-167  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2932  putative iron complex outermembrane recepter protein  45.16 
 
 		 685 aa  526  1e-148  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1683  TonB-dependent receptor  42.11 
 
 		 727 aa  502  1e-141  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3717  TonB-dependent receptor  44.83 
 
 		 702 aa  503  1e-141  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429203  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2807  TonB-dependent receptor  44.58 
 
 		 713 aa  489  1e-137  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1189  TonB-dependent receptor  39.14 
 
 		 702 aa  381  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000388358  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3627  TonB-dependent receptor  32.97 
 
 		 744 aa  348  2e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000139063  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2604  TonB-dependent receptor  32.4 
 
 		 706 aa  347  6e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000145461  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0745  TonB-dependent receptor, plug  34.36 
 
 		 758 aa  341  2e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3573  TonB-dependent receptor plug  34.21 
 
 		 758 aa  339  9e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3695  outer membrane insertion C-terminal signal  34.21 
 
 		 758 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.122908 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3505  outer membrane insertion C-terminal signal  34.21 
 
 		 758 aa  337  3.9999999999999995e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3383  TonB-dependent receptor, plug  34.21 
 
 		 758 aa  335  2e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1489  TonB-dependent receptor  33.38 
 
 		 689 aa  325  1e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000345981  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2510  TonB-dependent receptor  33.63 
 
 		 689 aa  322  9.999999999999999e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0311712  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1865  TonB-dependent receptor  34.93 
 
 		 705 aa  316  7e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1214  TonB-dependent receptor  33.6 
 
 		 734 aa  312  1e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.772889  normal  0.0390037 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4426  TonB-dependent receptor plug  34.84 
 
 		 707 aa  306  8.000000000000001e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.831114  normal  0.397066 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1776  TonB-dependent receptor  32.96 
 
 		 681 aa  306  8.000000000000001e-82  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.506157  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1847  outer membrane hemin receptor  32.96 
 
 		 681 aa  306  1.0000000000000001e-81  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2033  TonB-dependent receptor  34.26 
 
 		 695 aa  303  6.000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000947033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4694  TonB-dependent receptor  33.28 
 
 		 685 aa  302  1e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5735  TonB-dependent receptor plug  33.19 
 
 		 676 aa  301  2e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0861  TonB-dependent receptor plug  33.11 
 
 		 714 aa  302  2e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113091 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1842  TonB-dependent receptor  34.21 
 
 		 693 aa  301  3e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4488  TonB-dependent receptor  29.3 
 
 		 835 aa  298  2e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1978  outer membrane protein  29.78 
 
 		 801 aa  295  2e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.103542  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13940  TonB-dependent receptor  31.18 
 
 		 682 aa  295  2e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.137662  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03676  TonB-dependent receptor  30.18 
 
 		 821 aa  295  2e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00269599  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1180  TonB-dependent receptor  34.18 
 
 		 705 aa  293  7e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00173216  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1902  TonB-dependent receptor  30.36 
 
 		 751 aa  290  8e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.357712  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0754  TonB-dependent receptor  33.23 
 
 		 709 aa  286  8e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3948  TonB-dependent receptor  31.68 
 
 		 730 aa  286  9e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32851 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0540  TonB-dependent receptor  33.89 
 
 		 699 aa  284  3.0000000000000004e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4319  TonB-dependent receptor plug  32.89 
 
 		 723 aa  280  9e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.133256  normal  0.357062 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3951  TonB-dependent receptor plug  32.89 
 
 		 731 aa  279  1e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.478156  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3051  TonB-dependent receptor  32.74 
 
 		 702 aa  276  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.385439 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1010  TonB-dependent receptor  30.89 
 
 		 695 aa  273  1e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2321  TonB-dependent receptor, putative  29.53 
 
 		 709 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.493897  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2102  TonB-dependent receptor plug  33.48 
 
 		 719 aa  268  4e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121164 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2378  TonB-dependent receptor  33.48 
 
 		 719 aa  266  1e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2054  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 714 aa  264  4.999999999999999e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04789  TonB-dependent outer membrane Receptor  30.77 
 
 		 600 aa  263  6.999999999999999e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0342163  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4869  TonB-dependent receptor  30.27 
 
 		 784 aa  256  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.188313  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2266  putative outer membrane hemin/siderophore receptor protein  30.65 
 
 		 774 aa  253  7e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4192  TonB-dependent receptor  31.1 
 
 		 784 aa  251  3e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0530533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0708  TonB-dependent receptor, plug  29.25 
 
 		 744 aa  251  3e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1894  TonB-dependent receptor  29.25 
 
 		 709 aa  249  2e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.123894 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3257  TonB-dependent receptor, plug  31.05 
 
 		 782 aa  248  3e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.393029  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3729  TonB-dependent receptor, putative  27.2 
 
 		 778 aa  247  4.9999999999999997e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000373318  normal  0.721597 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1405  TonB-dependent receptor  31.07 
 
 		 783 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.148044  normal  0.749639 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4046  TonB-dependent receptor  30.07 
 
 		 789 aa  244  3e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.236751 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0295  TonB-dependent receptor  29.06 
 
 		 797 aa  243  9e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.141972  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2631  TonB-dependent receptor  29.37 
 
 		 799 aa  243  1e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0452445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0594  TonB-dependent receptor  30.9 
 
 		 708 aa  241  2.9999999999999997e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.601286  hitchhiker  0.00250598 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0551  TonB-dependent receptor  30.19 
 
 		 733 aa  229  2e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.629102  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  26.4 
 
 		 759 aa  169  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0270  TonB-dependent receptor  23.32 
 
 		 766 aa  160  8e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0176  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 763 aa  157  6e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1314  TonB-dependent receptor  23.27 
 
 		 735 aa  129  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0859  TonB-dependent receptor plug  38.92 
 
 		 249 aa  126  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.152413  normal  0.604475 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2340  TonB-dependent receptor  31.85 
 
 		 836 aa  117  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000058543  normal  0.137103 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2015  TonB-dependent receptor  24.14 
 
 		 732 aa  111  5e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4568  TonB-dependent receptor  24.06 
 
 		 776 aa  104  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3709  outer membrane receptor protein  24.14 
 
 		 776 aa  100  7e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0256653 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0069  iron-regulated outer membrane protein  33.33 
 
 		 868 aa  100  1e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.024885  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1105  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor:TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  24.71 
 
 		 859 aa  96.3  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7106  TonB-dependent receptor  23.39 
 
 		 818 aa  93.6  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.385774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0638  TonB-dependent copper receptor  23.91 
 
 		 753 aa  90.9  8e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2368  TonB-dependent copper receptor  23.64 
 
 		 749 aa  87.8  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.468955  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0821  TonB-dependent copper receptor  23.64 
 
 		 749 aa  87.8  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2507  TonB-dependent copper receptor  23.64 
 
 		 745 aa  87.4  8e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  25.15 
 
 		 702 aa  86.7  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0427  TonB-dependent copper receptor  23.64 
 
 		 745 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1806  TonB-dependent copper receptor  23.64 
 
 		 745 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5070  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  24.73 
 
 		 762 aa  86.3  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.565094  normal  0.157746 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0477  TonB-dependent copper receptor  23.64 
 
 		 745 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.157724  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>